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使用外泌体生物标志物诊断肺癌的制作方法

2023-10-27 10:54:40 来源:中国专利 TAG:

技术特征:
1.一种获得受试者中肺癌的存在的指示的方法,所述方法包括以下步骤:(a)确定从所述受试者获得的生物样品中选自由pld3多肽、mage4a多肽、gage2d多肽、mtap多肽和uchl1多肽组成的组的一种或多种生物标志物的存在或水平,其中所述生物样品包含从中获得的外泌体和/或多肽,其中所述生物样品中一种或多种所述生物标志物的存在或水平指示所述受试者中存在肺癌。2.如权利要求1所述的方法,其中所述肺癌是早期肺癌(优选i期、ii期或iii期),其中步骤(a)包括:确定从所述受试者获得的生物样品中选自由pld3多肽、mtap多肽和/或uchl1多肽组成的组的一种或多种生物标志物的存在或水平,其中所述生物样品包含从中获得的外泌体和/或多肽,以及其中所述生物样品中pld3多肽、mtap多肽和/或uchl1多肽的存在指示所述受试者中存在早期肺癌(优选i期、ii期或iii期)。3.如权利要求1所述的方法,其中所述肺癌是转移性肺病,其中步骤(a)包括:确定从所述受试者获得的生物样品中选自由mage4a多肽和gage2d多肽组成的组的一种或多种生物标志物的存在或水平,其中所述生物样品包含从中获得的外泌体和/或多肽,以及其中所述生物样品中mage4a多肽和/或gage2d多肽的存在指示所述受试者中存在转移性肺病。4.一种区分受试者早期肺癌(优选i期、ii期或iii期)和转移性肺病或确定受试者肺癌分期的方法,所述方法包括以下步骤:(a)确定从所述受试者获得的生物样品中选自由pld3多肽、mage4a多肽、gage2d多肽、mtap多肽和uchl1多肽组成的组的一种或多种生物标志物的存在或水平,其中所述生物样品包含从中获得的外泌体和/或多肽,其中所述生物样品中pld3多肽、mtap多肽和/或uchl1多肽的存在指示所述受试者中存在早期肺癌,以及所述生物样品中mage4a多肽和/或gage2d多肽的存在指示所述受试者中存在转移性肺病。5.一种获得受试者肺癌预后的指示的方法,所述方法包括以下步骤:a)在第一时间点确定从所述受试者获得的生物样品中一种或多种生物标志物的存在或水平;b)在第二(稍后)时间点确定从所述受试者获得的(相同类型)生物样品中一种或多种相同生物标志物的存在或水平;其中所述生物标志物选自由pld3多肽、mage4a多肽、gage2d多肽、mtap多肽和uchl1多肽组成的组,其中所述生物样品均包含从中获得的外泌体和/或多肽,其中与第一生物样品中相应的生物标志物水平相比,第二生物样品中一种或多种所述生物标志物水平的增加指示所述受试者的预后不良,以及
其中与第一生物样品中相应的生物标志物水平相比,第二生物样品中一种或多种所述生物标志物水平的降低指示所述受试者预后的改善。6.一种将受试者分类为肺癌亚组的方法,所述方法包括以下步骤:(a)确定从所述受试者获得的生物样品中选自由pld3多肽、mage4a多肽、gage2d多肽、mtap多肽和uchl1多肽组成的组的一种或多种生物标志物的存在或水平,其中所述生物样品包含从中获得的外泌体和/或多肽;以及(b)根据所述生物样品中一种或多种所述生物标志物的存在或水平,将所述受试者分类为肺癌亚组。7.如权利要求6所述的方法,其中所述肺癌亚组是基于所述癌症的转移阶段的亚组。8.一种获得用于治疗受试者肺癌的药物的功效的指示的方法,所述方法包括以下步骤:a)在第一时间点确定从所述受试者获得的生物样品中一种或多种生物标志物的存在或水平;b)在第二(稍后)时间点确定从所述受试者获得的(相同类型)生物样品中一种或多种相同生物标志物的存在或水平,其中所述生物标志物选自由pld3多肽、mage4a多肽、gage2d多肽、mtap多肽和uchl1多肽组成的组,其中所述生物样品均包含从中获得的外泌体和/或多肽,其中在第一时间点和第二时间点之间的间隔内给所述受试者施用了药物,其中与第一生物样品中相应的生物标志物水平相比,第二生物样品中一种或多种所述生物标志物水平的增加指示药物缺乏功效,以及其中与第一生物样品中相应的生物标志物水平相比,第二生物样品中一种或多种所述生物标志物水平的降低指示药物具有功效。9.一种治疗受试者肺癌的方法,所述方法包括以下步骤:(a)通过如权利要求1所述的方法获得受试者中肺癌的存在的指示;以及(b)如果获得所述受试者中肺癌的存在的指示,则对所述受试者施用适合于治疗肺癌的治疗,从而治疗所述受试者中的肺癌。10.一种治疗受试者肺癌的方法,所述方法包括以下步骤:(a)通过如权利要求2或3所述的方法获得受试者中肺癌的阶段的指示;以及(b)如果获得所述受试者中肺癌的存在的指示,则对所述受试者施用适合于治疗肺癌的阶段的治疗,从而治疗所述受试者中的肺癌。11.一种获得受试者中肺癌的存在的指示的方法,所述方法包括以下步骤:(a)将从所述受试者获得的生物样品固定在固体载体上的检测区;和(b)将所述固体载体(优选所述检测区)与一种或多种第一特异性结合伴侣接触,其中每种第一特异性结合伴侣独立地特异性结合选自由pld3多肽、mage4a多肽、gage2d多肽、mtap多肽和uchl1多肽组成的组的生物标志物,并且其中每种第一特异性结合伴侣与可检测标签连接;以及(c)检测所述检测区中存在或不存在结合标签,其中所述检测区中结合标签的存在指示所述受试者中存在肺癌。
12.如权利要求11所述的方法,其中所述检测区中pld3、mtap和/或uchl1的标记特异性结合伴侣的存在指示所述受试者中存在早期肺癌,并且mage4a和/或gage2d的标记特异性结合伴侣的存在指示所述受试者中存在转移性肺病。13.一种获得受试者中肺癌的存在的指示的方法,所述方法包括以下步骤:(a)将从所述受试者获得的生物样品与固体载体接触,其中所述固体载体包括检测区,所述检测区包括针对选自由pld3多肽、mage4a多肽、gage2d多肽、mtap多肽和uchl1多肽组成的组的一种或多种生物标志物的一种或多种(例如1、2、3、4或5种)固定的特异性结合伴侣;以及(b)检测所述检测区中存在或不存在结合的特异性结合伴侣,其中所述检测区中结合的特异性结合伴侣的存在指示所述受试者中存在肺癌。14.一种固定一种或多种(例如1、2、3、4或5种)第一特异性结合伴侣的固体载体,其中每种第一特异性结合伴侣特异性结合选自由pld3多肽、mage4a多肽、gage2d多肽、mtap多肽和uchl1多肽组成的组的生物标志物。15.一种获得受试者中肺癌的存在的指示的方法,所述方法包括以下步骤:(a)将包括缀合区和检测区的横向流动装置、垂直流动装置或微流体装置与从所述受试者获得的生物样品接触,其中(i)所述缀合区包含一种或多种第一特异性结合伴侣,其中每种第一特异性结合伴侣特异性结合选自由pld3多肽、mage4a多肽、gage2d多肽、mtap多肽和uchl1多肽组成的组的生物标志物,其中每种第一特异性结合伴侣与可检测的标签结合,并且其中所述第一特异性结合伴侣不固定在所述缀合区中;以及(ii)将所述生物样品施加到所述检测区,以及(b)检测所述检测区中结合标签的存在或不存在,其中所述检测区中结合标签的存在指示所述受试者中存在肺癌。16.一种包括缀合区和检测区的横向流动装置、垂直流动装置或微流体装置,其中(i)所述缀合区包含一种或多种第一特异性结合伴侣,其中每种第一特异性结合伴侣特异性结合选自由pld3多肽、mage4a多肽、gage2d多肽、mtap多肽和uchl1多肽组成的组的生物标志物,其中每种第一特异性结合伴侣结合到可检测的标签上,并且其中所述第一特异性结合伴侣未固定在所述缀合区中;以及(ii)所述检测区适于接收生物样品。17.一种获得受试者中肺癌的存在的指示的方法,所述方法包括以下步骤:(a)将包括缀合区和检测区的横向流动装置、垂直流动装置或微流体装置与从所述受试者获得的生物样品接触,其中(i)所述缀合区包含一种或多种第一特异性结合伴侣,其中每种第一特异性结合伴侣与可检测的标签结合,其中所述第一特异性结合伴侣未固定在所述缀合区中;以及(ii)所述检测区包含一种或多种第二特异性结合伴侣,其中每种第二特异性结合伴侣固定在所述检测区中,其中,所述第一特异性结合伴侣和/或所述第二特异性结合伴侣各自特异性结合选自由pld3多肽、mage4a多肽、gage2d多肽、mtap多肽和uchl1多肽组成的组的生物标志物,并且
其中不特异性结合所述生物标志物之一的第一特异性结合伴侣或第二特异性结合伴侣结合存在于外泌体中的配体;以及(b)检测所述检测区中存在或不存在结合标签,其中所述检测区中结合标签的存在指示所述受试者中存在肺癌。18.如权利要求13、15或17中任一项所述的方法,其中所述检测区中pld3、mtap和/或uchl1的结合特异性结合伴侣的存在指示所述受试者中存在早期肺癌,并且mage4a和/或gage2d的结合特异性结合伴侣的存在指示所述受试者中存在转移性肺病。19.一种包括缀合区和检测区的横向流动装置、垂直流动装置或微流体装置,其中(a)所述缀合区包含一种或多种第一特异性结合伴侣,其中每种第一特异性结合伴侣与可检测的标签连接,并且其中所述第一特异性结合伴侣未固定在所述缀合区中;以及(b)所述检测区包含一种或多种第二特异性结合伴侣,其中所述第二特异性结合伴侣固定在所述检测区中,其特征在于,所述第一特异性结合伴侣和/或所述第二特异性结合伴侣各自特异性结合选自由pld3多肽、mage4a多肽、gage2d多肽、mtap多肽和uchl1多肽组成的组的生物标志物。20.如前述权利要求中任一项所述的方法、装置或载体,其中所述生物标志物的组由pld3多肽、mage4a多肽、gage2d多肽、mtap多肽和uchl1多肽中的1种、2种、3种、4种或5种组成,优选由上述生物标志物中的2种或3种组成。21.如前述权利要求中任一项所述的方法、装置或载体,其中所述生物标志物的组由以下组成:(i)pld3;(ii)mtap;或(iii)pld3和mtap。22.如权利要求15-21中任一项所述的方法或装置,其中所述装置另外包括尺寸排阻区,所述尺寸排阻区使得外泌体基于其尺寸从所述生物样品中分离。23.如权利要求15-22中任一项所述的方法或装置,其中所述装置另外包括泵,以使得转移流体流动通过所述装置。24.如权利要求1-13或15-23中任一项所述的方法或装置,其中所述生物样品是来自所述受试者的体液或液体活检。25.如权利要求24所述的方法或装置,其中所述生物样品是所述受试者的血液、唾液、支气管灌洗液或尿液的样品,优选受试者的血清或血浆的样品。26.如权利要求1-13或15-25中任一项所述的方法或装置,其中所述生物样品是从所述受试者(优选从所述受试者的血液)获得的分离和/或纯化的外泌体的样品。27.如权利要求1-13或15-26中任一项所述的方法或装置,其中所述生物样品为以下样品:(i)从来自所述受试者的外泌体(优选来自所述受试者的血液的外泌体)获得的膜结合多肽;或(ii)已经从来自所述受试者的外泌体(优选来自所述受试者的血液的外泌体)的表面
切割或释放的多肽。

技术总结
本发明涉及受试者肺癌的诊断。本发明提供了一种基于存在于外泌体中或表面上或为从液体活检或其他生物样品中获得的切割的外泌体表面多肽的一种或多种生物标志物的存在,以获得受试者中肺癌的存在的指示的诊断方法。本发明还提供了可以用于受试者肺癌诊断的装置,例如流动装置和微流体装置。如流动装置和微流体装置。如流动装置和微流体装置。


技术研发人员:D
受保护的技术使用者:泰拉索姆有限责任公司
技术研发日:2022.03.07
技术公布日:2023/10/26
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