一种残膜回收机防缠绕挑膜装置的制 一种秧草收获机用电力驱动行走机构

一种叶斑菌病原菌LAMP检测引物、试剂盒及LAMP快速检测方法

2022-05-17 20:23:49 来源:中国专利 TAG:

技术特征:
1.一种叶斑病病原菌的lamp检测引物,其特征在于:所述引物包括正向外引物f3、反向外引物b3、正向内引物fip和反向内引物bip,所述引物系列如下:f3:5
’‑
accagtgcggtggtatcg-3’;b3:5
’‑
caagagcgcctgtcactc-3’;fip:5
’‑
ggatcgatgggaagaagggcgcaagcgaaccatcgagaagt-3’;bip:5
’‑
catacgacgactcgacaagcgcccaccacccaaaaaaacgac-3’。2.一种叶斑病病原菌的lamp检测试剂盒,其特征在于,包括权利要求1所述的引物。3.根据权利要求2所述的叶斑病病原菌的lamp检测试剂盒,其特征在于:试剂盒还包括dntps、bst dna聚合酶、10
×
isothermal amplificationbuffer和mgso4。4.一种包含权利要求1所述引物的叶斑病病原菌的lamp检测反应体系,其特征在于:反应体系包括:10um的fip和bip引物各4μl,10um f3和b3引物各0.5μl,10mm dntps 2.5μl,8u/μl bst dna聚合酶1μl,50mm mgso44μl,10
×
isothermal amplificationbuffer 2.5μl,用灭菌超纯水补平至25μl。5.一种基于权利要求4所述反应体系的叶斑病病原菌的lamp检测方法,其特征在于,包括以下步骤:s1:获取叶斑病病原菌的ef-1α基因保守区利用primer explore v5在线设计引物;s2:制备25μl的权利要求4中的检测反应体系;s3:将待测样品总dna于s2所述的检测反应体系中进行lamp扩增,反应结束后,取反应产物;s4:将反应产物用琼脂糖凝胶电泳检测;或/和用sybr greeni染料观察lamp反应液变化;s5:lamp反应产物在琼脂糖凝胶电泳出现连续呈弥散状条带为阳性,存在叶斑菌病原菌;和/或反应液呈现翠绿色为阳性,存在叶斑病病原菌,淡橙色为阴性,不存在叶斑病病原菌。6.根据权利要求5所述的lamp检测方法,其特征在于,所述反应体系中的反应条件为:温度为60℃、反应时间为60min。7.根据权利要求5所述的lamp检测方法,其特征在于,所述s1中获取叶斑病病原菌的操作步骤如下:步骤一:剪取罹病叶片病健交界部分的组织进行消毒,再用无菌水漂洗,用无菌滤纸吸干水分后将其放置于含有链霉素的pda平板上,26℃黑暗培养;步骤二:将长出的菌落转接至pda培养基,通过单孢分离进行纯化后用pda斜面保存于4℃备用,得到分离纯化的菌株。8.根据权利要求7所述的lamp检测方法,其特征在于,还包括对叶斑病病原菌的鉴定,包括以下步骤:sa:将分离纯化的菌株接种于pda培养基中培养出菌丝,然后提取真菌dna;sb:通过引物its4/its5和ef1-728f/ef1-986r扩增核糖体转录间区和翻译延长因子基因部分序列;sc:构建pcr反应体系,该pcr反应体系为2
×
es taq master mix25μl、总dna模板2μl、
10μm上下游引物各2μl、ddh2o 19μl,扩展反应取反应产物;sd:反应产物经琼脂糖凝胶电泳检测后,进行序列测定,获序列在ncbi数据库进行blastn比对分析,利用mega6软件中邻接法构建系统发育树。9.根据权利要求8所述的lamp检测方法,其特征在于,pcr反应条件94℃预变性5min;94℃变性30s,56℃退火30s,72℃延伸1min,共35个循环;最后72℃延伸10min,4℃保存。10.根据权利要求2所述的试剂盒在植物叶斑菌病原菌鉴定中的应用,所述植物为黄花菜。

技术总结
本发明提供一种叶斑病病原菌的LAMP检测引物,涉及植物病原菌检测的技术领域,所述引物包括正向外引物F3、反向外引物B3、正向内引物FIP和反向内引物BIP,所述引物系列如下:F3:5


技术研发人员:朱俊子 钟杰 李晓刚 马雅敏
受保护的技术使用者:湖南农业大学
技术研发日:2022.03.18
技术公布日:2022/5/16
再多了解一些

本文用于企业家、创业者技术爱好者查询,结果仅供参考。

发表评论 共有条评论
用户名: 密码:
验证码: 匿名发表

相关文献