亨廷顿(HTT)iRNA药剂组合物及其使用方法与流程

技术特征：
1.一种用于抑制亨廷顿(htt)表达的双链核糖核酸(dsrna)药剂，其中所述dsrna药剂包含形成双链区的有义链和反义链，其中所述有义链包含与seq id no:1的核苷酸序列相差不超过3个核苷酸的至少15个连续核苷酸，并且所述反义链包含与seq id no:6的核苷酸序列相差不超过3个核苷酸的至少15个连续核苷酸，以及其中一个或多个亲脂部分与所述有义链或所述反义链中至少一条上的一个或多个内部位置缀合。2.根据权利要求1所述的dsrna药剂，其中所述有义链的核苷酸序列包含表2、3、5、6、8、9、11、12、14、15、17、18、20、21、24、25、27-30、32或33任一项中的有义链核苷酸序列的任一种。3.根据权利要求1或2所述的dsrna药剂，其中所述亲脂部分通过接头或载体缀合。4.一种用于抑制细胞中亨廷顿(htt)表达的双链核糖核酸(dsrna)，其中所述dsrna包含形成双链区的有义链和反义链，其中所述反义链包含对于编码htt的mrna的互补区，和其中所述互补区包含与表2、3、5、6、8、9、11、12、14、15、17、18、20、21、24、25、27-30、32或33任一项中的反义核苷酸序列的任一种相差不超过3个核苷酸的至少15个连续核苷酸。5.根据权利要求4所述的dsrna药剂，其中所述有义链、所述反义链、或所述有义链和所述反义链两者与一个或多个亲脂部分缀合。6.根据权利要求5所述的dsrna药剂，其中所述亲脂部分与所述dsrna药剂的双链区中的一个或多个内部位置缀合。7.根据权利要求5或6所述的dsrna药剂，其中所述一个或多个亲脂部分与所述反义链上的一个或多个内部位置缀合。8.根据权利要求5或6所述的dsrna药剂，其中所述一个或多个亲脂部分通过接头或载体与至少一条链上的一个或多个内部位置缀合。9.根据权利要求1-3和5-8中任一项所述的dsrna药剂，其中通过logkow测量的所述亲脂部分的亲脂性超过0。10.根据权利要求1-3和5-9中任一项所述的dsrna药剂，其中通过所述dsrna药剂的血浆蛋白结合测定中的未结合部分测量的，所述dsrna药剂的疏水性超过0.2。11.根据权利要求10所述的dsrna药剂，其中所述血浆蛋白结合测定是使用人血清白蛋白的电泳迁移率变动测定。12.根据权利要求1-3和7-11中任一项所述的dsrna药剂，其中所述内部位置包括除了所述有义链或所述反义链的每一末端的末端两个位置之外的所有位置。13.根据权利要求12所述的dsrna药剂，其中所述内部位置包括除了所述有义链或所述反义链的每一末端的末端三个位置之外的所有位置。14.根据权利要求1-3和5-13中任一项所述的dsrna药剂，其中所述内部位置不包括所述有义链的切割位点区域。15.根据权利要求14所述的dsrna药剂，其中所述内部位置包括除了从所述有义链的5’端开始计数的位置9-12之外的所有位置。16.根据权利要求14所述的dsrna药剂，其中所述内部位置包括除了从所述有义链的3’端开始计数的位置11-13之外的所有位置。
17.根据权利要求1-3和5-13中任一项所述的dsrna药剂，其中所述内部位置不包括所述反义链的切割位点区域。18.根据权利要求17所述的dsrna药剂，其中所述内部位置包括除了从所述反义链的5’端开始计数的位置12-14之外的所有位置。19.根据权利要求1-3和5-18中任一项所述的dsrna药剂，其中所述内部位置包括除了所述有义链上从3’端开始计数的位置11-13和所述反义链上从5’端开始计数的位置12-14之外的所有位置。20.根据权利要求1-3和5-19中任一项所述的dsrna药剂，其中所述一个或多个亲脂部分与从每条链的5’端开始计数，选自所述有义链上的位置4-8和13-18以及所述反义链上的位置6-10和15-18的一个或多个内部位置缀合。21.根据权利要求20所述的dsrna药剂，其中所述一个或多个亲脂部分与从每条链的5’端开始计数，选自所述有义链上的位置5、6、7、15和17以及所述反义链上的位置15和17的一个或多个内部位置缀合。22.根据权利要求6所述的dsrna药剂，其中所述双链区中的位置不包括所述有义链的切割位点区域。23.根据权利要求1-3和5-22中任一项所述的dsrna药剂，其中所述有义链的长度为21个核苷酸，所述反义链的长度为23个核苷酸，并且所述亲脂部分与所述有义链的位置20、位置15、位置1、位置7、位置6或位置2或所述反义链的位置16缀合。24.根据权利要求5-22中任一项所述的dsrna药剂，其中所述有义链的长度为21个核苷酸，所述反义链的长度为23个核苷酸，并且所述亲脂部分与所述有义链的位置21、位置20、位置15、位置1、位置7、位置6或位置2或所述反义链的位置16缀合。25.根据权利要求1-3和5-24中任一项所述的dsrna药剂，其中所述亲脂部分是脂肪族、脂环族或多脂环族化合物。26.根据权利要求25所述的dsrna药剂，其中所述亲脂部分选自脂质、胆固醇、视黄酸、胆酸、金刚烷乙酸、1-芘丁酸、二氢睾酮、1,3-双-o(十六烷基)甘油、香叶氧基己醇、十六烷基甘油、冰片、薄荷醇、1,3-丙二醇、十七烷基、棕榈酸、肉豆蔻酸、(o3)-(油酰基)石胆酸、o3-(油酰基)胆酸、二甲氧三苯甲基或吩恶嗪。27.根据权利要求26所述的dsrna药剂，其中所述亲脂部分包含饱和或不饱和c4-c30烃链以及选自羟基、胺、羧酸、磺酸酯、磷酸酯、硫醇、叠氮化物和炔烃的任选官能团。28.根据权利要求27所述的dsrna药剂，其中所述亲脂部分包含饱和或不饱和c6-c18烃链。29.根据权利要求28所述的dsrna药剂，其中所述亲脂部分包含饱和或不饱和c16烃链。30.根据权利要求29所述的dsrna药剂，其中所述饱和或不饱和c16烃链与从所述链的5’端开始计数的位置6缀合。31.根据权利要求1-3和5-30中任一项所述的dsrna药剂，其中所述亲脂部分通过替换所述内部位置或所述双链区中的一个或多个核苷酸的载体缀合。32.根据权利要求31所述的dsrna药剂，其中所述载体是选自吡咯烷基、吡唑啉基、吡唑烷基、咪唑啉基、咪唑烷基、哌啶基、哌嗪基、[1,3]二氧戊环基、噁唑烷基、异噁唑烷基、吗啉基、噻唑烷基、异噻唑烷基、喹喔啉基、哒嗪酮基、四氢呋喃基、十氢萘基的环状基团；或者是
基于丝氨醇骨架或二乙醇胺骨架的非环部分。33.根据权利要求1-3和5-32中任一项所述的dsrna药剂，其中所述亲脂部分通过包含醚、硫醚、脲、碳酸酯、胺、酰胺、马来酰亚胺-硫醚、二硫醚、磷酸二酯、磺酰胺键、点击反应的产物或氨基甲酸酯的接头与所述dsrna药剂缀合。34.根据权利要求1-3和5-33中任一项所述的双链irna药剂，其中所述亲脂部分与核碱基、糖部分或核苷间键缀合。35.根据权利要求1-34中任一项所述的dsrna药剂，其中所述dsrna药剂包含至少一个修饰的核苷酸。36.根据权利要求35所述的dsrna药剂，其中不超过五个所述有义链核苷酸和不超过五个所述反义链核苷酸是未修饰的核苷酸。37.根据权利要求35所述的dsrna药剂，其中所述有义链的所有核苷酸和所述反义链的所有核苷酸是修饰的核苷酸。38.根据权利要求35-37中任一项所述的dsrna药剂，其中至少一个所述修饰的核苷酸选自脱氧核苷酸、3
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末端脱氧胸腺嘧啶(dt)核苷酸、2
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o-甲基修饰核苷酸、2
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氟修饰核苷酸、2
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脱氧修饰核苷酸、锁核苷酸、非锁核苷酸、构象受限核苷酸、受限乙基核苷酸、无碱基核苷酸、2
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氨基修饰核苷酸、2
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o-烯丙基修饰核苷酸、2
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c-烷基修饰的核苷酸、2
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羟基修饰核苷酸、2
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甲氧基乙基修饰核苷酸、2
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o-烷基修饰核苷酸、吗啉代核苷酸、氨基磷酸酯、包含非天然碱基的核苷酸、四氢吡喃修饰核苷酸、1,5-脱水己糖醇修饰核苷酸、环己烯基修饰核苷酸、包含5
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硫代磷酸酯基团的核苷酸、包含5
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甲基膦酸酯基团的核苷酸、包含5’磷酸或5’磷酸模拟物的核苷酸、包含膦酸乙烯酯的核苷酸、包含腺苷-二醇核酸(gna)的核苷酸、包含胸苷-二醇核酸(gna)s-异构体的核苷酸、包含2-羟甲基-四氢呋喃基-5-磷酸的核苷酸、包含2
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脱氧胸苷-3’磷酸的核苷酸、包含2
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脱氧鸟苷-3
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磷酸的核苷酸、和与胆固醇衍生物连接的末端核苷酸、十二烷酸双癸酰胺基团；胞苷-2'-磷酸、鸟苷-2
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磷酸、尿苷-2
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磷酸、腺苷-2
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磷酸、2
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o-十六烷基-腺苷-3
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磷酸、2
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o-十六烷基-胞苷-3
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磷酸、2
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o-十六烷基-鸟苷-3
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磷酸和2
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o-十六烷基尿苷-3
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磷酸及其组合。39.根据权利要求38所述的dsrna药剂，其中所述修饰的核苷酸选自2
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脱氧-2
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氟修饰核苷酸、2
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脱氧修饰核苷酸、3
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末端脱氧胸腺嘧啶核苷酸(dt)、锁核苷酸、无碱基核苷酸、2
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氨基修饰核苷酸、2
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烷基修饰核苷酸、吗啉代核苷酸、氨基磷酸酯和包含非天然碱基的核苷酸。40.根据权利要求38所述的dsrna，其中至少一个所述修饰的核苷酸选自脱氧核苷酸、2
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o-甲基修饰核苷酸、2
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氟修饰核苷酸、2
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脱氧修饰核苷酸、二醇修饰核苷酸(gna)和乙烯基膦酸酯核苷酸，及其组合。41.根据权利要求38所述的dsrna，其中所述核苷酸上的至少一个修饰是热不稳定的核苷酸修饰。42.根据权利要求41所述的dsrna，其中所述热不稳定的核苷酸修饰选自无碱基修饰；与所述双链体中的相反核苷酸的错配；和去稳定糖修饰、2
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脱氧修饰、无环核苷酸、非锁核酸(una)和甘油核酸(gna)。43.根据权利要求38所述的dsrna药剂，其中所述修饰的核苷酸包含3’末端脱氧胸腺嘧啶核苷酸(dt)的短序列。
44.根据权利要求38所述的dsrna药剂，其中所述核苷酸上的修饰是2
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o-甲基、gna和2’氟修饰。45.根据权利要求1-44中任一项所述的dsrna药剂，其进一步包含至少一个硫代磷酸酯核苷酸间键。46.根据权利要求45所述的dsrna药剂，其中所述dsrna药剂包含6-8个硫代磷酸酯核苷酸间键。47.根据权利要求1-45中任一项所述的dsrna药剂，其中每条链的长度不超过30个核苷酸。48.根据权利要求1-47中任一项所述的dsrna药剂，其中至少一条链包含至少一个核苷酸的3’突出端。49.根据权利要求1-47中任一项所述的dsrna药剂，其中至少一条链包含至少2个核苷酸的3’突出端。50.根据权利要求1-49中任一项所述的dsrna药剂，其中所述双链区的长度为15-30个核苷酸对。51.根据权利要求50所述的dsrna药剂，其中所述双链区的长度为17-23个核苷酸对。52.根据权利要求50所述的dsrna药剂，其中所述双链区的长度为17-25个核苷酸对。53.根据权利要求50所述的dsrna药剂，其中所述双链区的长度为23-27个核苷酸对。54.根据权利要求50所述的dsrna药剂，其中所述双链区的长度为19-21个核苷酸对。55.根据权利要求50所述的dsrna药剂，其中所述双链区的长度为21-23个核苷酸对。56.根据权利要求1-55中任一项所述的dsrna药剂，其中每条链具有19-30个核苷酸。57.根据权利要求1-55中任一项所述的dsrna药剂，其中每条链具有19-23个核苷酸。58.根据权利要求1-55中任一项所述的dsrna药剂，其中每条链具有21-23个核苷酸。59.根据权利要求1-58中任一项所述的dsrna药剂，其进一步包含靶向肝组织的靶向配体。60.根据权利要求59所述的dsrna药剂，其中所述靶向配体是galnac缀合物。61.根据权利要求1-3和5-60中任一项所述的dsrna药剂，其中所述亲脂部分或靶向配体通过选自dna，rna，二硫化物，酰胺，半乳糖胺、葡糖胺、葡萄糖、半乳糖、甘露糖的官能化单糖或寡糖，及其组合的生物可裂解接头缀合。62.根据权利要求1-3和5-61中任一项所述的dsrna药剂，其中所述有义链的3’端通过封端保护，所述封端是具有胺的环状基团，所述环状基团选自吡咯烷基、吡唑啉基、吡唑烷基、咪唑啉基、咪唑烷基、哌啶基、哌嗪基、[1,3]二氧戊环基、噁唑烷基、异噁唑烷基、吗啉基、噻唑烷基、异噻唑烷基、喹喔啉基、哒嗪酮基、四氢呋喃基和十氢萘基。63.根据权利要求1-62中任一项所述的dsrna药剂，其进一步包含在所述反义链的3’端的第一个核苷酸间键处发生的末端手性修饰，其具有sp构型的连接磷原子，在所述反义链的5’端的第一个核苷酸间键处发生的末端手性修饰，其具有rp构型的连接磷原子，和在所述有义链的5’端的第一个核苷酸间键处发生的末端手性修饰，其具有rp构型或sp构型的连接磷原子。
64.根据权利要求1-62中任一项所述的dsrna药剂，其进一步包含在所述反义链的3’端的第一个和第二个核苷酸间键处发生的末端手性修饰，其具有sp构型的连接磷原子，在所述反义链的5’端的第一个核苷酸间键处发生的末端手性修饰，其具有rp构型的连接磷原子，和在所述有义链的5’端的第一个核苷酸间键处发生的末端手性修饰，其具有rp构型或sp构型的连接磷原子。65.根据权利要求1-62中任一项所述的dsrna药剂，其进一步包含在所述反义链的3’端的第一个、第二个和第三个核苷酸间键处发生的末端手性修饰，其具有sp构型的连接磷原子，在所述反义链的5’端的第一个核苷酸间键处发生的末端手性修饰，其具有rp构型的连接磷原子，和在所述有义链的5’端的第一个核苷酸间键处发生的末端手性修饰，其具有rp构型或sp构型的连接磷原子。66.根据权利要求1-62中任一项所述的dsrna药剂，其进一步包含在所述反义链的3’端的第一个和第二个核苷酸间键处发生的末端手性修饰，其具有sp构型的连接磷原子，在所述反义链的3’端的第三个核苷酸间键处发生的末端手性修饰，其具有rp构型的连接磷原子，在所述反义链的5’端的第一个核苷酸间键处发生的末端手性修饰，其具有rp构型的连接磷原子，和在所述有义链的5’端的第一个核苷酸间键处发生的末端手性修饰，其具有rp构型或sp构型的连接磷原子。67.根据权利要求1-62中任一项所述的dsrna药剂，其进一步包含：在所述反义链的3’端的第一个和第二个核苷酸间键处发生的末端手性修饰，其具有sp构型的连接磷原子，在所述反义链的5’端的第一个和第二个核苷酸间键处发生的末端手性修饰，其具有rp构型的连接磷原子，和在所述有义链的5’端的第一个核苷酸间键处发生的末端手性修饰，其具有rp构型或sp构型的连接磷原子。68.根据权利要求1-67中任一项所述的dsrna药剂，其进一步包含所述反义链的5’端的磷酸酯或磷酸酯模拟物。69.根据权利要求68所述的dsrna药剂，其中所述磷酸酯模拟物是5
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乙烯基膦酸酯(vp)。70.根据权利要求1-69中任一项所述的dsrna药剂，其中所述反义链的5’端的1位处的碱基对是au碱基对。71.根据权利要求1-70中任一项所述的dsrna药剂，其中所述有义链具有总共21个核苷酸和所述反义链具有总共23个核苷酸。72.一种包含根据权利要求1-71中任一项所述的dsrna药剂的细胞。
73.一种用于抑制编码htt的基因表达的药物组合物，其包含根据权利要求1-71中任一项所述的dsrna药剂。74.一种药物组合物，其包含根据权利要求1-71中任一项所述的dsrna药剂和脂质制剂。75.一种抑制细胞中亨廷顿(htt)基因表达的方法，所述方法包括：(a)使所述细胞与根据权利要求1-71中任一项所述的dsrna药剂、或根据权利要求73或74所述的药物组合物接触；和(b)将步骤(a)中产生的细胞维持足够时间以获得所述htt基因的mrna转录物的降解，从而抑制所述细胞中所述htt基因的表达。76.根据权利要求75所述的方法，其中所述细胞在受试者内。77.根据权利要求76所述的方法，其中所述受试者是人。78.根据权利要求75-77中任一项所述的方法，其中所述htt的表达被抑制至少50％。79.根据权利要求77所述的方法，其中所述受试者已被诊断患有htt相关疾病。80.根据权利要求79所述的方法，其中所述核苷酸重复扩增疾病是亨廷顿氏病。81.一种治疗被诊断患有htt相关疾病的受试者的方法，所述方法包括向所述受试者施用治疗有效量的根据权利要求1-71中任一项所述的dsrna药剂，或根据权利要求73或74所述的药物组合物，从而治疗所述受试者。82.根据权利要求81所述的方法，其中治疗包括改善所述疾病的至少一种体征或症状。83.根据权利要求81所述的方法，其中治疗包括预防所述疾病的进展。84.根据权利要求81所述的方法，其中所述htt相关疾病是亨廷顿氏病。85.根据权利要求81-84中任一项所述的方法，其中所述dsrna药剂以约0.01mg/kg至约50mg/kg的剂量施用于所述受试者。86.根据权利要求81-85中任一项所述的方法，其中所述dsrna药剂鞘内施用于所述受试者。87.根据权利要求81-86中任一项所述的方法，其进一步包括测量从所述受试者获得的样品中的htt水平。88.根据权利要求81-87中任一项所述的方法，其进一步包括向所述受试者施用适用于治疗或预防htt相关疾病的另外的药剂。

技术总结
本公开涉及靶向亨廷顿(HTT)基因(例如HTT基因的外显子1)的双链核糖核酸(dsRNAi)药剂和组合物，以及抑制HTT基因表达的方法和使用此类dsRNAi药剂和组合物治疗患有HTT相关疾病或病症(例如亨廷顿氏病)的受试者的方法。或病症(例如亨廷顿氏病)的受试者的方法。


技术研发人员：M
受保护的技术使用者：阿尔尼拉姆医药品有限公司
技术研发日：2020.10.29
技术公布日：2022/7/10