一种基于“靶点-药物加权积分制”构建脓毒症疾病关键靶点与药物筛选方法
- 国知局
- 2024-10-21 15:14:22
本发明涉及生物,具体涉及一种基于“靶点-药物加权积分制”构建脓毒症疾病关键靶点与药物筛选方法。
背景技术:
1、脓毒症是一种常见的临床危急重疾病,被定义为严重炎症感染导致两个以上器官功能损伤的机体免疫失调状态。全球每年约1900万人发生脓毒症,死亡率高达30%,如果伴发有脓毒症休克,死亡率高达80%。即使目前有ecmo支持治疗,脓毒症的预后没有明显改善,其重要原因在于免疫调控失衡,关键靶点不清楚。中国传统中医药经过几千年的临床经验积累,优势在于通过对机体“扶正祛邪”而进行免疫调控。然而,传统中医药为复方,具有多靶点、机制不清楚等问题。
2、为此,本发明旨在提供一种基于“靶点-药物加权积分制”构建脓毒症疾病关键靶点与药物筛选方法,快速筛选脓毒症关键靶点与相应的化合物,以解决上述问题。
技术实现思路
1、本发明的目的是为了解决上述问题,提供了一种基于“靶点-药物加权积分制”构建脓毒症疾病关键靶点与药物筛选方法,为未来脓毒症药物的研发提供研究线索。
2、为了达到上述目的,本发明的技术方案如下:
3、一种基于“靶点-药物加权积分制”构建脓毒症疾病关键靶点与药物筛选方法,包括如下步骤:
4、s1、获取脓毒症基因测序数据,根据关键基因与预后关系区分出好的基因与坏的基因,并根据关键基因与预后生存分析贡献度进行赋分a值,其中好的基因为正值、坏的基因为负值;
5、s2、利用传统治疗脓毒症的经方成分结合小分子单体预筛后处理免疫细胞并进行测序,根据测序结果把下游靶基因改变的差异倍数作为b值,上调为正值、下调为负值;
6、s3、然后进行积分排序筛选出潜在的关键靶点与药物;
7、所述好的基因为具有保护性的基因,所述坏的基因为具有致病性的基因。
8、进一步,所述保护性的基因的定义为高表达生存率高的基因;所述致病性的基因的定义为高表达死亡率高的基因。
9、进一步,所述贡献度a值计算公式为:
10、a=-l og10(p)/fc
11、其中,p值为贡献度参数,fc为28天生存/死亡预后的差异倍数。
12、进一步,所述p值是通过利用临床测序大数据与28天生存/死亡预后关系,进行生存曲线分析获得。
13、进一步,所述28天生存/死亡预后的差异倍数fc是通过提取脓毒症死亡组与生存组测序数据进行meta分析获得。
14、进一步,所述b值是通过各种中药单体或者人工智能大数据计算的备选药物通过处理免疫细胞后数小时收集细胞进行测序,根据测序结果获得。
15、进一步,所述积分排序筛选是对不同药物单体积分统计分析脓毒症疾病不同靶点与药物处理后的靶点情况进行排序筛选。
16、进一步,所述药物单体积分统计的公式为:
17、∑单体药物=a1×b1+a2×b2+a3×b3……;
18、当∑药物单体总值>0时,提示药物对脓毒症具有治疗作用,∑药物单体总值越大提示药物越具有保护作用;
19、当∑药物单体总值<0时,提示药物对脓毒症具有有害作用;∑药物单体总值越小提示药物越具有有害作用。
20、需要说明的是,研究者在使用大量药物单体库筛选时,通过对∑药物单体从高到低排序即可筛选潜在的脓毒症治疗药物。
21、与现有技术相比,本发明方案具备以下有益效果:
22、本发明提供的一种基于“靶点-药物加权积分制”构建脓毒症疾病关键靶点与药物筛选方法,能够快速筛选脓毒症关键靶点与相应的化合物,从能够解决传统中医药为复方,具有多靶点、机制不清楚等问题。
技术特征:1.一种基于“靶点-药物加权积分制”构建脓毒症疾病关键靶点与药物筛选方法,其特征在于,包括如下步骤:
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述保护性的基因的定义为高表达生存率高的基因;所述致病性的基因的定义为高表达死亡率高的基因。
3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述贡献度a值计算公式为:
4.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,所述p值是通过利用临床测序大数据与28天生存/死亡预后关系,进行生存曲线分析获得。
5.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,所述28天生存/死亡预后的差异倍数fc是通过提取脓毒症死亡组与生存组测序数据进行meta分析获得。
6.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述b值是通过各种中药单体或者人工智能大数据计算的备选药物通过处理免疫细胞后数小时收集细胞进行测序,根据测序结果获得。
7.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述积分排序筛选是对不同药物单体积分统计分析脓毒症疾病不同靶点与药物处理后的靶点情况进行排序筛选。
8.根据权利要求7所述的方法,其特征在于,所述药物单体积分统计的公式为:
技术总结本发明公开了一种基于“靶点‑药物加权积分制”构建脓毒症疾病关键靶点与药物筛选方法,涉及生物技术领域,其技术要点为:该方法,包括如下步骤:S1、获取脓毒症基因测序数据,根据关键基因与预后关系区分出好的基因与坏的基因,并根据关键基因与预后生存分析贡献度进行赋分A值,其中好的基因为正值、坏的基因为负值;S2、利用中国传统治疗脓毒症的经方成分结合小分子单体预筛后处理免疫细胞并进行测序,根据测序结果把下游靶基因改变的差异倍数作为B值,上调为正值、下调为负值;S3、然后进行积分排序筛选出潜在的关键靶点与药物;本发明能够快速筛选脓毒症关键靶点与相应的化合物,从而解决传统中医药为复方,具有多靶点、机制不清楚等问题。技术研发人员:胡迎春,陈睦虎,张千受保护的技术使用者:西南医科大学附属医院技术研发日:技术公布日:2024/10/17本文地址:https://www.jishuxx.com/zhuanli/20241021/320979.html
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