与苹果树分枝角度相关基因关联的分子标记及其应用

技术特征：
1.indel分子标记在鉴定、区分和/或预测苹果分枝角度中的应用；所述indel分子标记位于苹果基因组7号染色体的mdtac1a基因的启动子上，序列为gagaga。2.如权利要求1所述的应用，其特征在于，所述鉴定、区分和/或预测苹果分枝角度的标准为：如果存在gagaga序列或出现370bp条带，所述苹果分枝角度＜30
°
，或30
°
≤所述苹果分枝角度＜60
°
；如果缺失gagaga序列或出现364bp条带，所述苹果分枝角度≥60
°
。3.扩增如权利要求1或2所述应用中的所述indel分子标记的引物组。4.如权利要求3所述的引物组，其特征在于，包括：(i)、正向引物，具有如seq id no.2所示的核苷酸序列；和/或(ii)、反向引物，具有如或seq id no.3所示的核苷酸序列；和/或(iii)、具有如(i)或(ii)所示的核苷酸序列经取代、缺失或添加一个或多个碱基获得的核苷酸序列，且与(i)或(ii)所示的核苷酸序列功能相同或相似；和/或(iv)、具有与如(i)～(iii)任意所示的核苷酸序列至少有80％同源性的核苷酸序列；所述多个为2个～10个。5.试剂盒，其特征在于，包括如权利要求3或4所述的引物组以及可接受的辅料和/或助剂。6.如权利要求3或4所述的引物组或如权利要求5所述的试剂盒在鉴定、区分和/或预测苹果分枝角度和/或选择育种中的应用。7.鉴定、区分和/或预测苹果分枝角度的方法，其特征在于，所述鉴定、区分和/或预测苹果分枝角度的标准为：如果存在gagaga序列或出现370bp条带，所述苹果分枝角度＜30
°
，或30
°
≤所述苹果分枝角度＜60
°
；如果缺失gagaga序列或出现364bp条带，所述苹果分枝角度≥60
°
。8.如权利要求7所述的方法，其特征在于，包括如下步骤：步骤(a)、引物设计：设计并筛选，得到引物组；步骤(b)、dna提取：提取待检测苹果总dna；步骤(c)、pcr扩增：以步骤(b)获得的所述苹果总dna为模板，采用步骤(a)所述的引物组进行pcr扩增，获得pcr产物；步骤(d)、电泳图谱分析：对所述pcr产物进行电泳，根据条带大小及位置关系确定所属基因型。9.如权利要求8所述的方法，其特征在于，步骤(c)中所述引物组中任一引物的浓度均不小于10μmol/l；步骤(c)中所述pcr扩增的反应体系包括100ng/μl苹果总dna 2μl、正向引物1μl、反向引物1μl、2
×
green taq mix 10μl、ddh2o 6μl；反应程序为：
10.选择育种的方法，其特征在于，使用如权利要求7～9任一项所述的方法对苹果进行选择育种。

技术总结
本发明涉及分子遗传育种技术领域，特别涉及与苹果树分枝角度相关基因关联的分子标记及其应用。本发明在苹果7号染色体的基因的上游启动子区域中，筛选到一个InDel位点，该位点在苹果分枝角度小(≤30


技术研发人员：朱元娣 李永洲 王利敏 胡恩月 赵芫
受保护的技术使用者：中国农业大学
技术研发日：2022.01.19
技术公布日：2022/4/12