一种年龄相关性黄斑变性风险筛查试剂盒和系统

本发明属于疾病风险筛查，具体涉及一种年龄相关性黄斑变性风险筛查试剂盒和系统。

背景技术：

1、年龄相关性黄斑变性(amd)又称为老年性黄斑变性，是黄斑区结构的病理性衰老改变。在整个视网膜中黄斑部结构与功能最为特殊，是视力最为敏锐的地方。早期，由于视网膜色素上皮细胞(rpe)对视细胞外节盘膜吞噬清除能力下降，结果使未被完全消化清除的视细胞外节盘膜的残余小体潴留于基底部细胞浆中，并向细胞外排出积于bruch膜，从而形成玻璃膜疣。而黄斑部的此种改变更最为明显，玻璃膜疣也可见于视力正常的老年人。但在疾病的中后期，病理改变不断加重后，引起bruch膜断裂，脉络膜毛细血管通过破裂的bruch膜进入rpe下或视网膜神经上皮下，形成脉络膜新生血管(cnv)，这也是对视力影响的最直接因素。由于新生血管管壁的结构异常，常发生血管的渗漏和出血，进而导致黄斑部出血、水肿等引发一系列的改变，加重视力的下降甚至是突然视力大幅下降。

2、amd大多发生于50岁以上，其患病率随年龄增长而提高，是老年人致盲的重要原因。患者常常有眼前固定黑影、视力缓慢或者突然下降、视物变形等症状。amd的早期诊断或风险筛查对于及时治疗有着重要的意义，能够有效降低患者致盲的风险。中国发明专利申请“cn110088838a-评估年龄相关性黄斑变性发病风险的生物计算机分析方法”提供了一种通过基因多态性检测和个体参数测试amd风险的方法。该方法用于提前对受试者的amd风险进行预测。然而，其预测准确性仍然不足，对其所采用的指标进行进一步的优化仍然是本领域亟需解决的问题。

技术实现思路

1、针对现有技术的问题，本发明提供新的用于对年龄相关性黄斑变性风险进行筛查的系列指标，这些指标的纳入能够有效提高amd风险筛查的准确性。

2、一种年龄相关性黄斑变性风险筛查试剂盒，它包括检测如下基因位点中的一个或多个的试剂：

3、arms2或htra1基因的rs10490924位点、cfb基因的rs541862位点、cfh基因的rs800292位点、timp3基因的rs57852281位点、cetp基因的rs3764261位点、vegfa基因的rs4711751位点、apoe基因的rs769449位点、col4a3基因的rs73088289位点、notch4基因的rs12525893位点、lipc基因的rs1800588位点、abca1基因的rs7044657位点、cfi基因的rs11732475位点。

4、优选的，所述试剂为pcr检测试剂。

5、优选的，所述试剂是用于检测血液样品的试剂。

6、本发明还提供检测如下基因位点中的一个或多个的试剂在制备年龄相关性黄斑变性风险筛查试剂盒中的用途：

7、arms2或htra1基因的rs10490924位点、cfb基因的rs541862位点、cfh基因的rs800292位点、timp3基因的rs57852281位点、cetp基因的rs3764261位点、vegfa基因的rs4711751位点、apoe基因的rs769449位点、col4a3基因的rs73088289位点、notch4基因的rs12525893位点、lipc基因的rs1800588位点、abca1基因的rs7044657位点、cfi基因的rs11732475位点。

8、优选的，所述试剂为pcr检测试剂。

9、优选的，所述试剂是用于检测血液样品的试剂。

10、本发明还提供一种年龄相关性黄斑变性风险筛查系统，它包括：

11、1)检测如下基因位点中的一个或多个的第一检测装置：

12、arms2或htra1基因的rs10490924位点、cfb基因的rs541862位点、cfh基因的rs800292位点、timp3基因的rs57852281位点、cetp基因的rs3764261位点、vegfa基因的rs4711751位点、apoe基因的rs769449位点、col4a3基因的rs73088289位点、notch4基因的rs12525893位点、lipc基因的rs1800588位点、abca1基因的rs7044657位点、cfi基因的rs11732475位点；

13、2)检测如下生化指标中的一个或两个的第二检测装置：

14、vitamin d3或血红蛋白；

15、3)输入如下指标中的一个或多个的输入装置：

16、是否抽烟、bmi、是否患有阿尔茨海默病及其严重程度、年龄、性别、是否摄入抗氧化药物；

17、4)年龄相关性黄斑变性风险计算装置：

18、用于根据所述第一检测装置的检测结果、所述第二检测装置的检测结果和所述输入装置的输入计算受试者患有年龄相关性黄斑变性的风险。

19、优选的，所述年龄相关性黄斑变性风险计算装置按照如下方法计算受试者患有年龄相关性黄斑变性的风险：

20、步骤1，根据所述第一检测装置的检测结果对每一个基因位点的基因型进行风险评分；根据所述第二检测装置的检测结果对每一个生化指标的检测结果进行风险评分；根据所述输入装置的输入对每一个输入的指标进行风险评分；

21、步骤2，将步骤1得到的所有风险评分进行求和，得到总风险评分；

22、步骤3，根据所述总风险评分和预设的风险阈值得到受试者患有年龄相关性黄斑变性的风险。

23、优选的，步骤1中，根据如下表格中观察值和风险评分的对应关系进行打分，得到基因位点、生化指标或输入的指标的风险评分：

24、

25、

26、步骤3中，所述预设的风险阈值为：<26.86分表示低风险，26.86～40.59分表示中高风险，>40.59分表示高风险。

27、本发明还提供一种计算机可读存储介质，其上存储有计算机程序，所述计算机程序用于实现上述年龄相关性黄斑变性风险筛查系统。

28、本发明中，htra1基因在genbank数据库中的gene id为5654；

29、arms2基因在genbank数据库中的gene id为387715；

30、cfb基因在genbank数据库中的gene id为gene id:629；

31、cfh基因在genbank数据库中的gene id为gene id:3075；

32、timp3基因在genbank数据库中的gene id为gene id:7078；

33、cetp基因在genbank数据库中的gene id为gene id:1071；

34、vegfa基因在genbank数据库中的gene id为gene id:7422；

35、apoe基因在genbank数据库中的gene id为gene id:348；

36、col4a3基因在genbank数据库中的gene id为gene id:1285；

37、notch4基因在genbank数据库中的gene id为gene id:4855；

38、lipc基因在genbank数据库中的gene id为gene id:3990；

39、abca1基因在genbank数据库中的gene id为gene id:19；

40、cfi基因在genbank数据库中的gene id为gene id:3426。

41、其中，“arms2或htra1基因的rs10490924位点”的含义是指rs10490924位点，由于rs10490924位点涉及arms2和htra1两个基因，因此表示为“arms2或htra1基因的rs10490924位点”。

42、本发明提供了12个可用于对amd进行风险筛查的基因多态性位点、2个可用于对amd进行风险筛查的生化指标和6个可用于对amd进行风险筛查的的个人信息类指标。将这些指标联合使用，可提高amd风险筛查的准确性，具有很好的应用前景。

43、显然，根据本发明的上述内容，按照本领域的普通技术知识和惯用手段，在不脱离本发明上述基本技术思想前提下，还可以做出其它多种形式的修改、替换或变更。

44、以下通过实施例形式的具体实施方式，对本发明的上述内容再作进一步的详细说明。但不应将此理解为本发明上述主题的范围仅限于以下的实例。凡基于本发明上述内容所实现的技术均属于本发明的范围。