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川贝母和平贝母的检测区分方法、装置及终端设备

  • 国知局
  • 2024-08-05 12:19:57

本申请属于核酸检测,尤其涉及一种川贝母和平贝母的检测区分方法、装置及终端设备。

背景技术:

1、随着中医药产业的蓬勃发展,消费者对中药材的需求量逐步增加。而川贝母和平贝母作为常用的中药材存在以次充好的现象,普通消费者很难通过外部形态对二者进行鉴别,因此亟需寻求一种简便快捷的检测方法以快速区分川贝母和平贝母。

技术实现思路

1、本申请目的在于提供一种川贝母和平贝母的检测区分方法、装置及终端设备,能够实现简便快捷地区分川贝母和平贝母。

2、本申请实施例的第一方面提供了一种川贝母和平贝母的检测区分方法,其特征在于,所述检测区分方法包括:

3、根据cas蛋白对应的pam序列,在所述川贝母和平贝母的特异dna片段中筛选得到至少一对向导序列;

4、根据每对向导序列和所述cas蛋白对应的蛋白锚定序列,生成每对向导序列对应的crrna;

5、根据每对crrna对所述川贝母和平贝母的特异dna片段的检测对比度,筛选出其中的一对crrna;

6、根据所述crrna、所述cas蛋白以及待测样本,结合测试探针,生成测试结果,区分所述待测样本内的川贝母和平贝母。

7、在可选的实施例中,所述根据每对向导序列和所述cas蛋白对应的蛋白锚定序列,生成每对向导序列对应的crrna,包括:

8、根据每对向导序列和所述cas蛋白对应的蛋白锚定序列,生成每对向导序列对应的crdna;

9、根据所述每对向导序列对应的crdna,生成对应的crrna。

10、在可选的实施例中,所述根据所述每对向导序列对应的crdna,生成对应的crrna,包括:

11、将一对向导序列对应的crdna、启动子、rna聚合酶、ntp溶液以及转录反应缓冲液混合,得到预混物;

12、将所述预混物置于第一预设反应条件下,反应生成所述向导序列对应的crrna;

13、重复上述操作,直至得到每对向导序列对应的crrna。

14、在可选的实施例中,所述检测对比度包括荧光对比度,对应的,所述根据每对crrna对所述川贝母和平贝母的特异dna片段的检测对比度,筛选出其中的一对crrna,包括:

15、测试得到每对crrna对所述川贝母和平贝母的特异dna片段的荧光对比度;

16、将所述荧光对比度按照数值由大到小进行排列;

17、选择排名第一的荧光对比度对应的crrna。

18、在可选的实施例中,所述根据所述crrna、所述cas蛋白以及待测样本,结合测试探针,生成测试结果,区分所述待测样本内的川贝母和平贝母,包括:

19、对待测样本的dna片段进行扩增,得到扩增产物:

20、根据所述crrna、所述cas蛋白以及所述扩增产物,结合测试探针,生成测试结果,区分所述待测样本内的川贝母和平贝母。

21、在可选的实施例中,所述测试探针包括荧光探针和电化学探针中的一种。

22、本申请实施例的第二方面提供了一种川贝母和平贝母的检测区分装置,所述检测区分装置包括:

23、选择模块,用于根据cas蛋白对应的pam序列,在所述川贝母和平贝母的特异dna片段中筛选得到至少一对向导序列;

24、生成模块,用于根据每对向导序列和所述cas蛋白对应的蛋白锚定序列,生成每对向导序列对应的crrna;

25、筛选模块,用于根据每对crrna对所述川贝母和平贝母的特异dna片段的检测对比度,筛选出其中的一对crrna;

26、测试模块,用于根据所述crrna、所述cas蛋白以及待测样本,结合测试探针,生成测试结果,区分所述待测样本内的川贝母和平贝母。

27、本申请实施例的第二方面提供了一种川贝母和平贝母的检测试剂盒,所述检测试剂盒包括:

28、第一检测模块,所述第一检测模块包括第一crrna、cas蛋白以及测试探针,所述第一crrna的序列为:

29、5’-accaauuucuacuaaguguagauggccgagggcacgccugccuggg-3’;

30、第二检测模块,所述第二检测模块包括第二crrna、cas蛋白以及测试探针,所述第二crrna的序列为:

31、5’-accaauuucuacuaaguguagaugguugagggcacgccugccuggg-3’。

32、本申请实施例的第四方面提供了一种终端设备,包括存储器、处理器以及存储在所述存储器中并可在所述处理器上运行的计算机程序,所述处理器执行所述计算机程序时实现上述第一方面所述的方法。

33、本申请实施例的第五方面提供了一种计算机可读存储介质,所述计算机可读存储介质存储有计算机程序,所述计算机程序被处理器执行时实现上述第一方面所述的方法。

34、本申请实施例的第六方面提供了一种计算机程序产品,当所述计算机程序产品在终端设备上运行时,使得所述终端设备执行上述第一方面所述的方法。

35、本申请有益效果

36、本申请提供的川贝母和平贝母的检测区分方法、装置及终端设备,利用川贝母和平贝母的特异dna片段,结合cas蛋白对应的pam序列和蛋白锚定序列,设计得到多对crrna,再根据每对crrna对所述川贝母和平贝母的特异dna片段的检测对比度,筛选出其中检测对比度最高并且区分效果最明显的一对crrna,后续利用该对crrna结合cas蛋白、测试探针和待测样本形成检测体系,该crrna能够根据碱基互补原则识别待测样本内川贝母和平贝母的特异dna片段,在识别成功后,cas蛋白的反式切割功能被激活,会对测试探针进行切割,从而形成可视化的检测反应,由此能够实现简便快捷地区分待测样本内的川贝母和平贝母。

技术特征:

1.一种川贝母和平贝母的检测区分方法,其特征在于,所述检测区分方法包括:

2.根据权利要求1所述的检测区分方法,其特征在于,所述根据每对向导序列和所述cas蛋白对应的蛋白锚定序列,生成每对向导序列对应的crrna,包括:

3.根据权利要求2所述的检测区分方法,其特征在于,所述根据所述每对向导序列对应的crdna,生成对应的crrna,包括:

4.根据权利要求1所述的检测区分方法,其特征在于,所述检测对比度包括荧光对比度,对应的,所述根据每对crrna对所述川贝母和平贝母的特异dna片段的检测对比度,筛选出其中的一对crrna,包括:

5.根据权利要求1所述的检测区分方法,其特征在于,所述根据所述crrna、所述cas蛋白以及待测样本,结合测试探针,生成测试结果,区分所述待测样本内的川贝母和平贝母,包括:

6.根据权利要求1所述的检测区分方法,其特征在于,所述测试探针包括荧光探针和电化学探针中的一种。

7.一种川贝母和平贝母的检测区分装置,其特征在于,所述检测区分装置包括:

8.一种川贝母和平贝母的检测试剂盒,其特征在于,所述检测试剂盒包括:

9.一种终端设备,包括存储器、处理器以及存储在所述存储器中并可在所述处理器上运行的计算机程序,其特征在于,所述处理器执行所述计算机程序时实现如权利要求1至6任一项所述的方法。

10.一种计算机可读存储介质,所述计算机可读存储介质存储有计算机程序,其特征在于,所述计算机程序被处理器执行时实现如权利要求1至6任一项所述的方法。

技术总结本申请适用于核酸检测技术领域,提供了一种川贝母和平贝母的检测区分方法、装置及终端设备,所述检测区分方法包括:根据Cas蛋白对应的PAM序列,在所述川贝母和平贝母的特异DNA片段中筛选得到至少一对向导序列;根据每对向导序列和所述Cas蛋白对应的蛋白锚定序列,生成每对向导序列对应的crRNA;根据每对crRNA对所述川贝母和平贝母的特异DNA片段的检测对比度,筛选出其中一对crRNA;根据所述crRNA、所述Cas蛋白以及待测样本,结合测试探针,生成测试结果,区分所述待测样本内的川贝母和平贝母。通过上述方案,能够实现简便快捷地区分川贝母和平贝母。技术研发人员:马文哲,杨彦超,杨冬璠,林婉君,石美娜,黄紫烽,张雪宁,邹薇,郎松平,刘贝佳受保护的技术使用者:澳门科技大学技术研发日:技术公布日:2024/8/1

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