一种黑山羊多胎性状分子标记及其应用

本发明涉及分子生物学和分子育种，特别涉及一种黑山羊多胎性状分子标记及其应用。

背景技术：

1、山羊的产羔性状，即每胎产羔数，是山羊繁殖率的重要因素，繁殖率的高低直接影响山羊的经济效益。产羔数作为羊繁殖力高低的重要指标，其对养羊业的贡献可达80％以上。因此，培育一胎多羔是提高山羊经济效益的一个重要手段。山羊的繁殖性状受遗传、受多胎性、受胎率和成活率三个因素的影响，其中以多胎性的变量最大。多胎性主要受遗传因素的影响，遗传机制复杂，是目前育种工作者紧迫而艰巨的任务。

2、目前关于山羊的多胎基因分子标记位点并未明确，不同品种，不同研究环境对研究结果存在很大的差异。随着分子生物学和分子遗传学的发展，分子标记辅助选择育种已成为畜禽育种新的技术手段，分子标记辅助选择育种是将现代分子生物学与传统育种相结合的育种方法，通过影响选择的时间、强度以及准确性而极大提高低遗传力性状的选择效果。分子标记辅助选择不易受环境因素的影响，且没有性别、年龄的限制，可早期进行选择，因而能够缩短世代间隔，提高选择强度，进而提高选择效率和准确性。本发明利用黑山羊基因通过分子标记与产羔数的关联性分析结合表型选择，最大限度提高海南黑山羊的繁殖性能，将有力推动和加速优质海南黑山羊多胎品系选育的进程。

技术实现思路

1、针对现有技术的上述缺陷，本发明提出一种黑山羊多胎性状分子标记及其应用，以解决上述背景技术提出的问题。

2、为达到上述目的，本发明提供如下技术方案：

3、一种黑山羊多胎性状的snp分子标记，含有所述分子标记的核苷酸序列如seq idno：1所示，其中第2730位核苷酸为c或t。

4、优选地，一种用于检测黑山羊多胎性状的snp分子标记的引物对，所述引物对的核苷酸序列如下所示：

5、a)上游引物f：5’-cagcctgtttaacatgactc-3’(seq id no：2)；

6、b)下游引物r：5’-cacaggatggtctcggcact-3’(seq id no：3)。

7、优选地，一种试剂盒，包含一种用于检测黑山羊多胎性状的snp分子标记的引物对。

8、优选地，snp分子标记，或引物对，或试剂盒在鉴定和/或培育多胎黑山羊品种中的应用。

9、优选地，本发明的方法和试剂盒可与其他分子生物学品种培育方法或传统品种培育方法联合使用，筛选出的种羊可用于自然交配和人工授精的品种培育方法。

10、优选地，所述黑山羊品种包括但不限于海南黑山羊、浏阳黑山羊、贵州黑山羊、建昌黑山羊、麻城黑山羊、渝东黑山羊、莱芜黑山羊、白玉黑山羊、吕梁黑山羊、川南黑山羊和沂蒙黑山羊；所述黑山羊品种优选为海南黑山羊。

11、优选地，一种黑山羊多胎性状的检测方法，包括检测snp分子标记，检测方法为测序和/或pcr或snp位点的筛选和分型。

12、优选地，所述检测方法包括利用seq id no：2和seq id no：3所示的引物对扩增目的片段的步骤。

13、优选地，一种黑山羊育种改良的方法，包括确定黑山羊snp分子标记c2730t的单核酸种类和选择基因型为tt或ct的个体作为种羊进行繁殖，从而提高黑山羊后代的繁殖能力。

14、优选地，所述检测包括利用seq id no：2和seq id no：3所示的引物对扩增目的片段的步骤。

技术特征：

1.一种黑山羊多胎性状的snp分子标记，其特征在于，含有所述分子标记的核苷酸序列如seq id no：1所示，其中第2730位核苷酸为c或t。

2.一种用于检测权利要求1所述的黑山羊多胎性状的snp分子标记的引物对，其特征在于，所述引物对的核苷酸序列如下所示：

3.一种试剂盒，其特征在于，包含权利要求2所述的引物对。

4.根据权利要求1所述的snp分子标记，或权利要求2所述的引物对，或权利要求3所述的试剂盒在鉴定和/或培育多胎黑山羊品种中的应用。

5.根据权利要求4所述的应用，其特征在于，所述黑山羊品种选自海南黑山羊、浏阳黑山羊、贵州黑山羊、建昌黑山羊、麻城黑山羊、渝东黑山羊、莱芜黑山羊、白玉黑山羊、吕梁黑山羊、川南黑山羊和沂蒙黑山羊。

6.根据权利要求5所述的应用，其特征在于，黑山羊品种优选为海南黑山羊。

7.一种黑山羊多胎性状的检测方法，其特征在于，包括检测如权利要求1所述的snp分子标记，检测方法为测序和/或pcr或snp位点的筛选和分型。

8.根据权利要求7所述的检测方法，其特征在于，所述检测方法包括利用seq id no：2和seq id no：3所示的引物对扩增目的片段的步骤。

9.一种黑山羊育种改良的方法，其特征在于，包括检测如权利要求1所述的snp分子标记和选择基因型为tt或ct的个体作为种羊进行繁殖的步骤。

10.根据权利要求9所述的方法，其特征在于，所述检测包括利用seq id no：2和seq idno：3所示的引物对扩增目的片段的步骤。

技术总结本发明公开了一种黑山羊多胎性状分子标记及其应用，涉及分子生物学和分子育种技术领域。本发明提供了海南黑山羊基因上与多胎性状相关的SNP分子标记，所述分子标记为基因第2730位的多态性位点，记作C2730T，其检测方法以及该方法在提高海南黑山羊产羔性能以及多胎品系培育中应用，且该位点作为黑山羊繁殖和生产性能辅助选择的分子标记并应用于遗传改良提供了重要的理论依据并具有良好的应用前景。经统计分析可知，分子标记C2730T与多胎性状显著相关，且等位基因T具有明显的加性效应。因此，在繁殖培育黑山羊的过程中可以通过该SNP分子标记辅助选择繁殖力高的CT型或TT型个体，从而加速绵羊繁殖性能的育种进程。技术研发人员：管凇,武洪志,彭维祺受保护的技术使用者：中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所技术研发日：技术公布日：2024/8/27