一种针对淋巴亚群细胞的自动圈门方法及系统与流程

本发明涉及医疗，特别涉及一种针对淋巴亚群细胞的自动圈门方法及系统。

背景技术：

1、流式细胞术的基本用途之一是识别由细胞表面或细胞内标记物的密度所定义的表型的不同细胞亚群。理想情况下，这种生物分类应该是客观的、稳定的和具有预测性的。但是在分析多维单细胞数据时，传统手动圈门的操作使得很难达到这些要求。门是一个区域，定义在两个测量值的双轴图中，用于选择具有所需表型的细胞进行下游分析。手动圈门是高度主观的，并依赖于研究者对实验的知识和解释。但是这并没有采用标准化的统计推断。

技术实现思路

1、基于此，本申请实施例提供了一种针对淋巴亚群细胞的自动圈门方法及系统，能够解决对淋巴亚群细胞进行手动圈门主观性强，精度较低的问题。

2、第一方面，提供了一种针对淋巴亚群细胞的自动圈门方法，该方法包括：

3、s1，获取淋巴亚群细胞样本数据集，在数据集中选择随机起始点作为种子点；

4、s2，以当前种子点为中心并构建网格，统计网格内的粒子数；

5、s3，遍历所有种子点，根据各种子点构建网格内的粒子数对种子点进行标记；其中，具体标记为噪声点或聚类点；

6、s4，遍历完所有种子点后，将具有相同标记的种子点作为当前聚类结果；

7、s5，进行淋巴亚群细胞样本数据集区域判断，根据判断结果调整所构建的网格大小并重新执行s1-s4，直至达到预设条件输出最终聚类结果。

8、可选地，s1，获取淋巴亚群细胞样本数据集，在数据集中选择随机起始点作为种子点，包括：

9、淋巴亚群细胞样本数据集通过流式细胞仪测量得到，数据集中包含细胞的特征信息，所述特征信息具体包括细胞大小、形状、荧光标记强度。

10、可选地，s3，遍历所有种子点，根据各种子点构建网格内的粒子数对种子点进行标记，包括：

11、以当前种子点为中心，在指定的邻域半径内，粒子数达到或超过设定的最小点个数时，则将当前种子点标记为聚类点，否则标记为噪声点。

12、可选地，s5，进行淋巴亚群细胞样本数据集区域判断，包括：

13、通过数据可视化工具查看数据的分布情况，通过观察数据点的密集程度、形状和位置，判断是否存在无法被固定尺寸网格有效捕获的粒子群。

14、可选地，s5中直至达到预设条件输出最终聚类结果，包括：

15、在每次迭代后，检查是否达到预设条件，如果达到预设条件，则停止迭代并输出最终聚类结果；否则继续调整网格大小并重新执行聚类分析。

16、可选地，所述预设条件具体包括达到最大迭代次数或聚类结果稳定。

17、第二方面，提供了一种针对淋巴亚群细胞的自动圈门系统，该系统包括：

18、获取模块，用于获取淋巴亚群细胞样本数据集，在数据集中选择随机起始点作为种子点；

19、统计模块，用于以当前种子点为中心并构建网格，统计网格内的粒子数；

20、标记模块，用于遍历所有种子点，根据各种子点构建网格内的粒子数对种子点进行标记；其中，具体标记为噪声点或聚类点；

21、处理模块，用于遍历完所有种子点后，将具有相同标记的种子点作为当前聚类结果；

22、判断模块，用于进行淋巴亚群细胞样本数据集区域判断，根据判断结果调整所构建的网格大小并重新执行自动圈门，直至达到预设条件输出最终聚类结果。

23、第三方面，提供了一种电子设备，包括存储器和处理器，存储器存储有计算机程序，处理器执行计算机程序时实现上述第一方面任一所述的针对淋巴亚群细胞的自动圈门方法。

24、第四方面，提供了一种计算机可读存储介质，其上存储有计算机程序，计算机程序被处理器执行时实现上述第一方面任一所述的针对淋巴亚群细胞的自动圈门方法。

25、第五方面，提供了一种计算机程序产品，包括计算机程序/指令，计算机程序/指令被执行时实现上述第一方面任一所述的针对淋巴亚群细胞的自动圈门方法。

26、本申请实施例提供的技术方案中通过结合网格密度和dbscan聚类算法，针对淋巴亚群细胞样本数据集提出了一个有效的聚类方法。该方法通过随机选择起始点、构建网格统计粒子数、遍历种子点进行标记、以及根据区域判断调整网格大小等步骤，能够更准确地识别出不同淋巴亚群细胞团，并减少噪声点的影响。此外，通过迭代调整网格大小，该方法能够灵活适应数据集中不同区域的粒子分布，提高聚类的准确性和稳定性。

技术特征：

1.一种针对淋巴亚群细胞的自动圈门方法，其特征在于，所述方法包括：

2.根据权利要求1所述的自动圈门方法，其特征在于，s1，获取淋巴亚群细胞样本数据集，在数据集中选择随机起始点作为种子点，包括：

3.根据权利要求1所述的自动圈门方法，其特征在于，s3，遍历所有种子点，根据各种子点构建网格内的粒子数对种子点进行标记，包括：

4.根据权利要求1所述的自动圈门方法，其特征在于，s5，进行淋巴亚群细胞样本数据集区域判断，包括：

5.根据权利要求1所述的自动圈门方法，其特征在于，s5中直至达到预设条件输出最终聚类结果，包括：

6.根据权利要求5所述的自动圈门方法，其特征在于，所述预设条件具体包括达到最大迭代次数或聚类结果稳定。

7.一种针对淋巴亚群细胞的自动圈门系统，其特征在于，所述系统包括：

8.一种电子设备，其特征在于，包括存储器和处理器，所述存储器存储有计算机程序，所述计算机程序被所述处理器执行时实现如权利要求1至6任一所述的针对淋巴亚群细胞的自动圈门方法。

9.一种计算机可读存储介质，其特征在于，其上存储有计算机程序，所述计算机程序被处理器执行时实现如权利要求1至6任一所述的针对淋巴亚群细胞的自动圈门方法。

10.一种计算机程序产品，包括计算机程序/指令，其特征在于，该计算机程序/指令被处理器执行时实现权利要求1至6任一所述的针对淋巴亚群细胞的自动圈门方法。

技术总结本申请公开了一种针对淋巴亚群细胞的自动圈门方法及系统。本方法通过随机选择起始点、构建网格统计粒子数、遍历种子点进行标记、以及根据区域判断调整网格大小等步骤，能够更准确地识别出不同淋巴亚群细胞团，并减少噪声点的影响。此外，通过迭代调整网格大小，能够灵活适应数据集中不同区域的粒子分布，提高聚类的准确性和稳定性。技术研发人员：朱丽娟,张荣倩,王政良,于祥敏,刘铁夫受保护的技术使用者：北京层浪生物科技有限公司技术研发日：技术公布日：2024/9/12