一种遗传标记在大白母猪繁殖性状辅助选择中的应用

本发明涉及猪遗传标记制备，具体涉及greb1基因在大白母猪繁殖性状辅助选择中的应用，它包括猪greb1基因突变位点的检测方法与关联分析。

背景技术：

1、母猪繁殖性能直接影响到生猪养殖业的经济效益。猪的产仔数是衡量母猪繁殖能力的主要指标，如何提高母猪的产仔数已成为各国猪种选育工作的重点。近年来，法系和丹系大白猪等选育成功，其产仔数达到15头以上，其母猪每年提供的断奶仔猪数30头以上，而我国仅有20头左右。猪产仔数性状属于低遗传力性状(h2＝0.1)，采用传统的育种手段难以达到理想的效果，而分子标记辅助育种技术的应用将在很大程度上解决这一问题(黄碧能，2018)。

2、乳腺癌雌激素调控因子1(growth regulation by estrogen in breast cancer1,greb1)是一种能够参与乳腺癌细胞生长的雌激素效应基因。greb1蛋白的c端含有一个由tet/jbp(ten-eleven translocation/j binding protein)、糖基转移酶以及循环排列的超家族ⅱ解旋酶融合形成的结构域(yer et al.,2013)。在greb1的n端包含两个lxxll结构，其中l代表亮氨酸，x代表任何一种氨基酸，该结构通常存在于辅助活化因子中，并参与调节激素同型二聚体与核受体的相互作用。雌激素通过与其受体结合发挥作用(cheng etal.,2018)。

3、一些证据表明，greb1受雌激素、孕激素和雄激素的调节，从而刺激激乳腺癌、卵巢癌和前列腺癌细胞的增殖(haines et al.,2020)；greb1也对人子宫内膜细胞中的黄体酮有反应。greb1基因受到受雌激素、孕激素和雄激素的调节，因此推测其可能影响母猪的卵巢功能，从而影响母猪的繁殖性状。所以本发明通过群体性状关联分析，鉴定snp分子标记与母猪产仔数性状的相关性，从而产仔数的遗传改良奠定基础。

技术实现思路

1、本发明的目的在于克服现有技术的缺陷，提供了一种猪snp分子标记在猪繁殖性状筛选和猪育种中的应用，本发明发掘了greb1基因第23内含子中某一snp与猪繁殖性状关联，可作为猪繁殖性状筛选和猪选育的分子标记。

2、本发明的目的之一在于提供一种猪snp分子标记在猪繁殖性状筛选和猪育种中的应用，其中所述繁殖性状为总产仔数性状、产活仔数性状、木乃伊数和死胎数，所述分子标记的核苷酸序列如序列表seq id no:1所示，在该序列的第365bp处存在一处g>t碱基突变。该分子标记位于猪greb1基因第23内含子的部分序列中，该序列长度为732bp，该snp的rs号为rs81306474。进一步，序列seq id no:1中第365bp处的g或t碱基多态性位点，表现为gg、gt或tt三种基因型，其中g等位基因为优势等位基因。

3、本发明还提供了一种猪的选育方法，其步骤为：

4、1、提取大白母猪的基因组dna；

5、2、以步骤1得到的基因组dna作为模板，采用上述引物进行pcr扩增得到所述分子标记；

6、3、对步骤2扩增得到的分子标记进行测序分析，保留该序列第365bp处携带有g等位基因的个体，淘汰携带有t等位基因的个体。

7、与现有技术相比，本发明的有益效果是：本发明首次发掘了猪greb1基因中的一个snp分子标记(rs81306474)与猪的繁殖性状的关联，具体性状为总产仔数性状、产活仔数性状、木乃伊数和死胎数相关，因此可将该分子标记用于筛选猪繁殖性状和辅助选育，另外本发明还提供了猪greb1基因中一个snp分子标记在猪繁殖性状的标记辅助育种的新用途，实现了对猪繁殖性状的早期筛选，本筛选方法简单快速。

8、本发明snp遗传标记的具体序列如下所述：

9、ctctggaggcaggtggaagcgagagactgaaaaactctgaccttcgctctttatgcgctgatggtgtgagcagatgagactggcatcctggtacttggggtcatgaatagtgtagtcgaaaggcaacttcttgaacagctccaggtccggccaggggtcagtgagctgcaggtagtgccagtccgcttcatctctgaggtctgcaggatcagtaggaacgggtgacaaaaggggacgtgagaagggtttatttcattgggcccaaggacgaggcctggcgtggaactgagatggagtcccccgcttaccaggggaacccacggtctctcaaacgctcaggcgtgcatcccattttcaggatggtr(g/t)ctaattcggccagaagatgcatgcagctctgtctctatccagaggaaccgcctgatgctgcgtttcccatggggtgggtttgctcctctgactggggctgacgtccgcggctcgcagtacccctgccccagtgctctgcttcttcccagtaccatcccccaaatgtaccccccctggtccccaccaccggcagaacctaatggcgttctctctcttgctcttatatctaagtgctgtccagccagtaaggcccgactcccaccaccaccccgagaaagccccctctgtgtgcgcagggccccgggtcttccttctgaatgtcaagacgactcatggcccaagccacacttttccatgtgccgtgtct

10、上述序列第365碱基位的r是g或t的碱基替换。

技术特征：

1.一种遗传标记在大白母猪繁殖性状辅助选择中的应用，所述遗传标记的核苷酸序列如下所示：

技术总结本发明属于猪分子标记筛选与应用技术领域，具体涉及一种遗传标记在大白母猪繁殖性状辅助选择中的应用，所述遗传标记如序列表SEQ ID NO:1所示。在所述序列表SEQ ID NO:1所示序列的第365碱基位为等位基因突变，即R是G或T替换；进行了三种基因型GG、GT或TT的关联分析，明确G等位基因为优势等位基因。技术研发人员：李凤娥,梁凤,宋雨阳,刘鑫,贺愚,陈高贵受保护的技术使用者：华中农业大学技术研发日：技术公布日：2024/11/4