异绿原酸A在制备YdiU蛋白抑制剂中的应用

本发明涉及药物新用途，具体为异绿原酸a在制备ydiu蛋白抑制剂中的应用。

背景技术：

1、ydiu蛋白家族在各物种中广泛存在并高度保守。研究表明，细菌内ydiu是一种催化蛋白单磷酸尿苷酸化(ump化)的新型修饰酶。而转录组学和蛋白组学分析表明与细菌的鞭毛、趋化性、毒力因子、铁载体合成等多项生命活动密切相关。并且，与野生型菌株相比，ydiu敲除菌在移动能力、细胞入侵率、铁吸收效率及细胞和动物感染的致病性等表型上也都存在显著差异。申请人在先前的多项研究工作表明，ydiu介导的ump化修饰在细菌感知和适应宿主环境中发挥重要作用。由此ydiu可作为治疗细菌感染的药物设计的重要的选择性靶点。并且，ydiu结构已经解析，根据结构分析显示ydiu对utp具有偏好性，ydiu与utp之间形成的氢键比ydiu与atp之间形成的氢键要多。

2、异绿原酸a(isochlorogenic acid a)又名3,5-二咖啡酰奎宁酸，分子式为c25h24o12，是金银花中的一种有机酸生物活性成分。目前已经发现异绿原酸a具有抗病毒作用，能够抑制乙肝病毒的复制。此外，二咖啡酰奎尼酸类已经被证明具有抗炎、抗氧化、抗病毒等方面发挥作用。异绿原酸a通过被动扩散的方式进入大鼠体内，其在回肠段吸收较好。异绿原酸a通过水解、氢化、脱氢、甲基化、葡萄糖醛酸化、硫酸化等一系列方式在小鼠体内发生代谢，其代谢产物主要出现在尿液和粪便当中，而不存在于血液当中。该研究已经明确了异绿原酸a药效物质基础。

3、然而，现有技术中还未能发现异绿原酸a在对细菌ydiu蛋白调控中的作用。

技术实现思路

1、为了解决上述问题，本发明首次发现并提出了异绿原酸或异绿原酸盐对细菌ydiu蛋白的作用，并进一步通过实验证实了该作用，开拓了异绿原酸或异绿原酸盐的新用途，并为以ydiu蛋白为靶点的药物设计提供了新思路。

2、一方面，本申请提供了异绿原酸或异绿原酸盐在制备ydiu蛋白抑制剂中的应用。

3、在一种实施方式中，所述异绿原酸包括异绿原酸a、异绿原酸b和异绿原酸c。

4、在一种实施方式中，所述异绿原酸盐包括但不限于异绿原酸的钠盐、钾盐。

5、优选的，所述异绿原酸为异绿原酸a(isochlorogenic acid a)。

6、在一种实施方式中，所述抑制剂用于抑制ydiu蛋白的单磷酸尿苷酸化(ump化)修饰。

7、在一种实施方式中，所述抑制剂用于抑制ydiu蛋白的自身单磷酸尿苷酸化。

8、在一种实施方式中，所述抑制剂用于抑制ydiu蛋白对底物蛋白的单磷酸尿苷酸化。

9、在一种实施方式中，所述底物蛋白包括fur蛋白和/或tufa蛋白。

10、在一种实施方式中，所述抑制剂用于与ydiu蛋白的活性位点进行结合，进而避免utp与所述活性位点结合形成单磷酸尿苷酸化修饰。

11、在一种实施方式中，所述ydiu蛋白的活性位点包括asp256、asn244、asp246、arg116、asp119、gly120、arg87。

12、在一种实施方式中，所述抑制剂能够与上述活性位点进行氢键和/或盐桥形式的稳定结合。

13、优选的，当以异绿原酸a为抑制剂时，其结构式中四个羟基分别与活性位点asp256、asn244、asp246、arg116、asp119、gly120形成氢键作用，其中asp119与两个的羟基都产生氢键作用，距离分别为并且，异绿原酸a还能够与位点arg87形成两个盐桥。

14、在一种实施方式中，所述抑制剂的最低有效浓度为100μm。

15、可选的，所述抑制剂的有效浓度为100～1000μm，例如100μm、200μm、300μm、400μm、500μm、600μm、700μm、800μm、900μm、1000μm。

16、另一方面，本申请提供了一种ydiu蛋白抑制剂，所述抑制剂含有摩尔浓度至少为100μm的异绿原酸a。

17、在一个实施方式中，所述ydiu蛋白为来源于细菌的ydiu蛋白。

18、与现有技术相比，本发明至少具有以下有益效果：

19、1、本发明首次提出并通过多项实验证实了异绿原酸a对细菌ydiu蛋白具有抑制作用，尤其是抑制了ydiu蛋白的自身ump化和对底物蛋白fur和tufa的ump化，并分析得出异绿原酸a能够与utp竞争并稳定结合ydiu蛋白的活性位点，实现阻断ydiu蛋白与utp结合后的ump化修饰，由此开拓了异绿原酸a的新用途。

20、2、本申请还基于异绿原酸a对ydiu蛋白的抑制作用提供了一种ydiu蛋白抑制剂，并通过实验得出了异绿原酸a在最低浓度为100μm时，对ydiu蛋白的自身ump化和对底物蛋白的ump化具有明显的抑制作用，为以ydiu蛋白为靶点的药物设计提供了新思路。

技术特征：

1.异绿原酸或异绿原酸盐在制备ydiu蛋白抑制剂中的应用。

2.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，所述异绿原酸为异绿原酸a。

3.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，所述抑制剂用于抑制ydiu蛋白的单磷酸尿苷酸化修饰。

4.根据权利要求3所述的应用，其特征在于，所述抑制剂用于抑制ydiu蛋白的自身单磷酸尿苷酸化。

5.根据权利要求3所述的应用，其特征在于，所述抑制剂用于抑制ydiu蛋白对底物蛋白的单磷酸尿苷酸化。

6.根据权利要求5所述的应用，其特征在于，所述底物蛋白包括fur蛋白和/或tufa蛋白。

7.根据权利要求3-6任一所述的应用，其特征在于，所述抑制剂用于与ydiu蛋白的活性位点进行结合，进而避免utp与所述活性位点结合形成单磷酸尿苷酸化修饰。

8.根据权利要求7所述的应用，其特征在于，所述ydiu蛋白活性位点包括asp256、asn244、asp246、arg116、asp119、gly120、arg87。

9.根据权利要求8所述的应用，其特征在于，所述抑制剂用于与活性位点asp256、asn244、asp246、arg116、asp119、gly120形成氢键，与活性位点arg87形成盐桥。

10.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，所述抑制剂的最低有效浓度为100μm。

技术总结本发明提供了一种异绿原酸A在制备YdiU蛋白抑制剂中的应用，属于药物新用途技术领域。本发明首次提出并通过多项实验证实了异绿原酸A对细菌YdiU蛋白具有抑制作用，并提供了一种YdiU蛋白抑制剂，由此开拓了异绿原酸A的新用途，为以YdiU蛋白为靶点的药物设计提供了新思路。技术研发人员：李冰清,刘晴,贾海红,王玮玮,宋楠楠受保护的技术使用者：山东第一医科大学（山东省医学科学院）技术研发日：技术公布日：2024/6/13