与玉米耐冷性连锁的分子标记及其应用

本发明涉及分子标记，尤其涉及与玉米耐冷性连锁的分子标记及其应用。

背景技术：

1、玉米产量大，需求大，但玉米是喜温的c4作物，对温度极其敏感。玉米易发生低温冷害。低温冷害会使玉米的膜结构，光合器官和生殖器官等发生异常，影响玉米植株的生理代谢。同时低温冷害也会产生有害物质，影响玉米生长发育，导致减产。低温冷害是最重要的农作物非生物胁迫之一。

2、已有研究表明，不同玉米自交系的耐冷能力存在显著差异，科学家普遍认为这种差异是多种耐冷生理性状的综合体现，是多基因控制的数量性状。在此基础上，已有一些研究尝试通过gwas分析，qtl分析来发掘相关基因，但大多研究都止步于初步定位或候选基因，而玉米耐冷分子标记的开发会为培育耐冷的玉米品种提供更加便利的手段。

3、因此，有必要对玉米耐冷性分子标记进行进一步发掘和研究。

技术实现思路

1、本发明提供了一种与玉米耐冷性连锁的分子标记及其应用，具体技术实现要素：如下。

2、第一方面，本发明提供了与玉米耐冷性连锁的分子标记zmtip4；3，其由如seq idno.1和seq id no.2所示的引物扩增得到。

3、第二方面，本发明提供了用于扩增上述分子标记的引物或引物组合物。

4、优选地，所述引物或引物组合物包括如seq id no.1和seq id no.2所示的引物。

5、第三方面，本发明提供了含有上述引物或引物组合物的试剂或试剂盒。

6、第四方面，本发明提供了所述的分子标记zmtip4；3、所述的引物或引物组合物、或所述的试剂或试剂盒在以下至少一方面中的应用：

7、(1)鉴定玉米耐冷性性状表型；

8、(2)玉米种质资源鉴定、改良或分子标记辅助育种；

9、(3)玉米耐冷性性状早期预测；

10、(4)筛选或创制玉米耐冷性性状不同的玉米；

11、(5)玉米耐冷性基因分型。

12、第五方面，本发明提供了一种鉴定玉米耐冷性性状表型的方法，包括：

13、以待鉴定玉米dna为模板，利用seq id no.1和seq id no.2所示的引物进行pcr扩增，根据扩增产物鉴定玉米耐冷性性状表型。

14、优选地，根据扩增产物条带大小鉴定玉米耐冷性性状表型。

15、优选地，所述pcr扩增的反应程序为：94℃～95℃预变性1～3min，94℃～95℃变性20～40s，54～60℃退火20～40s，70℃～74℃延伸20～30s，由变性到延伸进行30～40个循环，最后70℃～74℃延伸5～10min。

16、优选地，若扩增产物条带大小为702bp，判断待鉴定玉米具有高耐冷性。

17、优选地，若扩增产物含有seq id no.4所示核苷酸序列，判断待鉴定玉米具有高耐冷性。

18、优选地，若扩增产物条带大小为374bp，判断待鉴定玉米为冷敏感型。

19、优选地，若扩增产物含有seq id no.5所示核苷酸序列，判断待鉴定玉米为冷敏感型。

20、与现有技术相比，本发明的有益效果在于：

21、本发明在耐冷zmtip4；3基因内，鉴定了一个位于其启动子中插入或缺失的，与玉米耐冷性连锁的小片段，该片段的插入或缺失，可作为玉米耐冷分子标记。本发明还提供了一种用于检测本发明的玉米耐冷分子标记的引物对以及检测玉米是否耐冷的方法。

22、由于玉米耐冷属数量性状遗传，表型分析耗时费力，上述的分子标记、引物对都可以应用于玉米耐冷育种中，在玉米种子期间或子叶长出的早期阶段就可鉴定，省时而且准确，可以加速玉米耐冷品种选育进程。

技术特征：

1.与玉米耐冷性连锁的分子标记zmtip4；3，其特征在于，其由如seq id no.1和seq idno.2所示的引物扩增得到。

2.引物或引物组合物，其特征在于，其用于扩增权利要求1所述的分子标记zmtip4；3。

3.根据权利要求2所述的引物或引物组合物，其特征在于，包括如seq id no.1和seqid no.2所示的引物。

4.试剂或试剂盒，其特征在于，其中含有权利要求2或3所述的引物或引物组合物。

5.权利要求1所述的分子标记zmtip4；3、权利要求2或3所述的引物或引物组合物、或权利要求4所述的试剂或试剂盒在以下至少一方面中的应用：

6.一种鉴定玉米耐冷性性状表型的方法，其特征在于，包括：

7.根据权利要求6所述的方法，其特征在于，根据扩增产物条带大小鉴定玉米耐冷性性状表型。

8.根据权利要求6或7所述的方法，其特征在于，所述pcr扩增的反应程序为：94℃～95℃预变性1～3 min，94℃～95℃变性20～40s，54～60℃退火20～40s，70℃～74℃延伸20～30s，由变性到延伸进行30～40个循环，最后70℃～74℃延伸5～10 min。

9.根据权利要求8所述的方法，其特征在于，若扩增产物条带大小为702bp或含有seqid no.4所示核苷酸序列，判断待鉴定玉米具有高耐冷性。

10.根据权利要求8所述的方法，其特征在于，若扩增产物条带大小为374bp或含有seqid no.5所示核苷酸序列，判断待鉴定玉米为冷敏感型。

技术总结本发明涉及分子标记技术领域，尤其涉及与玉米耐冷性连锁的分子标记及其应用。与玉米耐冷性连锁的分子标记为ZmTIP4；3，由如SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示的引物扩增得到。由于玉米耐冷属数量性状遗传，表型分析耗时费力，本发明的分子标记可以应用于玉米耐冷育种中，在玉米种子期间或子叶长出的早期阶段就可鉴定，省时而且准确，可以加速玉米耐冷品种选育进程。技术研发人员：杨淑华,曾榕,施怡婷受保护的技术使用者：中国农业大学技术研发日：技术公布日：2024/6/13