ATP7B基因中与鸡蛋短径关联的SNP遗传标记在鸡遗传育种中的应用的制作方法

本发明属于畜禽遗传标记、鸡遗传育种，特别涉及atp7b基因中与鸡蛋短径关联的snp遗传标记在鸡遗传育种中的应用。

背景技术：

1、鸡蛋尺寸是影响消费者购买决策的关键因素，是鸡蛋分级的主要指标，也是蛋鸡育种的主选性状。衡量鸡蛋尺寸的指标主要有：重量、鸡蛋短径和鸡蛋长径。随着机器视觉技术在蛋品分析上的应用日益广泛，欧美蛋鸡育种公司越发重视鸡蛋短径的选育。若能从遗传上提高鸡蛋短径，还能够降低次品蛋比率。

技术实现思路

1、为了从遗传上提升鸡蛋短径尺寸，本发明提供了atp7b基因中与鸡蛋短径关联的snp遗传标记在鸡遗传育种中的应用，该snp遗传标记有助于遗传上提升鸡蛋短径，将其应用于鸡的遗传育种，有利于改善鸡蛋短径，获得鸡蛋短径更长的蛋鸡品种。

2、本发明通过以下技术方案实现：

3、本发明提供atp7b基因中与鸡蛋短径关联的snp遗传标记在鸡遗传育种中的应用，所述atp7b基因中与鸡蛋短径关联的snp遗传标记包括eb_atp7b，snp编号为rs318027552，所述eb_atp7b对应于ncbi中公布的鸡参考基因组bgalgal1.mat.broiler.grcg7b版本序列信息1号染色体正义链第170198448位，位于基因atp7b下游，此处碱基为g或a。

4、基于同一发明构思，本发明提供一种鸡蛋短径性状的早期选择方法，所述早期选择方法包括基于snp遗传标记eb_atp7b的基因型对鸡蛋短径性状进行早期选择；

5、所述eb_atp7b对应于ncbi中公布的鸡参考基因组bgalgal1.mat.broiler.grcg7b版本序列信息1号染色体正义链第170198448位，位于基因atp7b下游，此处碱基为g或a。

6、进一步的，所述早期选择方法具体包括：

7、检测待测鸡eb_atp7b的基因型；

8、基于所述eb_atp7b的基因型对待测鸡鸡蛋短径性状进行早期选择；

9、其中，所述eb_atp7b的gg基因型个体的鸡蛋短径大于ga基因型个体的鸡蛋短径，ga基因型个体的鸡蛋短径大于aa基因型个体的鸡蛋短径。

10、进一步的，所述检测待测鸡eb_atp7b的基因型，具体包括：

11、以peb_a7f和peb_a7r为引物，对待测鸡的基因组dna进行pcr扩增；

12、对pcr扩增产物进行测序，获得待测鸡1号染色体正义链第170198448位的基因型；

13、其中，所述peb_a7f的核苷酸序列如seq id no.1所示，所述peb_a7r的核苷酸序列如seq id no.2所示。

14、进一步的，所述待测鸡的品种包括东乡绿壳蛋鸡和/或白来航鸡。

15、基于同一发明构思，本发明提供用于检测atp7b基因中与鸡蛋短径关联的snp遗传标记的引物，所述引物包括peb_a7f和peb_a7r，所述peb_a7f的核苷酸序列如seq id no.1所示，所述peb_a7r的核苷酸序列如seq id no.2所示；

16、所述atp7b基因中与鸡蛋短径关联的snp遗传标记包括eb_atp7b，所述eb_atp7b对应于ncbi中公布的鸡参考基因组bgalgal1.mat.broiler.grcg7b版本序列信息1号染色体正义链第170198448位，位于基因atp7b下游，此处碱基为g或a。

17、基于同一发明构思，本发明提供用于检测atp7b基因中与鸡蛋短径关联的snp遗传标记的引物在鸡遗传育种中的应用。

18、基于同一发明构思，本发明还提供一种试剂盒，所述试剂盒包含引物peb_a7f和peb_a7r。

19、基于同一发明构思，本发明还提供上述一种试剂盒在鸡遗传育种中的应用。

20、本发明实施例中的一个或多个技术方案，至少具有如下技术效果或优点：

21、本发明atp7b基因中与鸡蛋短径关联的snp遗传标记在鸡遗传育种中的应用，所述atp7b基因中与鸡蛋短径关联的snp遗传标记为eb_atp7b，eb_atp7b的优势基因型gg个体具有更大的鸡蛋短径，将其应用于鸡的遗传育种，有助于从遗传上提升鸡蛋短径，进而提高鸡蛋品质，有利于获得产蛋短径更大的蛋鸡品种。

技术特征：

1.atp7b基因中与鸡蛋短径关联的snp遗传标记在鸡遗传育种中的应用，其特征在于，所述atp7b基因中与鸡蛋短径关联的snp遗传标记包括eb_atp7b，snp编号为rs318027552，所述eb_atp7b对应于ncbi中公布的鸡参考基因组

2.一种鸡蛋短径性状的早期选择方法，其特征在于，所述早期选择方法包括基于snp遗传标记eb_atp7b的基因型对鸡蛋短径性状进行早期选择；

3.根据权利要求2所述的一种鸡蛋短径性状的早期选择方法，其特征在于，所述早期选择方法具体包括：

4.根据权利要求3所述的一种鸡蛋短径性状的早期选择方法，其特征在于，所述检测待测鸡eb_atp7b的基因型，具体包括：

5.根据权利要求3或4所述的一种鸡蛋短径性状的早期选择方法，其特征在于，所述待测鸡的品种包括东乡绿壳蛋鸡和/或白来航鸡。

6.用于检测atp7b基因中与鸡蛋短径关联的snp遗传标记的引物，其特征在于，所述引物包括peb_a7f和peb_a7r，所述peb_a7f的核苷酸序列如seq id no.1所示，所述peb_a7r的核苷酸序列如seq id no.2所示；

7.如权利要求6所述的引物在鸡遗传育种中的应用。

8.一种试剂盒，其特征在于，所述试剂盒包含权利要求6所述的引物。

9.如权利要求8所述的试剂盒在鸡遗传育种中的应用。

技术总结本发明提供了ATP7B基因中与鸡蛋短径关联的SNP遗传标记在鸡遗传育种中的应用，属于畜禽遗传标记、鸡遗传育种技术领域，所述ATP7B基因中与鸡蛋短径关联的SNP遗传标记包括EB_atp7b，SNP编号为rs318027552，所述EB_atp7b对应于NCBI中公布的鸡参考基因组bGa lGa l 1.mat.broi ler.GRCg7b版本序列信息1号染色体正义链第170198448位，位于基因ATP7B下游，此处碱基为G或A。该SNP遗传标记有助于遗传上提升鸡蛋短径，将其应用于鸡的遗传育种，有利于改善鸡蛋短径，获得鸡蛋短径更长的蛋鸡品种。技术研发人员：童海兵,郭军,曲亮,邵丹,王强,李永峰,窦套存,马猛受保护的技术使用者：江苏省家禽科学研究所技术研发日：技术公布日：2024/6/13