与鸡蛋短径相关的遗传标记在鸡遗传育种中的应用的制作方法

本发明属于畜禽遗传育种、生物，特别涉及与鸡蛋短径相关的遗传标记在鸡遗传育种中的应用。

背景技术：

1、鸡蛋尺寸是影响消费者购买决策的关键因素，是鸡蛋分级的主要指标，也是蛋鸡育种的主选性状。衡量鸡蛋尺寸的指标主要有：重量、鸡蛋短径和鸡蛋长径。随着机器视觉技术在蛋品分析上的应用日益广泛，欧美蛋鸡育种公司越发重视鸡蛋短径的选育。若能从遗传上提高鸡蛋短径，还能够降低次品蛋比率。

技术实现思路

1、为了从遗传上提升鸡蛋短径尺寸，本发明提供了与鸡蛋短径相关的遗传标记在鸡遗传育种中的应用，所述与鸡蛋短径相关的遗传标记包括eb_ncapg和eb_ldb2，eb_ncapg和eb_ldb2均有助于遗传上提升鸡蛋短径，将其应用于鸡的遗传育种，有利于改善鸡蛋短径，获得鸡蛋短径更长的蛋鸡品种。

2、本发明通过以下技术方案实现：

3、本发明提供与鸡蛋短径相关的遗传标记在鸡遗传育种中的应用，所述与鸡蛋短径相关的遗传标记包括eb_ncapg和/或eb_ldb2；

4、所述eb_ncapg的snp编号为rs315201454，对应于ncbi中公布的鸡参考基因组bgalgal1.mat.broiler.grcg7b版本序列信息4号染色体正义链第75435186位，位于基因ncapg第16内含子，此处碱基为g或a；

5、所述eb_ldb2的snp编号为rs14491074，对应于ncbi中公布的鸡参考基因组bgalgal1.mat.broiler.grcg7b版本序列信息4号染色体正义链第75603710位，位于基因ldb2(x4变异体)第1内含子，此处碱基为t或c。

6、基于同一发明构思，本发明提供一种鸡蛋短径性状的早期选择方法，所述早期选择方法包括基于遗传标记eb_ncapg和/或eb_ldb2的基因型对鸡蛋短径性状进行早期选择；

7、所述eb_ncapg的snp编号为rs315201454，对应于ncbi中公布的鸡参考基因组bgalgal1.mat.broiler.grcg7b版本序列信息4号染色体正义链第75435186位，位于基因ncapg第16内含子，此处碱基为g或a；

8、所述eb_ldb2的snp编号为rs14491074，对应于ncbi中公布的鸡参考基因组bgalgal1.mat.broiler.grcg7b版本序列信息4号染色体正义链第75603710位，位于基因ldb2第1内含子，此处碱基为t或c。

9、进一步的，所述早期选择方法具体包括：

10、检测待测鸡eb_ncapg和/或eb_ldb2的基因型；

11、基于所述eb_ncapg和/或所述eb_ldb2的基因型对待测鸡鸡蛋短径性状进行早期选择；

12、其中，所述eb_ncapg的ga基因型个体的鸡蛋短径大于aa基因型和gg基因型个体的鸡蛋短径；

13、所述eb_ldb2的ct基因型个体的鸡蛋短径大于cc基因型和tt基因型个体的鸡蛋短径。

14、进一步的，所述检测待测鸡eb_ncapg和/或eb_ldb2的基因型，具体包括：

15、检测待测鸡eb_ncapg的基因型：

16、以peb_n1f和peb_n1r为引物，对待测鸡的基因组dna进行pcr扩增；

17、对pcr扩增产物进行测序，获得待测鸡4号染色体正义链第75435186位的基因型；

18、检测待测鸡eb_ldb2的基因型：

19、以peb_l2f和peb_l2r为引物，对待测鸡的基因组dna进行pcr扩增；

20、对pcr扩增产物进行测序，获得待测鸡4号染色体正义链第75603710位的基因型；

21、其中，所述peb_n1f的碱基序列如seq id no.1所示，所述peb_n1r的碱基序列如seq id no.2所示，所述peb_l2f的碱基序列如seq id no.3所示，所述peb_l2r的碱基序列如seq id no.4所示。

22、进一步的，所述待测鸡的品种包括东乡绿壳蛋鸡和/或白来航鸡。

23、基于同一发明构思，本发明提供用于检测与鸡蛋短径相关的遗传标记的引物，包括检测eb_ncapg的引物和/或检测eb_ldb2的引物，所述检测eb_ncapg的引物包括peb_n1f和peb_n1r，所述检测eb_ldb2的引物包括peb_l2f和peb_l2r；

24、所述peb_n1f的碱基序列如seq id no.1所示，所述peb_n1r的碱基序列如seq idno.2所示，所述peb_l2f的碱基序列如seq id no.3所示，所述peb_l2r的碱基序列如seq idno.4所示；

25、所述eb_ncapg的snp编号为rs315201454，对应于ncbi中公布的鸡参考基因组bgalgal1.mat.broiler.grcg7b版本序列信息4号染色体正义链第75435186位，位于基因ncapg第16内含子，此处碱基为g或a；

26、所述eb_ldb2的snp编号为rs14491074，对应于ncbi中公布的鸡参考基因组bgalgal1.mat.broiler.grcg7b版本序列信息4号染色体正义链第75603710位，位于基因ldb2第1内含子，此处碱基为t或c。

27、基于同一发明构思，本发明提供用于检测与鸡蛋短径相关的遗传标记的引物在鸡遗传育种中的应用。

28、基于同一发明构思，本发明还提供一种试剂盒，所述试剂盒包含引物对peb_n1f和peb_n1r以及引物对peb_l2f和peb_l2r中的至少一对。

29、基于同一发明构思，本发明还提供上述一种试剂盒在鸡遗传育种中的应用。

30、本发明实施例中的一个或多个技术方案，至少具有如下技术效果或优点：

31、本发明与鸡蛋短径相关的遗传标记在鸡遗传育种中的应用，所述与鸡蛋短径相关的遗传标记为eb_ncapg和eb_ldb2，采用其中任一遗传标记或二者组合均有助于从遗传上改善鸡蛋短径，将遗传标记eb_ncapg和/或eb_ldb2应用于鸡的遗传育种，能够遗传上选育蛋鸡，改善鸡蛋短径，减少蛋鸡在产蛋后期出现的异常蛋问题，避免产蛋后期蛋品质下降，从而提高养殖收益。

技术特征：

1.与鸡蛋短径相关的遗传标记在鸡遗传育种中的应用，其特征在于，所述与鸡蛋短径相关的遗传标记包括eb_ncapg和/或eb_ldb2；

2.一种鸡蛋短径性状的早期选择方法，其特征在于，所述早期选择方法包括基于遗传标记eb_ncapg和/或eb_ldb2的基因型对鸡蛋短径性状进行早期选择；

3.根据权利要求2所述的一种鸡蛋短径性状的早期选择方法，其特征在于，所述早期选择方法具体包括：

4.根据权利要求3所述的一种鸡蛋短径性状的早期选择方法，其特征在于，所述检测待测鸡eb_ncapg和/或eb_ldb2的基因型，具体包括：

5.根据权利要求3或4所述的一种鸡蛋短径性状的早期选择方法，其特征在于，所述待测鸡的品种包括东乡绿壳蛋鸡和/或白来航鸡。

6.用于检测与鸡蛋短径相关的遗传标记的引物，其特征在于，包括检测eb_ncapg的引物和/或检测eb_ldb2的引物，所述检测eb_ncapg的引物包括peb_n1 f和peb_n1 r，所述检测eb_ldb2的引物包括peb_l2f和peb_l2r；

7.如权利要求6所述的引物在鸡遗传育种中的应用。

8.一种试剂盒，其特征在于，所述试剂盒包含权利要求6所述的引物。

9.如权利要求8所述的试剂盒在鸡遗传育种中的应用。

技术总结本发明提供了与鸡蛋短径相关的遗传标记在鸡遗传育种中的应用，属于畜禽遗传育种、生物技术领域，包括EB_ncapg和/或EB_ldb2；所述EB_ncapg对应于NCBI中公布的鸡参考基因组bGa lGa l 1.mat.broi ler.GRCg7b版本序列信息4号染色体正义链第75435186位，此处碱基为G或A；所述EB_ldb2对应于bGa lGa l 1.mat.broi ler.GRCg7b版本序列信息4号染色体正义链第75603710位，此处碱基为T或C。EB_ncapg和EB_ldb2均有助于遗传上提升鸡蛋短径，将其应用于鸡的遗传育种，有利于改善鸡蛋短径，获得鸡蛋短径更长的蛋鸡品种。技术研发人员：郭军,曲亮,邵丹,窦套存,王星果,胡玉萍,王强,童海兵受保护的技术使用者：江苏省家禽科学研究所技术研发日：技术公布日：2024/6/13