一种扰动响应对象的筛选系统、装置、方法及存储介质与流程
- 国知局
- 2024-09-14 14:26:37
本公开实施例涉及生物领域,尤其是涉及一种扰动响应对象的筛选系统、装置、方法及存储介质。
背景技术:
1、模拟和预测生物对扰动的响应是系统生物学中的一项重要任务。近年来,随着测序技术的发展,对生物扰动响应的研究已经深入到单细胞层面,而探究扰动对细胞的影响的一个主要层面是扰动响应基因的筛选。
2、但是,目前采用的筛选方案的筛选精度不高,有待改进。
技术实现思路
1、本公开实施例提供一种扰动响应对象的筛选系统、装置、方法及存储介质,以提高扰动响应对象的筛选方案的精准度。
2、根据本公开的一方面,提供了一种扰动响应对象的筛选系统,可以包括:
3、处理器,其被配置成:
4、针对预设的至少两个扰动条件中的每个扰动条件,确定扰动条件对应的至少一个细胞中的每个细胞在扰动条件下的第一表达数据,其中,第一表达数据用于表达与每个细胞均关联的至少一个对象;
5、获取对象异常概率,其中,对象异常概率用于分别表征至少一个对象中的每个对象受到至少两个扰动条件影响的概率;
6、根据对象异常概率以及每个细胞在扰动条件下的第一表达数据,得到至少一个细胞在扰动条件下的第二表达数据;
7、根据至少两个扰动条件分别对应的第二表达数据,进行损失计算以对对象异常概率进行调整,得到目标异常概率,并根据目标异常概率从至少一个对象中筛选出扰动响应对象。
8、根据本公开的另一方面,提供了一种扰动响应对象的筛选装置,配置于处理器中,该装置可以包括:
9、第一表达数据确定模块,用于针对预设的至少两个扰动条件中的每个扰动条件,确定扰动条件对应的至少一个细胞中的每个细胞在扰动条件下的第一表达数据,其中,第一表达数据用于表达与每个细胞均关联的至少一个对象;
10、对象异常概率获取模块,用于获取对象异常概率,其中对象异常概率用于分别表征至少一个对象中的每个对象受到至少两个扰动条件影响的概率;
11、第二表达数据得到模块,用于根据对象异常概率以及每个细胞在扰动条件下的第一表达数据,得到至少一个细胞在扰动条件下的第二表达数据;
12、扰动响应对象筛选模块,用于根据至少两个扰动条件分别对应的第二表达数据,进行损失计算以对对象异常概率进行调整,得到目标异常概率,并根据目标异常概率从至少一个对象中筛选出扰动响应对象。
13、根据本公开的另一方面,提供了一种扰动响应对象的筛选方法,可以包括:
14、针对预设的至少两个扰动条件中的每个扰动条件,确定扰动条件对应的至少一个细胞中的每个细胞在扰动条件下的第一表达数据,其中,第一表达数据用于表达与每个细胞均关联的至少一个对象;
15、获取对象异常概率,其中,对象异常概率用于分别表征至少一个对象中的每个对象受到至少两个扰动条件影响的概率;
16、根据对象异常概率以及每个细胞在扰动条件下的第一表达数据,得到至少一个细胞在扰动条件下的第二表达数据;
17、根据至少两个扰动条件分别对应的第二表达数据,进行损失计算以对对象异常概率进行调整,得到目标异常概率,并根据目标异常概率从至少一个对象中筛选出扰动响应对象。
18、根据本公开的另一方面,提供了一种计算机可读存储介质,其上存储有计算机指令,该计算机指令用于使处理器执行时实现本公开任意实施例所提供的扰动响应对象的筛选方法。
19、本公开实施例中的技术方案,针对预设的至少两个扰动条件中的每个扰动条件,通过确定与扰动条件对应的至少一个细胞中的每个细胞在扰动条件下的第一表达数据,该第一表达数据用于表达与每个细胞均关联的至少一个对象;获取对象异常概率,该对象异常概率分别用于表征至少一个对象中的每个对象受到至少两个扰动条件影响的概率;根据对象异常概率及每个细胞在扰动条件下的第一表达数据,得到至少一个细胞在扰动条件下的第二表达数据;进而,根据至少两个扰动条件分别对应的第二表达数据,进行损失计算以对对象异常概率进行调整,得到目标异常概率,然后根据目标异常概率从至少一个对象中筛选出扰动响应对象。上述技术方案,利用生物学中未受到扰动影响的对象在不同扰动条件下的第一表达数据具有稳定性,即第一表达数据与扰动条件之间具有独立性的特点,通过对象异常概率和第一表达数据得到不同扰动条件分别对应的第二表达数据,进而基于这些第二表达数据学习对象异常概率,并基于学习到的目标异常概率实现扰动响应对象的筛选过程,由此提高了筛选精度。
20、应当理解,本部分所描述的内容并非旨在标识本公开的实施例的关键或重要特征,也不用于限制本公开的范围。本公开的其它特征将通过以下的说明书而变得容易理解。
技术特征:1.一种扰动响应对象的筛选系统,其特征在于,包括:
2.根据权利要求1所述的系统,其特征在于,所述处理器,还被配置成:
3.根据权利要求2所述的系统,其特征在于,所述根据所述至少两个扰动条件分别对应的第二表达数据,进行损失计算以对所述对象异常概率进行调整,得到目标异常概率,包括:
4.根据权利要求3所述的系统,其特征在于,所述根据所述至少两个扰动条件分别对应的第二表达数据,得到所述至少两个扰动条件分别对应的第二表达数据之间的相似性,包括:
5.根据权利要求2所述的系统,其特征在于,所述至少一个细胞的数量包括至少两个,所述根据所述每个细胞在所述扰动条件下的概率数据,得到所述至少一个细胞在所述扰动条件下的第二表达数据,包括:
6.根据权利要求2所述的系统,其特征在于,在所述得到所述细胞在所述扰动条件下的概率数据之后,所述处理器,还被配置成:
7.根据权利要求1所述的系统,其特征在于,所述处理器,还被配置成:
8.根据权利要求7所述的系统,其特征在于,所述处理器,还被配置成:
9.根据权利要求8所述的系统,其特征在于,所述确定所述细胞对应的第一表达数据中已检测到的第一已测数据,包括:
10.根据权利要求7所述的系统,其特征在于,所述根据所述对象异常概率及所述每个细胞在所述扰动条件下的第一表达数据,得到所述至少一个细胞在所述扰动条件下的第二表达数据,包括:
11.根据权利要求1所述的系统,其特征在于,所述目标异常概率包括与所述至少一个对象分别对应的异常表达概率;
12.根据权利要求11所述的系统,其特征在于,所述扰动响应对象的数量为至少两个,所述处理器,还被配置成:
13.根据权利要求1-12中任一项所述的系统,其特征在于,所述至少一个对象的类型包括基因、染色质可及性或蛋白质。
14.一种扰动响应对象的筛选装置,其特征在于,配置于处理器中,所述装置包括:
15.一种扰动响应对象的筛选方法,其特征在于,应用于处理器中,所述方法包括:
16.一种计算机可读存储介质,其特征在于,所述计算机可读存储介质存储有计算机指令,所述计算机指令用于使处理器执行时实现如权利要求15所述的扰动响应对象的筛选方法。
技术总结本公开实施例公开一种扰动响应对象的筛选系统、装置、方法及存储介质。该系统可包括:处理器,其被配置成:针对预设的至少两个扰动条件中的每个扰动条件,确定与扰动条件对应的至少一个细胞中的每个细胞在扰动条件下的第一表达数据;获取对象异常概率;根据对象异常概率及每个细胞在扰动条件下的第一表达数据,得到至少一个细胞在扰动条件下的第二表达数据;进而,根据至少两个扰动条件分别对应的第二表达数据,进行损失计算以对对象异常概率进行调整,得到目标异常概率,并根据目标异常概率,从至少一个对象中筛选出扰动响应对象。本公开实施例的技术方案,可提高扰动响应对象的筛选精度。技术研发人员:杨梦,杨悦羽霄,谢彦铭受保护的技术使用者:深圳华大智造科技股份有限公司技术研发日:技术公布日:2024/9/12本文地址:https://www.jishuxx.com/zhuanli/20240914/294100.html
版权声明:本文内容由互联网用户自发贡献,该文观点仅代表作者本人。本站仅提供信息存储空间服务,不拥有所有权,不承担相关法律责任。如发现本站有涉嫌抄袭侵权/违法违规的内容, 请发送邮件至 YYfuon@163.com 举报,一经查实,本站将立刻删除。