一种利用SCD1遗传标记检测牛产奶性状的方法

本发明公开了一种利用scd1基因的snps检测牛产奶性状的方法，属于选育预测和选育牛产奶性状。

背景技术：

1、牛奶是人类饮食的重要组成部分。牛奶作为人类的营养来源，因其富含蛋白质、钙、锌和脂肪酸而广受欢迎。随着人们生活水平的提高和对饮食结构营养价值的重视，消费者们对乳制品的质量的要求也在与日俱增。

2、推进牛的遗传改良过程中筛选可用于辅助选择重要经济性状的分子标记不乏是一项重要工作。其中标记辅助选择（mas）就是一种重要的技术手段，主要通过早期阶段直接在dna水平上筛选个体之间不受环境和其他因素影响的核苷酸序列变异来完成。单核苷酸多态性（snps）是遗传多态性研究中使用最频繁的分子标记形式之一。分析snp位点与产奶性状的相关性，可作为辅助选择牛经济性状的分子标记广泛应用于畜牧业和农业研究。

3、硬脂酰辅酶a去饱和酶1（scd1）隶属于脂肪酸去饱和酶家族的一员，是调节脂肪酸代谢的关键酶。scd1可通过催化饱和脂肪酸（sfas）转化为单不饱和脂肪酸（mufas）进而影响动物体内的脂质合成。在牛中，scd1基因在乳腺和脂肪组织中呈现高表达水平。目前对牛scd1基因的研究大多集中于肉质性状和脂肪性状等，牛scd1基因多态性与牛产奶性状之间的相关性仍需进一步研究。

技术实现思路

1、本发明提供了一种scd1基因标记检测牛产奶性状的方法，利用scd1基因的snps作为预测和选育牛产奶性状的方法，为促进牛产奶性能的早期选育工作，并加快建立遗传资源优良的奶牛种群奠定基础。

2、本发明所述的一种scd1基因标记检测牛产奶性状的方法，以scd1基因的4个snp位点作为检测牛肉质性状分子标记的方法，其特征在于：

3、上述基因的遗传标记位点分别为牛scd1基因的g.21272246处的 snp1：a>g，g.21272306处的 snp2：t>c， g.21272422 处的snp3：c>t 和g.21272529处的snp4：a>g。

4、本发明所述的一种scd1基因标记检测牛产奶性状的方法，以scd1基因的4个遗传标记作为检测牛肉质性状分子标记，包括以下步骤：

5、第一步：采集大量健康待测牛的血液并进行抗凝处理，利用基因组dna提取试剂盒将样品中的dna提取出，并置于-80℃保存；

6、第二步：根据牛scd1基因序列设计下述引物：

7、scd1-f: ５’tccttgctccaccacttcc３’；

8、scd1-r: ５’ccacccagatgaccctactc３’；

9、第三步：将提取出的牛基因组dna各取0.5 μl混合均匀后作为模板，利用上述scd1基因引物对目的片段进行pcr扩增；pcr反应体系： taq pcr mix 10 μl，去离子水8.2 μl，上游引物0.4 μl，混池dna 1 μl，下游引物0.4 μl，共20 μl；pcr反应程序为：95℃预变性10min，95℃变性30 s，60℃退火55 s，72℃延伸30 s，循环35次；延伸72℃ 10 min；4℃备用；利用琼脂糖凝胶电泳对pcr扩增产物进行长度和质量的检测，4℃备用；

10、第四步：采用dna测序技术对pcr产物进行测序，使用序列分析软件筛查出scd1基因中存在的snp位点，再次利用上述引物对奶牛个体的scd1基因的目的片段进行pcr扩增并测序，随后根据scd1基因的4个snp位点基因型对样本群体进行分型，最后通过关联分析确定基因型与牛产奶性状的相关性。

11、本发明的积极效果在于：

12、获得并公开牛产奶性状相关的scd1基因g.21272246 a>g，g.21272306 t>c，g.21272422 c>t 和g.21272529 a>g的4个snp作为分子遗传标记，检测结果准确性高，可应用于牛产奶性能的早期分子选育，为进一步加快建立遗传资源优良的奶牛种群奠定基础。

技术特征：

1.一种scd1基因标记检测牛产奶性状的方法，以scd1基因作为牛产奶性状遗传标记中的技术手段，其特征在于：

2.如权利要求1所述的一种scd1基因标记检测牛产奶性状的方法，其特征在于根据牛scd1基因序列设计下述引物：

3.根据权利要求1所述的一种scd1基因标记检测牛产奶性状的方法，包括以下步骤：

技术总结本发明公开一种利用SCD1遗传标记检测牛产奶性状的方法，获得并公开牛产奶性状相关的SCD1基因g.21272246 A>G，g.21272306 T>C，g.21272422 C>T和g.21272529 A>G的4个SNP作为分子遗传标记，检测结果准确性高，可应用于牛产奶性能的早期分子选育，为进一步加快建立遗传资源优良的奶牛种群奠定基础。技术研发人员：杨润军,房希碧,张宇霄,刘月,刘瑞敏,卢鑫受保护的技术使用者：吉林大学技术研发日：技术公布日：2024/12/2