一种鸡的鸡冠大小性状的分子遗传标记及其应用

本发明涉及家禽基因工程育种，具体涉及一种鸡的鸡冠大小性状的分子遗传标记及其应用。

背景技术：

1、鸡冠是鸡的第二性征，是衡量鸡性成熟的关键指标。通常鸡冠大小随日龄增长而增长。然而，单冠鸡品种普遍存在同批次同品种个体鸡冠大小差异大的问题。鸡冠是鸡重要的包装性状，无论活鸡还是冰鲜销售，鸡冠均需要达到一定的发育程度，但鸡冠过大或过小都会影响鸡的销售，消费者喜欢并优先购买鸡冠大小适中的鸡，说明鸡冠大小影响鸡的经济价值。

2、目前鸡品种培育过程中对鸡冠的选择采用的是传统的选育方法，即在继代前利用对鸡冠大小进行测定，并根据测定的表型值，利用blup估计育种值进行选择。由于，鸡冠大小在早期难以测定，导致选种较迟，而增加饲养费用。此外，对鸡冠大小测定存在测定时间长以及测定精确度不够高等问题，导致选择效率低以及育种进展缓慢。

技术实现思路

1、针对现有技术不足，本发明提供一种鸡的鸡冠大小性状的分子遗传标记及其应用，利用全基因组关联分析法确定鸡的鸡冠大小性状的分子标记，用于鸡的鸡冠大小性状的分子标记辅助选择。

2、为实现以上目的，本发明的技术方案通过以下技术方案予以实现：

3、一种鸡的鸡冠大小性状的分子遗传标记，所述分子遗传标记为鸡肝配蛋白b1基因外显子2的29436位点snp即efnb1(29436：c>t)。

4、优选的，所述分子遗传标记的分型鉴定包括以下步骤

5、s1、设计合成pcr引物；

6、s2、利用鸡dna模板与引物进行pcr扩增，扩增得到如seq id no：1所示的核苷酸序列；

7、s3、对pcr产物测序后进行snp分型。

8、优选的，所述步骤s1中的pcr引物如下：

9、上游引物f：5’-gaacacctgggtgtgagtgt-3’；

10、下游引物r：5’-gttggggctgaactcctgaa-3’。

11、优选的，所述步骤s2中进行pcr扩增包括pcr反应体系和pcr反应程序。

12、优选的，所述pcr反应体系包括：添加模板dna 1μl，添加上游引物1μl，添加下游引物1μl，添加2×hiefftm pcrmastermix 10μl，添加ddh2o 7μl；

13、优选的，所述pcr反应程序包括以下步骤：

14、第一步94℃起始变性5min；

15、第二步94℃解链30s；

16、第三步64℃退火30s；

17、第四步72℃延伸1min，其中解链到延伸循环次数为35次；

18、第五步72℃最终延伸10min；

19、第六步4℃保存。

20、且该分子遗传标记应用于鸡的鸡冠大小性状的分子标记辅助选择。

21、本发明提供一种鸡的鸡冠大小性状的分子遗传标记及其应用，与现有技术相比优点在于：

22、本发明针对鸡的鸡冠大小性状的分子遗传标记设计引物进行pcr扩增，可以达到对鸡的鸡冠大小性状进行基因分型的目的，后采用分型结果进行分子标记辅助育种，可实现对鸡的鸡冠大小的早期选种，早淘汰不适合的种鸡，降低成本，提高选择准确性进而加快鸡的鸡冠大小性状育种进展。

技术特征：

1.一种鸡的鸡冠大小性状的分子遗传标记，其特征在于，所述分子遗传标记为鸡肝配蛋白b1基因外显子2的29436位点snp即efnb1(29436：c>t)。

2.根据权利要求1所述的一种鸡的鸡冠大小性状的分子遗传标记，其特征在于：所述分子遗传标记的分型鉴定包括以下步骤：

3.根据权利要求2所述的一种鸡的鸡冠大小性状的分子遗传标记，其特征在于：所述步骤s1中的pcr引物如下：

4.根据权利要求3所述的一种鸡的鸡冠大小性状的分子遗传标记，其特征在于：所述步骤s2中进行pcr扩增包括pcr反应体系和pcr反应程序。

5.根据权利要求4所述的一种鸡的鸡冠大小性状的分子遗传标记，其特征在于：所述pcr反应体系包括：添加模板dna 1μl，添加上游引物1μl，添加下游引物1μl，添加2×hiefftm pcrmastermix 10μl，添加ddh2o 7μl。

6.根据权利要求4所述的一种鸡的鸡冠大小性状的分子遗传标记，其特征在于：所述pcr反应程序包括以下步骤：

7.一种如权利要求1-6任一所述的鸡的鸡冠大小性状的分子遗传标记的应用，其特征在于，所述分子遗传标记应用于鸡的鸡冠大小性状的分子标记辅助选择。

技术总结本发明提供一种鸡的鸡冠大小性状的分子遗传标记及其应用，涉及家禽基因工程育种技术领域。所述鸡的鸡冠大小性状的分子遗传标记为鸡肝配蛋白B1基因外显子2的29436位点SNP即EFNB1(29436：C>T)，且不同基因型鸡的鸡冠大小关系为CC型>CT型>TT型，该位点可作为鸡的鸡冠大小性状的分子标记，用于鸡的鸡冠大小性状的分子标记辅助选择，实现对鸡的鸡冠大小的早期选种，早淘汰不适合的种鸡，降低成本，提高选择准确性进而加快鸡的鸡冠大小性状育种进展。技术研发人员：姜润深,邢朝辉,何鑫鑫,郭兴,黄媛媛,刘亚楠,汪芳杰,韦培培,王浩,肖家旭受保护的技术使用者：安徽农业大学技术研发日：技术公布日：2024/6/18