一种鉴定巴厘和MD2菠萝杂种真实性的SNP标记引物组及应用
- 国知局
- 2024-09-11 14:57:49
本发明属于菠萝杂交,具体涉及一种巴厘和md2菠萝杂种真实性的snp标记引物组及应用。
背景技术:
1、菠萝属于凤梨科凤梨属植物,其主要分布在我国的广东、海南、云南、广西、福建等地区。其中,‘巴厘’是生产中的主要栽培品种,占全国种植面积的70%,但是其面临着品种单一和退化导致采收期集中和品质下降等问题。目前解决该问题的手段主要是新品种的选育与推广。
2、杂交是菠萝新品种选育的常用方法,虽然一般认为菠萝是自交未亲和作物,但已有研究显示,其自交不亲和性受到品种、环境条件的影响,可能会出现部分自交亲和的现象,从而出现假杂种。此外,由于蜜蜂等昆虫进行传粉,也会导致假杂种的发生。因此,如何提高真杂种率是杂交育种面临的主要问题。去雄是常见的防止自交的方法,在甘蔗中,母本温水去雄后,杂种率提高;而通过套袋隔绝蜜蜂等昆虫的传粉是有效的方法。但是如果鉴定上述方法是否提高了杂种率,需要对菠萝真假杂种进行鉴定。并且,杂种真实性鉴定也是新品种选育和群体遗传研究的重要环节。
3、目前,菠萝杂种真实性鉴定主要是对品种进行多年多点的全生育期表型观察费时费力,且易受人为和环境因素的影响。同时,随着亲本的集中使用,杂交后代的表型差异逐渐减小,使得通过形态学特征鉴定真假杂种越发困难。
4、dna分子标记能够快速准确的鉴定品种的真伪,其操作简单、时效性好,广泛应用于苹果、柑橘、桃、葡萄、猕猴桃等多种果树上。而ssr标记技术和单核苷酸多态性技术(snp)被国际植物新品种保护联盟(upov)在bmt分子测试指南中推荐为品种鉴定或种子纯度鉴定的两种主要技术;但ssr分子标记存在检测位点较少、通量低且不易实现数据共享等问题,限制了其应用。而snp在基因组中分布密度高且均匀,基于其开发的分子标记具有可以实现高通量检测、更适合数据库的整合和共享等特点,被认为是最具有应用前景的分子标记技术。
技术实现思路
1、本发明就是通过不同处理方式进行杂交,基于snp开发了可用于‘md2’和‘巴厘’杂交后代真实性鉴定的snp标记引物组,可以对‘md2’和‘巴厘’为亲本的f1群体进行杂种真实性鉴定,为提高菠萝杂交育种效率及进一步开展遗传研究奠定基础。
2、为了达到上述目的,本发明可以采用以下技术方案:
3、本发明一方面提供一种鉴定巴厘和md2菠萝杂种真实性的snp标记引物组,snp标记引物组用于扩增以下snp标记中的一组或多组:(a)位于7号染色体的7033416,基因型为a/c;(b)位于11号染色体的10977352,基因型为a/g;(c)位于24号染色体的192195,基因型为g/c。
4、本发明另一方面提供一种鉴定巴厘和md2菠萝杂种真实性的检测试剂,其包括本发明中的snp标记引物组。
5、本发明再一方面提供一种鉴定巴厘和md2菠萝杂种真实性的检测试剂盒,其包括本发明中的snp标记引物组或本发明中的检测试剂。
6、本发明再一方面提供一种本发明中的snp标记引物组在制备用于鉴定巴厘和md2菠萝杂种真实性的检测产品中的应用。
7、本发明再一方面提供一种本发明中的snp标记引物组或本发明中的检测试剂或本发明中的检测试剂盒在菠萝遗传育种中的应用。
8、本发明再一方面提供一种本发明中的snp标记引物组或本发明中的检测试剂或本发明中的检测试剂盒在鉴定巴厘和md2菠萝杂种真实性中的应用。
9、本发明有益效果至少包括:本发明提供的鉴定巴厘和md2菠萝杂种真实性的snp标记引物组可以快速有效的鉴定巴厘和md2菠萝杂种的真实性,鉴定结果准确可靠,有利于菠萝的遗传育种。
技术特征:1.一种鉴定巴厘和md2菠萝杂种真实性的snp标记引物组,其特征在于,snp标记引物组用于扩增以下snp标记中的一组或多组:(a)位于7号染色体的7033416,基因型为a/c;(b)位于11号染色体的10977352,基因型为a/g;(c)位于24号染色体的192195,基因型为g/c。
2.根据权利要求1所述的鉴定巴厘和md2菠萝杂种真实性的snp标记引物组,其特征在于,扩增上述snp标记(a)的引物组包括如seq id no:1、seq id no:2、seq id no:3所示序列;扩增上述snp标记(b)的引物组包括如seq id no:4、seq id no:5、seq id no:6所示序列;扩增上述snp标记(c)的引物组包括如seq id no:7、seqid no:8、seq id no:9所示序列。
3.鉴定巴厘和md2菠萝杂种真实性的检测试剂,其特征在于,包括权利要求1或2所述的snp标记引物组。
4.根据权利要求3所述的检测试剂,其特征在于,还包括荧光试剂。
5.鉴定巴厘和md2菠萝杂种真实性的检测试剂盒,其特征在于,包括权利要求1或2所述的snp标记引物组或权利要求3或4所述的检测试剂。
6.权利要求1或2所述的snp标记引物组在制备用于鉴定巴厘和md2菠萝杂种真实性的检测产品中的应用。
7.权利要求1或2所述的snp标记引物组或权利要求3或4所述的检测试剂或权利要求5所述的检测试剂盒在菠萝遗传育种中的应用。
8.根据权利要求7所述的应用,其特征在于,应用包括:snp标记引物组或检测试剂或检测试剂盒在鉴定巴厘和md2菠萝杂种真实性中的应用。
9.权利要求1或2所述的snp标记引物组或权利要求3或4所述的检测试剂或权利要求5所述的检测试剂盒在鉴定巴厘和md2菠萝杂种真实性中的应用。
10.根据权利要求7至9中任一项权利要求所述的应用,其特征在于,当待测样本的基因型为纯合基因型,则为假杂种;当待测样本基因型为杂合基因型,则为真杂种。
技术总结本发明属于菠萝杂交技术领域,具体涉及一种巴厘和MD2菠萝杂种真实性的SNP标记引物组及应用。该SNP标记引物组用于扩增以下SNP标记中的一组或多组:(a)位于7号染色体的7033416,基因型为A/C;(b)位于11号染色体的10977352,基因型为A/G;(c)位于24号染色体的192195,基因型为G/C。该SNP标记引物组可以快速有效的鉴定巴厘和MD2菠萝杂种的真实性,鉴定结果准确可靠,有利于菠萝的遗传育种。技术研发人员:林文秋,贾盼盼,余虹霖,刘胜辉,吴青松受保护的技术使用者:中国热带农业科学院南亚热带作物研究所技术研发日:技术公布日:2024/9/9本文地址:https://www.jishuxx.com/zhuanli/20240911/292690.html
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