一种与结直肠癌易感和预后相关的免疫浸润功能遗传位点标记及其应用

本发明涉及于基因工程及肿瘤医学领域，具体涉及一种与结直肠癌易感和预后相关的免疫浸润功能位点标记及其应用。

背景技术：

1、结直肠癌作为一种常见的恶性消化道肿瘤，严重威胁我国人民健康，其发病率位列我国恶性肿瘤第三位，死亡率排名第二位。随着国家经济水平的发展、生活方式的改变以及人口老龄化的加剧，我国的结直肠癌负担日益严重，成为威胁民众健康的关键疾病之一。同时由于结直肠癌通常发病隐匿，大部分患者出现症状就诊时就已处于进展期。近年来，尽管肿瘤综合治疗手段不断提高，晚期结直肠癌患者的预后仍然不容乐观，总体5年生存率低于20％，并且25％～50％的结直肠癌患者确诊或后续治疗中会继续发展为转移性结直肠癌(metastasis colorectal cancer,mcrc)。逐年升高的发病率和晚期不良的预后，使其成为我国公共卫生领域亟需解决的关键问题。目前，在结直肠癌患者的临床治疗中，早期结直肠癌患者通常采用结直肠切除术治疗，而中晚期患者需要根据患者特异性和疾病特异性的分子靶向或免疫治疗药物，化疗是其主要治疗手段。随着精准治疗、个体化治疗的理念真正落实在肿瘤治疗当中，既往疗效不佳、生存期不乐观的肿瘤治疗得到了“质”的进步。肿瘤的精准治疗应当基于对肿瘤本质深入挖掘，寻找与肿瘤发生发展、转移预后相关的驱动基因以及分子标志物，来推动创新药物、创新技术的开发与应用，使得更多患者获益，并可以有效提高患者肿瘤的治疗率，且为国家节省大量的医疗支出。

2、近年来，以分子遗传学为基础的个体化筛查方案，成为结直肠癌高危人群筛查、分析结直肠癌肿瘤发生发展方向和预测患者预后结局的重点。同时结直肠癌作为一种由环境及遗传背景中的多元危险因素长期相互作用所致的复杂疾病，大部分结直肠癌具体的致病基因尚未完全阐明。随着对结直肠癌遗传突变图谱的深入描绘，我们发现仅凭借肿瘤细胞的突变特征并不能准确对肿瘤类型进行分类或预测患者的预后结局。有研究表明炎症反应作为宿主免疫防御系统的重要组成部分，炎症性肠病患者发生结直肠癌的风险是一般人群的1.7倍，这表明炎症在解决致病性感染、维持正常的肠道功能或促进肿瘤发生方面发挥核心作用。测序技术的发展提供了愈加充分的证据，表明肿瘤的发生发展除了依赖肿瘤细胞的遗传突变外，还取决于肿瘤细胞及其肿瘤微环境(tumor microenvironment,tme)的密切相互作用。肿瘤微环境是由癌症相关成纤维细胞、血管细胞和浸润的免疫细胞组成的复杂系统，在结直肠癌发生发展的各个阶段都发挥着重要作用。因此，描绘结直肠癌肿瘤微环境的细胞组成并探讨其影响因素有助于剖析结直肠癌发生发展及预后的机制。

3、既往研究发现机体对肿瘤的免疫应答过程受到多种因素的影响，其中胚系遗传变异对免疫反应的研究并不充分。对多种癌症的全基因组关联研究(genome-wideassociation study,gwas)得到的风险位点进行精细定位和功能注释，发现遗传变异能够通过免疫应答反应介导癌症风险，甚至能通过调控关键基因导致免疫细胞含量改变，使得免疫系统对肿瘤的应答过程发生改变，进而影响癌症的发生发展和患者预后。因此，通过在全基因组范围内系统鉴定影响肿瘤免疫细胞浸润的遗传变异，同时通过结直肠癌immunqtl(immunity quantification trait loci，immunqtl)图谱鉴定能影响肿瘤进程和治疗预后的免疫浸润功能遗传位点的生物标志物，是揭示肿瘤免疫应答和患者预后结局的一个关键切入点，有助于指导结直肠癌的患者分层、个体化精准医疗以及预测患者预后结局。

技术实现思路

1、本发明的目的在于克服现有技术的不足，本发明的目的是提供一种与结直肠癌易感和预后相关的免疫浸润功能遗传位点标记及其应用。

2、一种与结直肠癌易感和预后相关的免疫浸润功能遗传位点的标志物，该标志物为rs1360948。

3、具体为结直肠癌易感和预后相关的免疫浸润功能遗传位点rs1360948标记的检测试剂在制备结直肠癌高危人群筛查和结直肠癌患者预后预测试剂盒中的应用。

4、上述的结直肠癌高危人群筛查和结直肠癌患者预后预测试剂盒包括rs1360948的特异性扩增引物和上述功能遗传位点标记的特异性探针，所述特异性扩增引物序列为seqid no：1和seq id no：2，探针序列为seq id no：3和seq id no：4。

5、本发明的有益效果为：从分子生物学及基因诊断水平上，提供了筛选结直肠癌易感高危人群与预测结直肠癌患者预后结局的技术方法。此方法基于我们前期的研究显示，rs1360948位点与中国人群的结直肠癌易感及预后相关。通过针对rs1360948位点进行巧妙的引物和探针设计，依靠荧光定量pcr，可对正常人群或结直肠癌患者人群进行rs1360948变异的检测，从而鉴别结直肠癌的高危人群，辅助结直肠癌患者的早期筛查及诊断，预测结直肠癌患者的生存结局。该技术方法设计巧妙、简易可行、结果准确可靠，可在各级医院进行推广，对于评估结直肠癌的患病风险及患者结局预测提供了帮助，有助于临床上对该类人群进行结直肠癌筛查和早期干预。

技术特征：

1.一种与结直肠癌易感和预后相关的免疫浸润功能遗传位点的标志物，其特征在于，该标志物为rs1360948。

2.结直肠癌易感和预后相关的免疫浸润功能遗传位点rs1360948标记的检测试剂在制备结直肠癌高危人群筛查和结直肠癌患者预后预测试剂盒中的应用。

3.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，所述检测试剂包括位点rs1360948的特异性扩增引物和特异性探针，所述特异性扩增引物序列为seq id no：1和seq id no：2，特异性探针序列为seq id no：3和seq id no：4。

技术总结本发明涉及一种与结直肠癌易感和预后相关的免疫浸润功能遗传位点及其应用，该标志物为rs1360948。rs1360948位点具有最显著结直肠癌immunQTL效应值，且携带rs1360948[G]基因型的个体更易与转录因子PRDM1结合，从而引起靶基因CCL2表达升高，促进癌细胞增殖，导致个体结直肠癌患病风险增加以及结直肠癌患者预后不良。通过针对rs1360948位点进行巧妙的引物和探针设计，能依靠荧光定量PCR，对正常人群或结直肠癌患者进行rs1360948危险位点的检测，能鉴别结直肠癌的高危人群以及预测结直肠癌患者预后结局，辅助筛查结直肠癌高危人群及结直肠癌患者出现不良预后结局可能的人群。技术研发人员：田剑波,蔡祎旻,缪小平,鲁泽群,谌灿,陈志睿受保护的技术使用者：武汉大学技术研发日：技术公布日：2024/9/29