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一种靶向新型冠病毒高度保守基因序列的siRNA

  • 国知局
  • 2024-10-21 15:06:13

本发明涉及生物医药,尤其涉及一种靶向新型冠病毒高度保守基因序列的sirna。

背景技术:

1、新型冠状病毒(sars-cov-2),属于β冠状病毒,其引起的新冠病毒病(covid-19)给人民生命安全和身体健康造成了严重威胁。sars-cov-2属单链rna病毒,易发生变异,虽然现有的疫苗和抗病毒疗法能有效减轻covid-19的疾病负担和死亡率,但病毒的快速变异导致高关注变异毒株(voc)的不断出现,造成病毒对现有疫苗及抗病毒疗法的逃逸和耐药性,给现有的疗法带来了严峻挑战。目前仍缺乏直接针对sars-cov-2的特异性治疗方法,特别是能覆盖多种新冠病毒变异株的广谱抗病毒药物,因此迫切需要开发靶向现有以及潜在病毒变异株的抗病毒药物。

2、小干扰rna(sirna)介导的rna干扰技术,通过诱导目标rna的快速和特异性降解从而实现高效的基因沉默,因此能够以序列特异性的方式有效抑制靶基因的表达,在抗病毒和其他疾病的治疗中显示出巨大的潜力。

技术实现思路

1、本发明的目的在于克服现有技术的不足之处而提供具有广谱抗新冠病毒作用的一种靶向新型冠病毒高度保守基因序列的sirna。

2、为实现上述目的,本发明采取的技术方案为:

3、第一方面,本发明提供了一种抗新型冠状病毒的sirna组合,所述sirna组合含有sirna1~18中的至少一组;

4、所述sirna1的正义链的核苷酸序列如seq id no:1所示,反义链的核苷酸序列如seq id no:2所示;

5、所述sirna2的正义链的核苷酸序列如seq id no:3所示,反义链的核苷酸序列如seq id no:4所示;

6、所述sirna3的正义链的核苷酸序列如seq id no:5所示,反义链的核苷酸序列如seq id no:6所示;

7、所述sirna4的正义链的核苷酸序列如seq id no:7所示,反义链的核苷酸序列如seq id no:8所示;

8、所述sirna5的正义链的核苷酸序列如seq id no:9所示,反义链的核苷酸序列如seq id no:10所示;

9、所述sirna6的正义链的核苷酸序列如seq id no:11所示,反义链的核苷酸序列如seq id no:12所示;

10、所述sirna7的正义链的核苷酸序列如seq id no:13所示,反义链的核苷酸序列如seq id no:14所示;

11、所述sirna8的正义链的核苷酸序列如seq id no:15所示,反义链的核苷酸序列如seq id no:16所示;

12、所述sirna9的正义链的核苷酸序列如seq id no:17所示,反义链的核苷酸序列如seq id no:18所示;

13、所述sirna10的正义链的核苷酸序列如seq id no:19所示,反义链的核苷酸序列如seq id no:20所示;

14、所述sirna11的正义链的核苷酸序列如seq id no:21所示,反义链的核苷酸序列如seq id no:22所示;

15、所述sirna12的正义链的核苷酸序列如seq id no:23所示,反义链的核苷酸序列如seq id no:24所示;

16、所述sirna13的正义链的核苷酸序列如seq id no:25所示,反义链的核苷酸序列如seq id no:26所示;

17、所述sirna14的正义链的核苷酸序列如seq id no:27所示,反义链的核苷酸序列如seq id no:28所示;

18、所述sirna15的正义链的核苷酸序列如seq id no:29所示,反义链的核苷酸序列如seq id no:30所示;

19、所述sirna16的正义链的核苷酸序列如seq id no:31所示,反义链的核苷酸序列如seq id no:32所示;

20、所述sirna17的正义链的核苷酸序列如seq id no:33所示,反义链的核苷酸序列如seq id no:34所示;

21、所述sirna18的正义链的核苷酸序列如seq id no:35所示,反义链的核苷酸序列如seq id no:36所示。

22、本发明通过开发靶向sars-cov-2基因组高度保守区域的sirna,有效抑制新冠病毒的复制。

23、第二方面,本发明提供了所述sirna组合在制备抗新型冠状病毒的药物中的应用。

24、第三方面,本发明提供了所述sirna组合在制备预防和/或治疗新型冠状病毒引起的疾病的药物中的应用。

25、进一步地,所述药物为抑制新型冠状病毒复制的药物。

26、进一步地,所述药物为靶向新型冠状病毒基因中的nsp1_n、nsp1_c、nucleocapsid、rdrp、spike_s2、spike_rbd、spike_ntd、nsp13_stem、nsp13_1b、nsp13_helicase、nsp13_zbd、nsp14、nsp15_nendou domain、nsp15_middledomain、nsp3_single-stranded poly(a)binding domain、nsp3_plpro、nsp3_c和nsp5中的至少一种的药物。

27、所述nsp1_n在ncbi上的登录号为:yp_009725297.1,所述nsp1_c在ncbi上的登录号为:yp_009725297.1,所述nucleocapsid在ncbi上的登录号为:yp_009724397.2,所述rdrp在ncbi上的登录号为:yp_009725307.1,所述spike_s2在ncbi上的登录号为:yp_009724390.1,所述spike_在ncbi上的登录号为:yp_009724390.1,所述spike_ntd在ncbi上的登录号为:yp_009724390.1,所述nsp13_stem在ncbi上的登录号为:yp_009725308.1,所述nsp13_1b在ncbi上的登录号为:yp_009725308.1,所述nsp13_helicase在ncbi上的登录号为:yp_009725308.1,所述nsp13_zbd在ncbi上的登录号为:yp_009725308.1,所述nsp14在ncbi上的登录号为:yp_009725309.1,所述nsp15_nendou domain在ncbi上的登录号为:yp_009725310.1,所述nsp15_middledomain在ncbi上的登录号为:yp_009725310.1,所述nsp3_single-stranded poly(a)binding domain在ncbi上的登录号为:yp_009725299.1,所述nsp3_plpro在ncbi上的登录号为:yp_009725299.1,所述nsp3_c在ncbi上的登录号为:yp_009725299.1,所述nsp5在ncbi上的登录号为:yp_009725301.1。

28、进一步地,所述sirna1靶向新型冠状病毒nsp1_n,所述sirna2靶向新型冠状病毒nsp1_c,所述sirna3靶向新型冠状病毒nucleocapsid,所述sirna4靶向新型冠状病毒rdrp,所述sirna5靶向新型冠状病毒spike_s2,所述sirna6靶向新型冠状病毒spike_rbd,所述sirna7用于新型冠状病毒spike_ntd,所述sirna8靶向新型冠状病毒nsp13_stem,所述sirna9靶向新型冠状病毒nsp13_1b,所述sirna10靶向新型冠状病毒nsp13_helicase,所述sirna11靶向新型冠状病毒nsp13_zbd,所述sirna12靶向新型冠状病毒nsp14,所述sirna13靶向新型冠状病毒nsp15_nendou domain,所述sirna14靶向新型冠状病毒nsp15_middledomain,所述sirna15靶向新型冠状病毒nsp3_single-stranded poly(a)bindingdomain,所述sirna16靶向新型冠状病毒nsp3_plpro,所述sirna17靶向新型冠状病毒nsp3_c,所述sirna18靶向新型冠状病毒nsp5。

29、第四方面,本发明提供了一种预防和/或治疗新型冠状病毒引起的疾病的药物,所述药物中含有所述的sirna组合。

30、进一步地,所述药物为抗新型冠状病毒的药物。

31、在本发明具体实施方式中,所述药物为抑制新型冠状病毒复制的药物。

32、进一步地,所述药物靶向新型冠状病毒基因中的nsp1_n、nsp1_c、nucleocapsid、rdrp、spike_s2、spike_rbd、spike_ntd、nsp13_stem、nsp13_1b、nsp13_helicase、nsp13_zbd、nsp14、nsp15_nendou domain、nsp15_middledomain、nsp3_single-stranded poly(a)binding domain、nsp3_plpro、nsp3_c和nsp5中的至少一种的药物,所述药物中含有所述的sirna组合。

33、进一步地,所述nsp1_n在ncbi上的登录号为:yp_009725297.1,所述nsp1_c在ncbi上的登录号为:yp_009725297.1,所述nucleocapsid在ncbi上的登录号为:yp_009724397.2,所述rdrp在ncbi上的登录号为:yp_009725307.1,所述spike_s2在ncbi上的登录号为:yp_009724390.1,所述spike_rbd在ncbi上的登录号为:yp_009724390.1,所述spike_ntd在ncbi上的登录号为:yp_009724390.1,所述nsp13_stem在ncbi上的登录号为:yp_009725308.1,所述nsp13_1b在ncbi上的登录号为:yp_009725308.1,所述nsp13_helicase在ncbi上的登录号为:yp_009725308.1,所述nsp13_zbd在ncbi上的登录号为:yp_009725308.1,所述nsp14在ncbi上的登录号为:yp_009725309.1,所述nsp15_nendoudomain在ncbi上的登录号为:yp_009725310.1,所述nsp15_middledomain在ncbi上的登录号为:yp_009725310.1,所述nsp3_single-stranded poly(a)binding domain在ncbi上的登录号为:yp_009725299.1,所述nsp3_plpro在ncbi上的登录号为:yp_009725299.1,所述nsp3_c在ncbi上的登录号为:yp_009725299.1,所述nsp5在ncbi上的登录号为:yp_009725301.1。

34、进一步地,所述sirna1靶向新型冠状病毒nsp1_n,所述sirna2靶向新型冠状病毒nsp1_c,所述sirna3靶向新型冠状病毒nucleocapsid,所述sirna4靶向新型冠状病毒rdrp,所述sirna5靶向新型冠状病毒spike_s2,所述sirna6靶向新型冠状病毒spike_rbd,所述sirna7用于新型冠状病毒spike_ntd,所述sirna8靶向新型冠状病毒nsp13_stem,所述sirna9靶向新型冠状病毒nsp13_1b,所述sirna10靶向新型冠状病毒nsp13_helicase,所述sirna11靶向新型冠状病毒nsp13_zbd,所述sirna12靶向新型冠状病毒nsp14,所述sirna13靶向新型冠状病毒nsp15_nendou domain,所述sirna14靶向新型冠状病毒nsp15_middledomain,所述sirna15靶向新型冠状病毒nsp3_single-stranded poly(a)bindingdomain,所述sirna16靶向新型冠状病毒nsp3_plpro,所述sirna17靶向新型冠状病毒nsp3_c,所述sirna18靶向新型冠状病毒nsp5。

35、进一步地,所述药物还含有制药学上可接受的添加剂或/和赋形剂或/和载体。

36、与现有技术相比,本发明的有益效果为:本技术开发的18条sirna(核苷酸序列如seq id no:1~36所示)靶向新型冠状病毒基因组中的多个高度保守区域,包括nsp1_n、nsp1_c、nucleocapsid、rdrp、spike_s2、spike_rbd、spike_ntd、nsp13_stem、nsp13_1b、nsp13_helicase、nsp13_zbd、nsp14、nsp15_nendou domain、nsp15_middledomain、nsp3_single-stranded poly(a)binding domain、nsp3_plpro、nsp3_c和nsp5,能有效抑制新型冠状病毒的复制,用于制备预防和治疗新型冠状病毒引起的疾病的药物。

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