与花生含油量性状紧密连锁的InDel分子标记、检测该分子标记的引物对及应用

本发明属于分子标记辅助育种，具体涉及与花生含油量性状紧密连锁的indel分子标记、检测该分子标记的引物对及应用。

背景技术：

1、花生作为重要的油料作物之一，含油量是评价高油种质的重要指标。花生含油量属于数量性状，表型变异呈连续性且受多基因控制，通过近红外仪器检测时由于花生籽仁间存在空隙导致检测过程存在误差，其次花生体内油脂成分也会随时间变化而变化，仅通过物理检测方法无法真正解析其控制油脂合成机理。因此探究其与高油相关分子标记，对于挖掘花生优异遗传位点，培育高油花生新品种具有重要理论意义。迄今为止已克隆出许多花生品质性状相关分子标记，包括氨基酸、油酸，蔗糖；但对于花生中高油相关基因的定位鲜有研究。基于花生基因组数据平台与高通量测序的发展和完善，四倍体野生种、四倍体栽培种的全基因组数据也可以公开获取，这就使研究者花生基因组数据的掌握越来越完善，使基因的精细定位和图位克隆成为可能。

技术实现思路

1、针对现有技术中存在的问题，本发明的目的在于提供与花生含油量性状紧密连锁的indel分子标记、检测该分子标记的引物对及应用。

2、为了达到上述目的，本发明采用如下技术方案：

3、与花生含油量性状紧密连锁的indel分子标记，所述分子标记为arahy36753720；其核酸序列如seq id no:1所示。

4、上述与花生含油量性状紧密连锁的indel分子标记的应用，为a-c中的至少一种；

5、a. 用于制备预测花生含油量的试剂；

6、b. 用于预测花生含油量；

7、c. 用于高油含量花生选育。

8、在上述方案的基础上，所述预测花生含油量的试剂包含检测分子标记arahy36753720的引物对。

9、在上述方案的基础上，所述检测arahy36753720分子标记的引物对如seq id no:2和seq id no:3所示。

10、在上述方案的基础上，用于预测花生含油量时，以待测花生基因组dna为模板，采用seq id no:2和seq id no:3所示的引物对进行pcr扩增，检测扩增产物；

11、当扩增产物为274bp的单一条带时，则待测花生样品为低油含量花生品种；

12、当扩增产物为252bp的单一条带，或274bp和252bp两条带时，待测花生样品为高油含量花生品种。

13、在上述方案的基础上，所述用于高油含量花生选育，是在育种过程中采用arahy36753720分子标记鉴定或筛选群体中高油的花生品种。

14、在上述方案的基础上，所述高油含量花生选育方法如下：

15、以高油和低油的花生品种作为亲本进行杂交，采用近红外光谱法筛选f1代杂交种中含油量≥54%的花生材料；将筛选的具有高油性状的f1自交种植获得f2；f2连续自交通过单粒传法构建重组自交系群体，每次自交后筛选综合性状良好的单株，辅助采用arahy36753720分子标记对其含油表型进行鉴定，筛选群体中综合性状良好且高油性状稳定的花生品系，用作扩繁材料。

16、在上述方案的基础上，在育种过程中采用arahy36753720分子标记来鉴定或筛选群体中高油的花生品种时，以待测花生基因组dna为模板，采用seq id no:2和seq id no:3所示的引物对进行pcr扩增，检测扩增产物；

17、当扩增产物为274bp的单一条带时，则待测花生样品为低油含量花生品种；

18、当扩增产物为252bp的单一条带，或274bp和252bp两条带时，待测花生样品为高油含量花生品种。

19、检测上述与花生含油量性状紧密连锁的indel分子标记的引物对，检测arahy36753720分子标记的引物对如seq id no:2和seq id no:3所示。

20、本发明技术方案的优点

21、（1）本发明开发了一个花生高低油基因相关位点，并提供了与花生高低油含油量连锁的分子标记arahy36753720。

22、（2）通过检测本发明分子标记预测花生含油量的方法快速简便，选择效率高，直接通过pcr扩增及电泳即可实现，只需要检测这些标记的扩增条带的大小，技术要求简单，采用常规仪器可操作；具有快速、高效、成本低的特点。由此有目的的筛选高油花生品种或品系，一方面有助于基因的精细定位及克隆，另一方面对于花生分子育种，加快花生高油品系的培育过程都具有重要的应用价值。

23、（3）辅助育种选择目标明确，节约成本。通过标记检测花生高油基因位点，可以在收获种子后即可鉴定出含油量较高的单株，选择保留，淘汰其他单株，可有效控制育种规模，提高高油品种选择育种的进程和效率。

24、综上，通过检测本发明分子标记预测花生含油量的方法具有快速简便，选择效率高，直接通过pcr扩增及电泳即可实现，在预测花生含油量以及选育高油含量花生中具有重要的应用价值。

技术特征：

1.与花生含油量性状紧密连锁的indel分子标记，其特征在于，所述分子标记为arahy36753720；其核酸序列如seq id no:1所示。

2.一种根据权利要求1所述的与花生含油量性状紧密连锁的indel分子标记的应用，其特征在于，为a-c中的至少一种；

3.根据权利要求2所述与花生含油量性状紧密连锁的indel分子标记的应用，其特征在于，所述预测花生含油量的试剂包含检测分子标记arahy36753720的引物对。

4.根据权利要求3所述与花生含油量性状紧密连锁的indel分子标记的应用，其特征在于，所述检测arahy36753720分子标记的引物对如seq id no:2和seq id no:3所示。

5.根据权利要求2所述与花生含油量性状紧密连锁的indel分子标记的应用，其特征在于，用于预测花生含油量时，以待测花生基因组dna为模板，采用seq id no:2和seq id no:3所示的引物对进行pcr扩增，检测扩增产物；

6.根据权利要求2所述与花生含油量性状紧密连锁的indel分子标记的应用，其特征在于，所述用于高油含量花生选育，是在育种过程中采用arahy36753720分子标记鉴定或筛选群体中高油的花生品种。

7.根据权利要求6所述与花生含油量性状紧密连锁的indel分子标记的应用，其特征在于，所述高油含量花生选育方法如下：

8.根据权利要求7所述与花生含油量性状紧密连锁的indel分子标记的应用，其特征在于，在育种过程中采用arahy36753720分子标记来鉴定或筛选群体中高油的花生品种时，以待测花生基因组dna为模板，采用seq id no:2和seq id no:3所示的引物对进行pcr扩增，检测扩增产物；

9.一种检测权利要求1所述与花生含油量性状紧密连锁的indel分子标记的引物对，其特征在于，检测arahy36753720分子标记的引物对如seq id no:2和seq id no:3所示。

技术总结本发明公开了与花生含油量性状紧密连锁的InDel分子标记、检测该分子标记的引物对及应用，属于分子标记辅助育种技术领域。本发明InDel标记为Arahy36753720；所述Arahy36753720分子标记的核酸序列如SEQ ID NO:1所示。通过检测本发明分子标记预测花生含油量的方法具有快速简便，选择效率高，直接通过PCR扩增及电泳即可实现，在预测花生含油量以及选育高油含量花生中具有重要的应用价值。技术研发人员：唐艳艳,任建军,于复欣,周莫,王斯铭,张开元,乔利仙,邓立苗,赵立波,朱虹受保护的技术使用者：青岛农业大学技术研发日：技术公布日：2025/1/6