一种评估脐尿管癌预后生存的生物标志物及其应用

本发明涉及生物医药领域，特别是涉及一种评估脐尿管癌预后生存的生物标志物及其应用。

背景技术：

1、脐尿管癌是一种罕见且高度恶性的泌尿系统肿瘤，预后较差，在膀胱癌中仅占0.35％-0.70％。脐尿管癌隐匿的发病方式常导致大多数患者确诊时已经是晚期，且预后通常很差，手术也难以获得满意的疗效。尽管脐尿管癌已经研究了几十年，但对其机制和发病机理的系统研究仍处于起步阶段，并且目前仍然缺乏临床上能够被广泛认可的指南。

2、肿瘤免疫微环境(tumor immune microenvironment，time)包括肿瘤细胞、免疫细胞、基质细胞及其他成分之间的相互作用，显著影响恶性肿瘤的预后。lewis等人已经证明了肿瘤相关巨噬细胞通过产生血管内皮生长因子a来改变肿瘤微环境，进而影响乳腺癌的进展。不同的免疫细胞亚群，如m1和m2巨噬细胞，在肿瘤进展中可能发挥相反的作用。尽管先前的研究已经探讨了脐尿管癌与尿路上皮癌或结直肠癌的共同点和差异，但对免瘤细胞浸润等免疫景观的全面评估仍然不足。现有关于脐尿管癌time的研究表明，dna错配修复缺陷的患者表现出更高的第三类淋巴结构和更好的预后。此外，与免疫抑制有关的cd3+t细胞、cd8+t细胞和cd68+细胞与脐尿管癌的预后不良相关。因此，各种免疫细胞亚群在脐尿管癌中的不同作用需要进一步探索。

3、目前的研究发现，包括cd11b、cd14、cd16、cd68和cd163在内的多种髓系免疫细胞标志物的表达水平与多种恶性肿瘤的预后相关。cd11b是cd11b/cd18(αmβ2、cr3、mac-1)的关键整合素α-链，在多种细胞中表现出促炎和调节作用，包括单核细胞、中性粒细胞、dc细胞和大多数免疫细胞。在结直肠癌中，cd11b+pmn-mdscs的积累与对免疫检查点抑制剂的反应性降低和预后较差有关。cd16在单核细胞的一个亚群中表达，通过激活nk细胞与改善预后相关。cd68是一种泛巨噬细胞标记物，与各种恶性肿瘤的预后改善相关，包括结肠癌、胃癌和子宫内膜癌。尽管这些髓系免疫细胞标志物对多种恶性肿瘤的预后产生重要的影响，但是这些髓系免疫细胞标志物对脐尿管癌的预后作用仍然并不明确。

技术实现思路

1、本发明的目的是提供一种评估脐尿管癌预后生存的标志物及其应用，以解决上述现有技术存在的问题，本发明以cd16基因、cd68基因和cd11b基因为生物标志物，构建了一个脐尿管癌预后生存风险评分模型，在训练集和验证集中进行验证，验证了该模型具有稳健的预测能力，为预测和改善脐尿管癌患者的预后提供了一种新方法。

2、为实现上述目的，本发明提供了如下方案：

3、本发明提供一种评估脐尿管癌预后生存的生物标志物，所述生物标志物包括cd16基因、cd68基因和cd11b基因。

4、本发明还提供检测所述的生物标志物在肿瘤间质中表达水平的试剂在制备评估脐尿管癌预后生存的产品中的应用。

5、本发明还提供一种评估脐尿管癌预后生存的产品，包括检测权所述的生物标志物在肿瘤间质中表达水平的试剂。

6、本发明还提供一种脐尿管癌预后生存风险评分的装置，所述装置包括计算模块，所述计算模块利用脐尿管癌预后生存风险评分模型计算风险评分；

7、所述脐尿管癌预后生存风险评分模型以生物标志物在肿瘤间质中的表达水平作为输入变量计算风险评分；所述生物标志物包括cd16基因、cd68基因和cd11b基因；

8、所述脐尿管癌预后生存风险评分模型的计算公式为：风险评分＝0.00295×cd16基因在肿瘤间质中的表达水平-0.00176×cd68基因在肿瘤间质中的表达水平+0.00600×cd11b基因在肿瘤间质中的表达水平+0.789804。

9、进一步地，所述装置还包括检测模块，所述检测模块用于检测所述生物标志物在肿瘤间质中的表达水平。

10、进一步地，所述装置还包括评估模块，所述评估模块用于执行根据所述计算模块的计算结果判断受试者脐尿管癌预后生存的结果，给出合理化预防和治疗建议；

11、所述受试者脐尿管癌预后生存的结果判断方法为：当所述计算模块的计算结果为风险评分≥0.88976，则受试者判定为高风险；当所述计算模块的计算结果为风险评分<0.88976，则受试者判定为低风险；判定为高风险的受试者预后效果不佳。

12、进一步地，所述装置还包括结果显示模块，所述结果显示模块用于显示所述评估模块得出的结论。

13、进一步地，所述结果显示模块通过屏幕显示、声音播报或打印的方式显示结果。

14、本发明还提供一种计算机可读存储介质，所述计算机可读存储介质包括存储的计算机程序，其中，在所述的计算机程序运行时控制所述的计算机可读存储介质所在装置中的计算模块执行脐尿管癌预后生存风险评分模型计算风险得分；

15、所述脐尿管癌预后生存风险评分模型以生物标志物在肿瘤间质中的表达水平作为输入变量计算风险评分；所述生物标志物包括cd16基因、cd68基因和cd11b基因；

16、所述脐尿管癌预后生存风险评分模型的计算公式为：风险评分＝0.00295×cd16基因在肿瘤间质中的表达水平-0.00176×cd68基因在肿瘤间质中的表达水平+0.00600×cd11b基因在肿瘤间质中的表达水平+0.789804。

17、本发明还提供所述的生物标志物在构建脐尿管癌预后生存风险评分模型中的应用。

18、本发明公开了以下技术效果：

19、本发明利用免疫组织化学方法评估了脐尿管癌的肿瘤(t)和间质(s)区域中的time标志物，筛选出3个与脐尿管癌预后生存显著相关的生物标志物，并以此构建了一个脐尿管癌预后生存风险评分模型(riskscore)，该风险评分模型的预测能力优秀，评估方式简单，具有较高的临床应用价值。

20、本发明以肿瘤微环境为研究背景，以免疫细胞标志物分子为着力点，通过结合客观的分子特征，使得模型具有更强的解释能力，本发明构建的脐尿管癌预后生存风险评分模型是目前脐尿管癌最大的回顾性研究队列，在基于大量样本的基础上构建，结合了多种患者基线特征，模型的表现十分稳定。本发明为预测和改善脐尿管癌患者的预后提供了一种新方法。

技术特征：

1.一种评估脐尿管癌预后生存的生物标志物，其特征在于，所述生物标志物包括cd16基因、cd68基因和cd11b基因。

2.检测权利要求1所述的生物标志物在肿瘤间质中表达水平的试剂在制备评估脐尿管癌预后生存的产品中的应用。

3.一种评估脐尿管癌预后生存的产品，其特征在于，包括检测权利要求1所述的生物标志物在肿瘤间质中表达水平的试剂。

4.一种脐尿管癌预后生存风险评分的装置，其特征在于，所述装置包括计算模块，所述计算模块利用脐尿管癌预后生存风险评分模型计算风险评分；

5.根据权利要求4所述的装置，其特征在于，所述装置还包括检测模块，所述检测模块用于检测所述生物标志物在肿瘤间质中的表达水平。

6.根据权利要求5所述的装置，其特征在于，所述装置还包括评估模块，所述评估模块用于执行根据所述计算模块的计算结果判断受试者脐尿管癌预后生存的结果，给出合理化预防和治疗建议；

7.根据权利要求6所述的装置，其特征在于，所述装置还包括结果显示模块，所述结果显示模块用于显示所述评估模块得出的结论。

8.根据权利要求7所述的装置，其特征在于，所述结果显示模块通过屏幕显示、声音播报或打印的方式显示结果。

9.一种计算机可读存储介质，其特征在于，所述计算机可读存储介质包括存储的计算机程序，其中，在所述的计算机程序运行时控制所述的计算机可读存储介质所在装置中的计算模块执行脐尿管癌预后生存风险评分模型计算风险得分；

10.如权利要求1所述的生物标志物在构建脐尿管癌预后生存风险评分模型中的应用。

技术总结本发明公开了一种评估脐尿管癌预后生存的生物标志物及其应用，属于生物医药领域。本发明利用免疫组织化学方法评估了脐尿管癌的肿瘤(T)和间质(S)区域中的TIME标志物，筛选出3个与脐尿管癌预后生存显著相关的生物标志物，所述生物标志物包括CD16基因、CD68基因和CD11b基因。本发明以所述生物标志物构建了一个脐尿管癌预后生存风险评分模型(Riskscore)，该风险评分模型的预测能力优秀，评估方式简单，具有较高的临床应用价值，为预测和改善脐尿管癌患者的预后提供了一种新方法。技术研发人员：陈恒鑫,周泰来,陈敏丰受保护的技术使用者：中南大学湘雅医院技术研发日：技术公布日：2024/6/18