一种lncRNA分子及其在抗轮状病毒复制中的应用

本发明属于生物医药，具体涉及一种轮状病毒增殖相关的lncrna分子及其在抗轮状病毒复制中的应用。

背景技术：

1、轮状病毒感染是导致婴幼儿腹泻病的最常见的病因，世界上几乎每个儿童五岁以前都至少感染过一次轮状病毒。到目前为止，尚没有特效疗法。虽然已有相应的疫苗可以预防和控制轮状病毒的感染，但每年由于rv感染引起的儿童肠胃炎病例数仍然达到约1.25亿，导致约20万例儿童死亡。rv属于呼肠孤病毒属，是一种无包膜的二十面体形状的双链rna病毒。基因组不连续，由11个节段的双链rna组成，编码6种结构蛋白(vp1-4, 6, 7)和6种非结构蛋白(nsp1-6)。感染细胞后，轮状病毒将自身核酸释放进入细胞质，并在细胞质中利用宿主因子合成产生用于病毒复制和包装的蛋白质。在病毒感染后两小时，由nsp5和nsp2组成的病毒质在胞质中形成，保护轮状病毒正义rna免受sirna诱导的降解。在整个复制过程中，病毒结构蛋白和非结构蛋白协同作用，参与病毒基因复制和病毒颗粒组装的不同阶段。

2、lncrna是一类长度超过200个核苷酸（nt）的非编码rna（non-coding rna，ncrna），由rna聚合酶ii和iii转录，不具备翻译功能，在生物学各个方面发挥着重要的调控作用。由于lncrna作用机制复杂多样，到目前为止，仅有少量的lncrna功能得到解析，特别是病毒研究方面。随着高通量测序技术和生物信息学的发展，越来越多的宿主或病毒编码的lncrna被发现，部分调控病毒感染的lncrna功能的作用模式正在被揭示。lncrna能够通过激活模式识别受体（prr）、表观遗传学，转录和转录后水平调控固有免疫反应，直接抑制病毒感染或者通过刺激抗病毒免疫反应来抑制病毒的进一步侵染。但到目前为止，非编码rna特别是lncrnas在轮状病毒复制和增殖过程中是否发挥调控作用研究还比较少，急需探讨。

技术实现思路

1、本发明的一个目的在于提供了一种lncrnas分子在轮状病毒入胞、复制和增殖过程中是否发挥调控作用。

2、本发明通过分离得到的人轮状病毒野毒株感染宿主细胞后进行全转录测序，发现了一种新的调控轮状病毒增殖的lncrna分子，其核苷酸序列如seq id no.1所示，本发明中将其命名为lncrna-darvr，其在轮状病毒感染的细胞中差异表达。上调该lncrna分子具有抑制轮状病毒增殖功能，对于防治轮状病毒感染引起的腹泻具有重要意义。

3、具体的本发明提供以下技术方案：

4、一种lncrna分子，其核苷酸序列如seq id no. 1所示。

5、进一步的，调控所述lncrna分子表达的产品在控制轮状病毒增殖中的应用。

6、作为一种实施方式，所述产品为上调lncrna分子表达的产品，通过上调lncrna分子表达抑制轮状病毒增殖。

7、作为另一种实施方式，所述产品为下调lncrna分子表达的产品，通过下调lncrna表达促进轮状病毒增殖，更具体的促进轮状病毒增值，可用于构建高表达轮状病毒的细胞模型，用以在检测药物的有效性等应用领域。

8、检测来自待测样品中lncrna水平的试剂在制备用于诊断轮状病毒感染的检测系统中的应用，所述lncrna的核苷酸序列如seq id no. 1所示。

9、lncrna-darvr具有抗病毒作用。轮状病毒感染宿主细胞后，表达水平与轮状病毒感染时间负相关。病毒感染后表达水平相对正常细胞表达水平下调，是病毒为适应宿主细胞做出的免疫逃逸策略。

10、所述的lncrna分子或上调其表达水平的产品在制备用于防治轮状病毒感染引起的腹泻的药物中的应用。

11、本发明还提供了一种检测轮状病毒感染的试剂盒，其包括用于检测来自待测样品中lncrna水平的试剂材料，所述lncrna的核苷酸序列如seq id no. 1所示。

12、进一步的，所述试剂材料包括用于检测来自待测样品中lncrna水平的引物对。

13、优选的，所述引物对序列如seq id no. 2～3所示。

14、本发明达到的技术效果：

15、本发明采用分离的野生型轮状病毒ztr-68株感染ma104细胞后做全转录组测序分析，发现了全新的lncrna分子命名为lncrna-darvr，核苷酸序列如seq id no. 1所示。经过体外和体内动物模型检测，发现该lncrna在病毒感染后出现下调，体外过表达lncrna-darvr能够明显抑制病毒的复制。

16、本发明提出了一种具有抑制轮状病毒增殖功能的宿主lncrna，对于防治轮状病毒感染引起的腹泻具有重要意义。

技术特征：

1.一种lncrna分子，其核苷酸序列如seq id no. 1所示。

2.调控权利要求1所述lncrna分子表达的产品在控制轮状病毒增殖中的应用。

3.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，所述产品为上调lncrna分子表达的产品，通过上调lncrna分子表达抑制轮状病毒增殖。

4.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，所述产品为下调lncrna分子表达的产品，通过下调lncrna表达促进轮状病毒增殖。

5.检测来自待测样品中lncrna水平的试剂在制备用于诊断轮状病毒感染的检测系统中的应用，其中，所述lncrna的核苷酸序列如seq id no. 1所示。

6.根据权利要求5所述的应用，其特征在于，lncrna表达水平与轮状病毒感染时间负相关。

7.权利要求1所述的lncrna分子或上调其表达水平的产品在制备用于防治轮状病毒感染引起的腹泻的药物中的应用。

8.一种检测轮状病毒感染的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒包括用于检测来自待测样品中lncrna水平的试剂材料，所述lncrna的核苷酸序列如seq id no. 1所示。

9.根据权利要求8所述的试剂盒，其特征在于，所述试剂材料包括用于检测来自待测样品中lncrna水平的引物对。

10.根据权利要求9所述的试剂盒，其特征在于，所述引物对序列如seq id no. 2～3所示。

技术总结本发明属于生物医药技术领域，具体公开一种lncRNA分子及其在抗轮状病毒复制中的应用，本发明公开的一种lncRNA分子，其核苷酸序列如SEQ ID No.1所示，经过体外和体内动物模型检测，发现该lncRNA分子在轮状病毒感染后出现下调，上调lncRNA‑DARVR能够明显抑制轮状病毒的复制。技术研发人员：李鸿钧,周艳,宋晓鹏,陈蓉,胡晓青,吴晋元受保护的技术使用者：中国医学科学院医学生物学研究所技术研发日：技术公布日：2024/6/18