一种用于广谱稻瘟病抗性基因完全连锁的分子标记

本发明涉及生物工程，尤其涉及一种用于广谱稻瘟病抗性基因完全连锁的分子标记。

背景技术：

1、稻瘟病是水稻产业中最普遍、最具毁灭性的病害。稻田在受稻瘟病危害的情况下一般会减产10％-50％，严重的可能导致绝收。在亚洲和非洲的许多水稻种植国，稻瘟病已经成为影响稻米生产稳定和粮食安全的主要因素。近年来随着全球变暖导致的气温和平均降水量的增加，稻瘟病有越来越严重的趋势。我国的稻瘟病也时常发生局部或者全国性的大流行，平均每年危害面积高达4,000-6,000万亩，引起的稻谷损失高达200-300万吨；2014年和2015年全国稻瘟病发病面积均达到500万公顷，2016年的受害面积也达到了387万公顷。因此开展稻瘟病抗性相关研究对保障我国粮食安全具有重要意义。

2、稻瘟病菌具有多样性和易变性。常规育种方法是以表型鉴定和选择为基础的，育成的水稻品种往往只带有个别的主效基因，而主效抗性基因有小种的专一性，当这些品种大面积、长时间种植，一旦遇到新的致病小种，或在大的选择压力下，稻瘟病菌致病性产生变异时，其抗病性即会丧失。因此，目前大部分抗病品种大面积推广应用2-3年后即开始感病。如我国高抗稻瘟病品种“窄叶青8号”推广不到3年便开始感病；黑龙江省育成的优质抗病品种“空育131”于2002年在该省开始大面积种植，2004年在一些地区开始出现不同程度的发病，2005年全面发病，造成巨大的经济损失。可见，现代水稻品种稻瘟病抗性周期短是水稻生产中普遍、而又突出的问题，延长水稻品种的稻瘟病抗性周期已成为各水稻生产国水稻改良中需要优先解决的问题。

3、分子标记辅助选择是利用与目标性状基因密切关联或共分离的分子标记筛选群体，从而加速目标基因的转移和利用，提高育种过程中性状选择的效率和准确性。利用分子标记辅助选择能显著提高育种效率。

4、ptr是已知的一个广谱稻瘟病抗性基因，但是尚未发现简单易用的分子标记。开发ptr基因完全连锁的分子标记，对鉴定水稻广谱稻瘟病抗性具有重要意义。

技术实现思路

1、1.要解决的技术问题

2、本发明的目的是为了解决现有技术中尚未发现简单易用广谱稻瘟病抗性基因分子标记的问题，而提出的一种用于广谱稻瘟病抗性基因完全连锁的分子标记。

3、2.技术方案

4、为了实现上述目的，本发明采用了如下技术方案：

5、一种用于广谱稻瘟病抗性基因完全连锁的分子标记，该分子标记包括1对广谱稻瘟病抗性ptr完全连锁基因的pcr标记引物：gttgagcactttgctggtga和gcaacttacaggcatgcaga。

6、本发明中还提出了分子标记在广谱稻瘟病抗性ptr完全连锁基因中的应用。

7、本发明中还提出了分子标记在广谱稻瘟病抗性中的应用。

8、本发明中还提出了一种用于广谱稻瘟病抗性基因完全连锁的分子标记的分析方法，包括以下步骤：

9、s1：合成引物：将设好的引物序列，应用dna合成仪合成设计好的引物；

10、s2：dna提取和pcr扩增：利用设计的引物和提取的dna模板，选择反应条件和反应体系进行pcr；

11、s3：扩增产物的检测：pcr扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳；

12、s4：数据的采集与分析：在凝胶成像系统中，溴化乙锭(eb)染液以显示扩增条带，将条带进行统计，用于数据分析。

13、3.有益效果

14、相比于现有技术，本发明的优点在于：

15、本发明中，通过pcr标记引物的设计，可以开发出ptr基因完全连锁的分子标记，且分子标记有效提高了育种过程中性状选择的效率和准确性，利用分子标记辅助选择能显著提高育种效。

技术特征：

1.一种用于广谱稻瘟病抗性基因完全连锁的分子标记，其特征在于，该分子标记包括1对广谱稻瘟病抗性ptr完全连锁基因的pcr标记引物：gttgagcactttgctggtga和gcaacttacaggcatgcaga。

2.根据权利要求1所述的一种用于广谱稻瘟病抗性基因完全连锁的分子标记，其特征在于，所述分子标记在广谱稻瘟病抗性ptr完全连锁基因中的应用。

3.根据权利要求2所述分子标记的应用，其特征在于，所述分子标记在广谱稻瘟病抗性中的应用。

4.根据权利要求1所述的一种用于广谱稻瘟病抗性基因完全连锁的分子标记的分析方法，其特征在于，包括以下步骤：

技术总结本发明公开了一种用于广谱稻瘟病抗性基因完全连锁的分子标记，该分子标记包括1对广谱稻瘟病抗性ptr完全连锁基因的PCR标记引物：GTTGAGCACTTTGCTGGTGA和GCAACTTACAGGCATGCAGA；分析方法包括以下步骤：S1：合成引物：将设好的引物序列，应用DNA合成仪合成设计好的引物；S2：DNA提取和PCR扩增：利用设计的引物和提取的DNA模板；S3：扩增产物的检测；S4：数据的采集与分析。本发明通过PCR标记引物的设计，可以开发出ptr基因完全连锁的分子标记，且分子标记有效提高了育种过程中性状选择的效率和准确性，利用分子标记辅助选择能显著提高育种效。技术研发人员：王健,李丛,胡海飞,赵均良受保护的技术使用者：广东省农业科学院水稻研究所技术研发日：技术公布日：2024/9/9