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一种SNP标志物在辅助诊断前列腺癌的应用

  • 国知局
  • 2024-06-20 11:33:05

本申请涉及生物标志物领域,尤其涉及一种snp标志物在辅助诊断前列腺癌的应用。

背景技术:

1、前列腺癌是世界范围内男性最常见的肿瘤之一,在男性实体恶性肿瘤中发病率排第二位,每年约有超过141万新增病例和37.5万新增死亡病例。由于早期筛查和诊断技术的限制,前列腺癌患者在确诊时,约54%患者确诊前列腺癌时即伴有转移。相比于局限性前列腺癌,转移性前列腺癌的5年相对生存率从97.5%降至30.6%,因此,如能更为精准的针对前列腺癌的高危个体开展筛查和早期诊断,则可以使患者的接受度更高,且能节省大量的医疗支出。

2、表观遗传调控与肿瘤发生发展的关系已成为当今肿瘤研究领域的热点。其中,现有研究表明dna甲基化、组蛋白修饰、核小体重塑和rna介导的靶向调控等调控模式构成了肿瘤表观遗传调控的基础,而增强子作为表观遗传调控重要组分之一,其在肿瘤进展中发挥重要作用。目前已有研究表明,增强子与靶基因启动子区之间存在有交互作用,并且能够激活启动子进而调控靶基因转录,因此当基因增强子区dna存在遗传变异,则会显著改变增强子-启动子交互作用,调控靶基因表达从而影响肿瘤的发生及易感性。

3、虽然目前针对前列腺癌的早期筛查和诊断的snp标志物较多且多种多样,但是针对与前列腺癌基因的增强子区相关的基因位点作为snp标志物的方向,目前仍然是空白;因此如何提供一种snp标志物,以填补与前列腺癌基因的增强子区相关的基因位点作为早期筛查和诊断前列腺癌的snp标志物的空白。

技术实现思路

1、本申请提供了一种snp标志物在辅助诊断前列腺癌的应用,以填补与前列腺癌基因的增强子区相关的基因位点作为早期筛查和诊断前列腺癌的snp标志物的空白。

2、第一方面,本申请提供了一种snp标志物在制备辅助诊断前列腺癌的试剂中的应用,所述snp标志物位于基因ncoa4的增强子区的遗传变异snp位点上,所述snp标志物为rs7077830的组合。

3、可选的,所述试剂包括用于扩增所述snp标志物的扩增引物。

4、可选的,所述扩增引物包括第一扩增引物,所述第一扩增引物的核苷酸序列如seqid no:1所示。

5、可选的,所述扩增引物包括第二扩增引物,所述第二扩增引物的核苷酸序列如seqid no:2所示。

6、可选的,所述试剂还包括用于检测所述snp标志物的引物探针。

7、可选的,所述引物探针包括第一引物探针,所述第一引物探针的核苷酸序列如seqid no:3所示。

8、可选的,所述探针包括第二引物探针,所述第二引物探针的核苷酸序列如seq idno:4所示。

9、第二方面,本申请还提供一种辅助诊断前列腺癌的试剂盒,所述试剂盒包括snp标志物,所述snp标志为rs7077830的组合。

10、可选的,所述试剂盒包括第一扩增引物和第二扩增引物,所述第一扩增引物的核苷酸序列如seq id no:1所示,所述第二扩增引物的核苷酸序列如seq id no:2所示。

11、可选的,所述试剂盒还包括第一引物探针和第二引物探针,所述第一引物探针的核苷酸序列如seq id no:3所示,所述第二引物探针的核苷酸序列如seq id no:4所示。

12、本申请实施例提供的上述技术方案与现有技术相比具有如下优点:

13、本申请实施例提供的一种snp标志物在制备辅助诊断前列腺癌的试剂中的应用,通过对前列腺基因ncoa4的增强子区的遗传变异snp位点筛选,确定snp位点中的rs7077830通过影响ncoa4的增强子-启动子交互作用,从而使得携带有rs7077830的人群为易感前列腺癌的人群,进而确定通过对rs7077830的检测就能实现对前列腺癌的早期筛查和检测,从而填补了与前列腺癌基因的增强子区相关的基因位点作为早期筛查和诊断前列腺癌的snp标志物的空白。

技术特征:

1.一种snp标志物在制备辅助诊断前列腺癌的试剂中的应用,其特征在于,所述snp标志物位于基因ncoa4的增强子区的遗传变异snp位点上,所述snp标志物为rs7077830的组合。

2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述试剂包括用于扩增所述snp标志物的扩增引物。

3.根据权利要求2所述的应用,其特征在于,所述扩增引物包括第一扩增引物,所述第一扩增引物的核苷酸序列如seq id no:1所示。

4.根据权利要求2所述的应用,其特征在于,所述扩增引物包括第二扩增引物,所述第二扩增引物的核苷酸序列如seq id no:2所示。

5.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述试剂还包括用于检测所述snp标志物的引物探针。

6.根据权利要求5所述的应用,其特征在于,所述引物探针包括第一引物探针,所述第一引物探针的核苷酸序列如seq id no:3所示。

7.根据权利要求5所述的应用,其特征在于,所述探针包括第二引物探针,所述第二引物探针的核苷酸序列如seq id no:4所示。

8.一种辅助诊断前列腺癌的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括snp标志物,所述snp标志物为rs7077830的组合。

9.根据权利要求8所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括第一扩增引物和第二扩增引物,所述第一扩增引物的核苷酸序列如seq id no:1所示,所述第二扩增引物的核苷酸序列如seq id no:2所示。

10.根据权利要求8所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括第一引物探针和第二引物探针,所述第一引物探针的核苷酸序列如seq id no:3所示,所述第二引物探针的核苷酸序列如seq id no:4所示。

技术总结本申请涉及生物标志物领域,尤其涉及一种SNP标志物在辅助诊断前列腺癌的应用;所述SNP标志物位于基因NCOA4的增强子区的遗传变异SNP位点上,所述SNP标志物为rs7077830的组合;通过对前列腺基因NCOA4的增强子区的遗传变异SNP位点筛选,确定SNP位点中的rs7077830通过影响NCOA4的增强子‑启动子交互作用,从而使得携带有rs7077830的人群为易感前列腺癌的人群,进而确定通过对rs7077830的检测就能实现对前列腺癌的早期筛查和检测,从而填补了与前列腺癌基因的增强子区相关的基因位点作为早期筛查和诊断前列腺癌的SNP标志物的空白。技术研发人员:王晶,葛越,王志华,马晟,熊泽众,李乐,晁正,王亚楠,张春雨,郭相东,张俊彪,李腾飞,周强,郝晓东,张泽宇受保护的技术使用者:华中科技大学同济医学院附属同济医院技术研发日:技术公布日:2024/6/18

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