一种与薏苡开花期显著关联的分子标记及其应用

本发明涉及生物，具体涉及一种与薏苡开花期显著关联的分子标记及其应用。

背景技术：

1、薏苡(coix lacryma-jobi l.)又名薏仁米，是我国特色的药食同源杂粮。然而，我国目前主要种植的薏苡品种开花期晚，生育期长。因此，利用开花期分子标记辅助选择早开花、早熟品系，将加快薏苡新品种培育进度。

技术实现思路

1、本发明的目的在于提供一种与薏苡开花期显著关联的分子标记及其应用。

2、为了达到上述发明目的，本发明采用的技术方案为：

3、第一方面，提供一种与薏苡开花期显著关联的分子标记，其核苷酸序列如seq idno.1所示。

4、进一步地，其pcr扩增引物序列为：

5、上游引物：tccctagctagctcctcgat，

6、下游引物：agggaagacggagaacgagg。

7、进一步地，薏苡开花期主效qtl位于10号假染色体的snp3999和snp2296之间，物理位置1912742bp处。

8、第二方面，提供一种与薏苡开花期显著关联的分子标记的应用，该分子标记基因型为纯合型插入和杂合型插入时，薏苡开花期早，基因型为纯合型缺失时，薏苡开花期晚。

9、本发明的有益效果为：

10、本发明涉及一个与薏苡开花期显著关联的插入-缺失(insertion-deletion，idnel)分子标记，该分子标记基因型为纯合型插入和杂合型插入时，薏苡开花期早，基因型为纯合型缺失时，薏苡开花期晚。因此可用于辅助选择开花早的薏苡品系。

技术特征：

1.一种与薏苡开花期显著关联的分子标记，其特征在于，其核苷酸序列如seq id no.1所示。

2.根据权利要求1所述的与薏苡开花期显著关联的分子标记，其特征在于，其pcr扩增引物序列为：

3.根据权利要求1所述的与薏苡开花期显著关联的分子标记，其特征在于，薏苡开花期主效qtl位于10号假染色体的snp3999和snp2296之间，物理位置1912742bp处。

4.一种权利要求1-3任一所述的与薏苡开花期显著关联的分子标记的应用，其特征在于，该分子标记基因型为纯合型插入和杂合型插入时，薏苡开花期早，基因型为纯合型缺失时，薏苡开花期晚。

技术总结本发明涉及生物技术领域，具体涉及一种与薏苡开花期显著关联的分子标记及其应用。其中与薏苡开花期显著关联的分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。本发明涉及一个与薏苡开花期显著关联的插入‑缺失(Insertion‑deletion，Idnel)分子标记，该分子标记基因型为纯合型插入和杂合型插入时，薏苡开花期早，基因型为纯合型缺失时，薏苡开花期晚。因此可用于辅助选择开花早的薏苡品系。技术研发人员：郭超,鲍杰良,周树峰,李祥栋,袁一冰,王雅南,闫翔受保护的技术使用者：四川农业大学技术研发日：技术公布日：2024/9/2