影响藏绵羊抗氧化应激能力的SNP标记及其应用

本发明涉及分子生物学检测，尤其涉及影响藏绵羊抗氧化应激能力的snp标记及其应用。

背景技术：

1、藏绵羊是青藏高原高寒牧区草原畜牧业的重要组成部分。青藏高原地区的特点为：海拔高、气压低、紫外线强、缺氧等。由于青藏高原地区环境恶劣，会引起藏绵羊的一系列非特异性反应，主要为免疫应激、冷应激与氧化应激，其中主要为氧化应激。

2、抗氧化系统是应对氧化应激状态的主要手段。抗氧化系统由一系列抗氧化酶和非酶抗氧化剂组成，包括超氧化物歧化酶(sod)、过氧化氢酶(cat)、谷胱甘肽还原酶(gr)、谷胱甘肽-s转移酶(gst)、谷胱甘肽过氧化物酶(gpx)和维生素c(vc)等。当生物体受到氧化胁迫时产生大量的活性氧自由基(ros)，机体通过调节抗氧化系统来抵御ros带来的氧化损伤，通过清除体内多余的ros维持正常的生理和生命活动。环境胁迫会引发藏绵羊内ros的产生，损害机体细胞和组织正常的生理机能和免疫防御能力，导致机体氧化应激或损伤

3、no、t-aoc是检测氧化应激反应中的重要指标，上述指标可以评估藏绵羊的氧化应激能力和健康状况。通过检测抗氧化应激的指标，能及时发现藏绵羊的氧化应激反应能力，并采取一定的措施来提高其氧化应激能力，使其更好的适应青藏高原恶劣的环境条件，为藏绵羊的辅助育种提供依据。

4、分子标记是以个体间遗传物质内核苷酸序列变异为基础的遗传标记，是dna水平遗传多态性的直接的反映。分子标记技术可从基因层面寻找基因中的变异位点，通过其与性状间的关联分析发现基因与性状间的关系，进行早期选择，从而提高选种效率和准确性，可以从根本上提高藏绵羊的氧化应激能力，具有广阔的应用价值。

5、因此，分子标记为人们在分子水平研究藏绵羊的氧化应激能力的遗传机理奠定了基础，筛选相应的分子标记以便于更高效的用于藏绵羊的育种中，是本领域的一个重要问题。现有技术中研究与藏绵羊氧化应激能力相关的分子标记进行辅助育种的并不多。提供一种与藏绵羊氧化应激能力相关的分子标记，从而用于藏绵羊分子标记辅助育种中，筛选抗氧化应激能力强的藏绵羊，显得尤为重要。

技术实现思路

1、本发明的目的在于提供影响藏绵羊抗氧化应激能力的snp标记及其应用。

2、为了实现上述发明目的，本发明提供以下技术方案：

3、本发明提供了一种与藏绵羊氧化应激能力有关的snp分子标记，所述snp分子标记位于国际绵羊基因组oar_v4.0版本第15号染色体上第72590068个碱基处，突变碱基为c或g。

4、优选的，突变碱基为c的藏绵羊的基因型为cc或gc；

5、突变碱基为g的藏绵羊的基因型为gg；

6、所述gg和cg基因型的藏绵羊个体的抗氧化应激指标no、t-aoc显著高于cc基因型个体；

7、所示gg和cg基因型的藏绵羊个体的抗氧化应激指标no、t-aoc差异不显著。

8、本发明还提供了所述的snp分子标记用于非诊断目的的藏绵羊抗氧化应激性状标记辅助选择中的应用。

9、本发明还提供了所述的snp分子标记在藏绵羊辅助育种中的应用。

10、本发明还提供了扩增所述的snp的引物对，所述引物对如seq id no.2～3所示。

11、本发明还提供了所述的引物对在制备非诊断目的的藏绵羊抗氧化应激性状标记辅助选择的产品中的应用。

12、本发明还提供了所述的引物对在制备藏绵羊辅助育种的产品中的应用。

13、本发明还提供了一种非诊断目的的藏绵羊抗氧化应激性状标记辅助选择的方法，包括如下步骤：

14、(1)提取藏绵羊基因组dna；

15、(2)以步骤(1)得到的藏绵羊基因组dna为模板，利用所述的引物对进行扩增，得到扩增产物；

16、(3)对所述的扩增产物进行基因型分析，得到不同基因型的藏绵羊；将藏绵羊的基因型与抗氧化应激指标关联；

17、所述抗氧化应激指标包括no和/或t-aoc。

18、优选的，步骤(2)所述的扩增的体系为：金牌mix(green)22μl，上、下游引物各1μl，模板dna 1μl；

19、步骤(2)所述的扩增的程序为：98℃2min；98℃10s，56℃10s，72℃10s，共40个循环；72℃延伸2min。

20、本发明还提供了一种非诊断目的的藏绵羊抗氧化应激性状标记辅助选择和/或藏绵羊辅助育种的试剂盒，包括检测所述的snp分子标记的试剂或所述的引物对。

21、与现有技术相比，本发明具有如下的有益效果：

22、本发明提供了影响藏绵羊抗氧化应激能力的snp标记及其应用。本发明所述的snp分子标记位于国际绵羊参考基因组oar_v4.0版本第15号染色体上第72590068个碱基处；变异类型为c/g，命名为g72590068c>g，存在三个基因型，当所述的第15号染色体上第72590068个碱基为c时，基因型为cc或gc；当所述的第15号染色体上第72590068个碱基为g时，基因型为gg。通过不同基因型与抗氧化应激指标no、t-aoc含量的关联分析，发现所述gg和cg基因型的藏绵羊个体的抗氧化应激指标no、t-aoc显著高于cc基因型个体(p<0.05)；gg和cg基因型的藏绵羊个体的抗氧化应激指标no、t-aoc差异不显著(p>0.05)。通过检测藏绵羊第15号染色体上第72590068个核苷酸位点的碱基，能够判断藏绵羊个体的抗氧化应激指标no、t-aoc含量，本发明为用于非诊断目的的藏绵羊抗氧化应激性状标记辅助选择提供了新的snp分子标记资源。

技术特征：

1.一种与藏绵羊氧化应激能力有关的snp分子标记，其特征在于，所述snp分子标记位于国际绵羊基因组oar_v4.0版本第15号染色体上第72590068个碱基处，突变碱基为c或g。

2.根据权利要求1所述的snp分子标记，其特征在于，突变碱基为c的藏绵羊的基因型为cc或gc；

3.权利要求1或2所述的snp分子标记用于非诊断目的的藏绵羊抗氧化应激性状标记辅助选择中的应用。

4.权利要求1或2所述的snp分子标记在藏绵羊辅助育种中的应用。

5.扩增权利要求1或2所述的snp的引物对，其特征在于，所述引物对如seq id no.2～3所示。

6.权利要求5所述的引物对在制备非诊断目的的藏绵羊抗氧化应激性状标记辅助选择的产品中的应用。

7.权利要求5所述的引物对在制备藏绵羊辅助育种的产品中的应用。

8.一种非诊断目的的藏绵羊抗氧化应激性状标记辅助选择的方法，其特征在于，包括如下步骤：

9.根据权利要求8所述的方法，其特征在于，步骤(2)所述的扩增的体系为：金牌mix(green)22μl，上、下游引物各1μl，模板dna 1μl；

10.一种非诊断目的的藏绵羊抗氧化应激性状标记辅助选择和/或藏绵羊辅助育种的试剂盒，其特征在于，包括检测权利要求1或2所述的snp分子标记的试剂或权利要求5所述的引物对。

技术总结本发明涉及分子生物学检测技术领域，尤其涉及影响藏绵羊抗氧化应激能力的SNP标记及其应用。一种与藏绵羊氧化应激能力有关的SNP分子标记，所述SNP分子标记位于国际绵羊基因组Oar_v4.0版本第15号染色体上第72590068个碱基处，突变碱基为C或G。本发明通过检测藏绵羊第15号染色体上第72590068个核苷酸位点的碱基，能够判断藏绵羊个体的抗氧化应激指标NO、T‑AOC含量，本发明为用于非诊断目的的藏绵羊抗氧化应激性状标记辅助选择提供了新的SNP分子标记资源。技术研发人员：卢曾奎,袁超,刘建斌,郭婷婷,安雪姣受保护的技术使用者：中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所技术研发日：技术公布日：2024/11/4