一种用于川崎病风险预测的miRNA标志物组合及其应用的制作方法
- 国知局
- 2024-11-06 14:41:48
本发明涉及生物检测,具体而言,涉及一种用于川崎病风险预测的mirna标志物组合及其应用。
背景技术:
1、mirna(microrna)微小核糖核酸是一类重要的内源性非编码rna,长度约为22个核苷酸的小分子单链rna,主要通过与mrna相互作用参与转录后基因表达的调控。mirna在各种生物的调控机制中发挥着重要作用,包括细胞生长、发育、分化和凋亡。它们与许多疾病相关,由于mirna是基因表达的重要调节因子和生物标志物开发的有前景的候选分子,因此对mirna的研究在疾病风险预测、治疗和预后中的应用日益广泛。
2、川崎病(kawasaki disease)又称粘膜皮肤淋巴结综合征,一种以全身血管炎为主要病变的急性发热出疹性小儿疾病,该病由1967年日本川崎富作医师首先报道,并以他的名字命名的疾病。常见于婴幼儿,亦见于学龄儿童,男多于女。主要临床症状表现为发热、皮疹、颈部非脓性淋巴结肿大、眼结合膜充血、口腔黏膜弥漫充血、杨梅舌、掌跖红斑、手足硬性水肿等,对于川崎病具体病因尚不明确。大约15-25%的川崎病如果治疗不当,儿童可能会出现冠状动脉异常,被证明是儿童获得性心脏病的主要原因,并增加心肌梗死的风险。虽然目前对川崎病的临床诊断方法和标准已有系统的研究,但是川崎病目前没有特异性的实验检测方法和标志物,目前主要根据临床症状结合实验室生化指标检测和影像学检查作为诊断手段,而目前结合临床症状的诊断方法在时效性、准确性方便欠佳,易导致早期川崎病与其他发热疾病混淆而产生误诊,错过最佳的治疗时机,对患儿造成不可逆的冠状动脉损伤。且目前尚未发现川崎病特异性的标志物,也尚未有川崎病特异性实验诊断方法。因此开发川崎病早期特异性生物标志物和检测方法对于川崎病的诊断和治疗具有重要的意义。
3、鉴于此,特提出本发明。
技术实现思路
1、本发明的目的在于提供一种用于川崎病风险预测的mirna标志物组合及其应用,通过该mirna标志物组合进行川崎病风险预测,其具有检测快速准确、稳定性高、重复性佳、检测成本低等优点,能够快速准确地区分川崎病和其他发热性疾病(肺炎、甲流、胃肠炎、荨麻疹、疱疹病毒感染)。
2、本发明是这样实现的:
3、第一方面,本发明提供了检测样本中mirna标志物组合的试剂在制备用于川崎病风险预测的产品中的应用,该mirna标志物组合包括:let-7g-5p、mir-3182、mir-186-5p、mir-27a-3p、mir-140-3p和mir-199a-3p。
4、第二方面,本发明提供了检测样本中mirna标志物组合的试剂在制备用于川崎病风险预测的产品中的应用,该mirna标志物组合包括:let-7g-5p、mir-140-3p和mir-199a-3p。
5、第三方面,本发明提供了一种用于川崎病风险预测的试剂盒,其包括检测mirna标志物组合的表达量的试剂;其中,试剂包括用于检测mirna标志物组合的引物和/或探针;引物包括根据每个生物标志物设计的反转录引物、荧光定量反应的上游引物和下游引物。
6、第四方面,本发明提供了一种川崎病风险预测模型的训练方法,其包括:获取训练样本中的mirna标志物组合中每个生物标志物的表达水平的检测结果及其对应的标注结果;其中,标注结果为代表样本川崎病风险的标签,mirna标志物组合为前述mirna标志物组合;将检测结果输入预先构建的预测模型中,获得预测结果;其中,预测模型为能根据上述mirna标志物组合的表达水平预测样本是否有川崎病风险的机器学习模型;基于标注结果和预测结果对预测模型进行参数更新。
7、第五方面,本发明提供了一种川崎病风险的预测装置,其包括数据获取模块和预测模块。数据获取模块用于获取待测受试者样本中的生物标志物的表达量的检测结果;预测模块用于将数据获取模块得到的检测结果作为输入数据提供给川崎病风险预测模型中,获得待测样本的预测结果。
8、第六方面,本发明提供了一种电子设备,其包括:处理器和存储器;存储器用于存储程序,当程序被处理器执行时,使得处理器实现川崎病风险预测模型的训练方法或川崎病的风险预测;川崎病的风险预测包括:获取待测样本的mirna标志物组合的表达量的检测结果,其中,mirna标志物组合为上述mirna标志物组合;将mirna标志物组合的表达量的检测结果输入训练方法获得的预测模型中,获得待测样本的预测结果。
9、第七方面,本发明提供了一种计算机可读介质,该计算机可读介质上存储有计算机程序,计算机程序被处理器执行时实现如川崎病风险预测模型的训练方法或川崎病风险的预测。
10、本发明具有以下有益效果:
11、(1)本发明提供了具有较佳预测价值的mirna标志物组合,该组合能够用于构建川崎病风险预测模型,通过预测模型能够对川崎病进行有效预测,可作为临床川崎病的辅助诊断手段;
12、(2)本发明中的mirna标志物组合是通过采用了独特结构的茎环引物和荧光探针法筛选获得的,具有宽广的线性范围,相较于染料荧光法和传统的生化蛋白的检测方法具有更高的灵敏度和特异性;
13、(3)利用本发明提供的川崎病风险预测模型对川崎病进行检测,具有检测成本低,检测快速准确,稳定性和重复性好,能快速准确地区分川崎病和其他发热性疾病(肺炎、甲流、胃肠炎、荨麻疹、疱疹病毒感染),提高了川崎病风险预测准确性,对于川崎病快速诊断方法和检测试剂盒的开发具有重要的临床价值。
技术特征:1.检测样本中mirna标志物组合的试剂在制备用于川崎病风险预测的产品中的应用,其特征在于,所述mirna标志物组合包括:let-7g-5p、mir-3182、mir-186-5p、mir-27a-3p、mir-140-3p和mir-199a-3p。
2.检测样本中mirna标志物组合的试剂在制备用于川崎病风险预测的产品中的应用,其特征在于,所述mirna标志物组合包括:let-7g-5p、mir-140-3p和mir-199a-3p。
3.一种用于川崎病风险预测的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括检测权利要求1或2中所述mirna标志物组合的表达量的试剂;
4.根据权利要求3所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒通过rt-pcr、实时定量pcr、免疫检测、原位杂交、芯片和高通量测序平台检测所述生物标志物表达量。
5.根据权利要求3所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒的检测样本包括体液样本、细胞样本或组织样本;
6.一种川崎病风险预测模型的训练方法,其特征在于,其包括:
7.根据权利要求6所述的训练方法,其特征在于,所述机器学习模型包括逻辑回归模型、随机森林模型、贝叶斯模型、支持向量机、决策树模型、神经网络模型模型中的任意一种;
8.一种川崎病风险的预测装置,其特征在于,包括:
9.一种电子设备,其特征在于,其包括:处理器和存储器;
10.一种计算机可读介质,其特征在于,所述计算机可读介质上存储有计算机程序,所述计算机程序被处理器执行时实现如权利要求6或7所述的川崎病风险预测模型的训练方法或如权利要求9所述的川崎病风险的预测。
技术总结本发明公开了一种用于川崎病风险预测的miRNA标志物组合及其应用,其中,miRNA标志物组合包括let‑7g‑5p、miR‑3182、miR‑186‑5p、miR‑27a‑3p、miR‑140‑3p和miR‑199a‑3p。通过该miRNA标志物组合进行川崎病风险预测,其具有检测快速准确、稳定性高、重复性佳、检测成本低等优点,能够快速准确地区分川崎病和其他发热性疾病(肺炎、甲流、胃肠炎、荨麻疹、疱疹病毒感染),提高了川崎病风险预测准确性,对于川崎病快速诊断方法和检测试剂盒的开发具有重要的临床价值。技术研发人员:刘佳,李仕铭,徐雁冰,李光,丁国徽受保护的技术使用者:道之精准医学科技(上海)有限公司技术研发日:技术公布日:2024/11/4本文地址:https://www.jishuxx.com/zhuanli/20241106/323605.html
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