一种牛DDX58基因的单碱基/氨基酸突变在抗结核病中的应用

本发明涉及牛结核病防治，尤其是涉及一种牛ddx58基因的单碱基/氨基酸突变在抗结核病中的应用。

背景技术：

1、牛结核病(bovine tuberculosis，btb)是一种主要由牛分支杆菌(mycobacterium bovis，m.bovis)引起的慢性消耗性人兽共患传染病。除牛外，其他多种家畜和野生动物以及人均可感染牛分支杆菌。牛结核病的流行不仅给我国畜牧业带来了严重的经济损失，也严重威胁人类的公共卫生健康。发掘牛抗结核基因编辑位点、培育基因编辑抗结核牛正在成为未来牛抗结核防控的主要研究方向。

2、结核分支杆菌侵入机体后被巨噬细胞吞噬，通过自身esx1分泌系统释放自身mrna到胞质中，被ddx58受体识别；ddx58识别细胞质病原体rna后可以激活下游信号级联反应，导致i型干扰素(ifnb1)和促炎细胞因子的产生。

技术实现思路

1、本发明的目的是提供一种牛ddx58基因的单碱基/氨基酸突变在抗结核病中的应用，以提供一个与牛抗结核病关系密切的单碱基和氨基酸位点，为牛结核病的有效防控、培育抗结核病牛贡献力量。

2、为实现上述目的，本发明提供一种牛ddx58基因的单碱基突变在抗结核病中的应用，所述牛ddx58基因的cds序列如seq id no.1所示，氨基酸序列如seq id no.2所示，所述单碱基突变位于牛基因组ars-ucd1.2版本参考序列8号染色体上5′端起第11603839个核苷酸。

3、优选的，所述单碱基突变为错义突变，由g突变为a。

4、优选的，所述单碱基突变导致牛ddx58蛋白第858位氨基酸的突变。

5、优选的，所述单碱基突变导致牛ddx58蛋白第858位氨基酸发生突变，由丝氨酸突变为天冬酰胺。

6、优选的，所述应用为在影响下游i型干扰素的产生，促进巨噬细胞对结核分枝杆菌清除作用中的应用。

7、一种牛ddx58基因的单氨基酸改变在抗结核病中的应用，所述单氨基改变为牛ddx58蛋白第858位氨基酸由丝氨酸突变为天冬酰胺。

8、如上所述单碱基突变、单氨基酸突变在制备抗结核病制剂中的应用。

9、如上所述单碱基突变、单氨基酸突变在牛抗结核病品种选育中的应用。

10、如上所述单碱基突变、单氨基酸突变在制备促进巨噬细胞对结核分枝杆菌的清除作用制剂中的应用。

11、包含上述单碱基突变或单氨基酸突变的载体和宿主菌。

12、本发明提供了一个与抗牛结核病能力相关性较高的牛ddx58基因单核苷酸错义突变，此位点对应于牛基因组ars-ucd1.2版本参考序列8号染色体上从5′端起的第11603839个核苷酸，普通牛为g、瘤牛为a；此突变为错义突变，对应编码氨基酸位于ddx58蛋白第858位；普通牛为丝氨酸，瘤牛为天冬酰胺。本发明提供的牛ddx58基因的单碱基突变能够通过磷酸化调控影响ddx58蛋白的活性，从而影响ddx58下游固有免疫通路的激活，使i型干扰素表达量产生差异，进而影响牛的抗结核能力。

13、因此，本发明提供的一种牛ddx58基因的单碱基/氨基酸突变在抗结核病中的应用，其具体技术效果如下：

14、(1)本发明提供的牛ddx58基因的单碱基突变对i型干扰素的生成量以及巨噬细胞对结核分枝杆菌的清除效果具有显著影响，与牛抗结核病性状高度连锁；

15、(2)本发明提供的牛ddx58基因的单/碱基/氨基酸突变可以作为牛结核病抗性连锁位点，用于牛结核病抗性育种中基因型选育，进而简化选育方法、缩短选育时间。

16、下面通过附图和实施例，对本发明的技术方案做进一步的详细描述。

技术特征：

1.一种牛ddx58基因的单碱基突变在抗结核病中的应用，其特征在于：所述牛ddx58基因的cds序列如seq id no.1所示，氨基酸序列如seq id no.2所示，所述单碱基突变位于牛基因组ars-ucd1.2版本参考序列8号染色体上5′端起第11603839个核苷酸。

2.根据权利要求1所述的一种牛ddx58基因的单碱基突变在抗结核病中的应用，其特征在于：所述单碱基突变为错义突变，由g突变为a。

3.根据权利要求1所述的一种牛ddx58基因的单碱基突变在抗结核病中的应用，其特征在于：所述单碱基突变导致牛ddx58蛋白第858位氨基酸的突变。

4.根据权利要求3所述的一种牛ddx58基因的单碱基突变在抗结核病中的应用，其特征在于：所述单碱基突变导致牛ddx58蛋白第858位氨基酸发生突变，由丝氨酸突变为天冬酰胺。

5.根据权利要求1所述的一种牛ddx58基因的单碱基突变在抗结核病中的应用，其特征在于：所述应用为在影响下游i型干扰素的产生，促进巨噬细胞对结核分枝杆菌清除作用中的应用。

6.一种牛ddx58基因的单氨基酸改变在抗结核病中的应用，其特征在于：所述单氨基改变为牛ddx58蛋白第858位氨基酸由丝氨酸突变为天冬酰胺。

7.如权利要求1所述单碱基突变、权利要求6所述单氨基酸突变在制备抗结核病制剂中的应用。

8.如权利要求1所述单碱基突变、权利要求6所述单氨基酸突变在牛抗结核病品种选育中的应用。

9.如权利要求1所述单碱基突变、权利要求6所述单氨基酸突变在制备促进巨噬细胞对结核分枝杆菌清除作用制剂中的应用。

10.包含权利要求2所述单碱基突变或权利要求6所述单氨基酸突变的载体和宿主菌。

技术总结本发明公开了一种牛DDX58基因的单碱基/氨基酸突变在抗结核病中的应用，属于牛结核病防治技术领域，一种牛DDX58基因的单碱基突变在抗结核病中的应用，所述牛DDX58基因的CDS序列如SEQ ID NO.1所示，氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示，所述单碱基突变位于牛基因组ARS‑UCD1.2版本参考序列8号染色体上5′端起第11603839个核苷酸。本发明提供的牛DDX58基因的单碱基突变对I型干扰素的生成量以及巨噬细胞对结核分枝杆菌的清除效果具有显著影响，与牛抗结核病性状高度连锁；提供的牛DDX58基因的单碱基/氨基酸突变可以作为牛结核病抗性连锁位点，用于牛结核病抗性育种中基因型选育，进而简化选育方法、缩短选育时间。技术研发人员：高元鹏,樊阿娇,李烛南,任刚,张涌受保护的技术使用者：西北农林科技大学技术研发日：技术公布日：2024/9/12